Protein–RNA interactions for Protein: Q5U649

C12orf60, Uncharacterized protein C12orf60, humanhuman

Predictions only

Length 245 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C12orf60Q5U649 CCNG2-204ENST00000502280 1459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
C12orf60Q5U649 GPSM1-201ENST00000291775 2114 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
C12orf60Q5U649 P4HTM-201ENST00000343546 2268 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
C12orf60Q5U649 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
C12orf60Q5U649 RAB28-203ENST00000338176 1787 ntTSL 3 BASIC25.18■■□□□ 1.62
C12orf60Q5U649 TTYH1-203ENST00000376531 1763 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
C12orf60Q5U649 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
C12orf60Q5U649 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
C12orf60Q5U649 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
C12orf60Q5U649 METTL26-203ENST00000397664 604 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
C12orf60Q5U649 AC026185.1-201ENST00000445748 174 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
C12orf60Q5U649 LINC02091-201ENST00000576171 1185 ntTSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
C12orf60Q5U649 HAS1-203ENST00000594621 760 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
C12orf60Q5U649 AKT1S1-206ENST00000391834 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
C12orf60Q5U649 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
C12orf60Q5U649 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
C12orf60Q5U649 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
C12orf60Q5U649 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
C12orf60Q5U649 PHLDB2-210ENST00000478922 1861 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
C12orf60Q5U649 ZNF584-203ENST00000593920 2187 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
C12orf60Q5U649 TYMP-202ENST00000395678 1614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
C12orf60Q5U649 CYB5R4-201ENST00000369679 768 ntTSL 3 BASIC25.17■■□□□ 1.62
C12orf60Q5U649 IL15RA-207ENST00000397250 584 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
C12orf60Q5U649 IL15RA-215ENST00000528354 1037 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
C12orf60Q5U649 HTATIP2-208ENST00000532505 595 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
C12orf60Q5U649 DUX4L16-201ENST00000555130 1264 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
C12orf60Q5U649 IL15RA-220ENST00000620345 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
C12orf60Q5U649 KDF1-201ENST00000320567 1793 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
C12orf60Q5U649 C19orf67-203ENST00000548523 1427 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
C12orf60Q5U649 ANKRD19P-205ENST00000473204 2370 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
C12orf60Q5U649 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
C12orf60Q5U649 YBX1-201ENST00000321358 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
C12orf60Q5U649 ADA-201ENST00000372874 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
C12orf60Q5U649 PUS1-203ENST00000443358 1664 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
C12orf60Q5U649 SGMS1-210ENST00000619438 1680 ntTSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
C12orf60Q5U649 AC092384.1-201ENST00000378347 1812 ntTSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
C12orf60Q5U649 AC242852.2-201ENST00000615738 1807 ntBASIC25.16■■□□□ 1.62
C12orf60Q5U649 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
C12orf60Q5U649 ALKBH7-201ENST00000245812 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
C12orf60Q5U649 TUSC3-203ENST00000503731 1498 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
C12orf60Q5U649 TNFRSF18-201ENST00000328596 851 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
C12orf60Q5U649 MAP1LC3A-202ENST00000374837 961 ntTSL 3 BASIC25.16■■□□□ 1.62
C12orf60Q5U649 NR0B1-202ENST00000378970 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
C12orf60Q5U649 EDA-210ENST00000527388 927 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
C12orf60Q5U649 PML-217ENST00000567543 1404 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
C12orf60Q5U649 KRT7-201ENST00000331817 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
C12orf60Q5U649 NARF-202ENST00000345415 1487 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
C12orf60Q5U649 BX322557.1-202ENST00000400362 1460 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
C12orf60Q5U649 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
C12orf60Q5U649 LMF1-202ENST00000543238 2103 ntTSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
C12orf60Q5U649 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC25.15■■□□□ 1.62
C12orf60Q5U649 FAM99A-202ENST00000538190 1989 ntBASIC25.15■■□□□ 1.62
C12orf60Q5U649 MRAS-202ENST00000423968 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
C12orf60Q5U649 CROCCP5-201ENST00000436658 830 ntBASIC25.15■■□□□ 1.62
C12orf60Q5U649 C11orf24-209ENST00000533310 980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
C12orf60Q5U649 TMEM179B-205ENST00000533861 797 ntTSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
C12orf60Q5U649 BEX2-204ENST00000536889 1077 ntTSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
C12orf60Q5U649 BRI3-207ENST00000539286 699 ntTSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
C12orf60Q5U649 SLC7A5P2-201ENST00000553010 536 ntBASIC25.15■■□□□ 1.62
C12orf60Q5U649 AL845552.2-201ENST00000553301 553 ntTSL 4 BASIC25.15■■□□□ 1.62
C12orf60Q5U649 Z97986.1-201ENST00000565879 476 ntTSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
C12orf60Q5U649 ANAPC11-219ENST00000583839 499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
C12orf60Q5U649 TLX2-201ENST00000233638 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
C12orf60Q5U649 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
C12orf60Q5U649 CDKN1C-204ENST00000440480 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
C12orf60Q5U649 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
C12orf60Q5U649 FAM207A-201ENST00000291634 927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
C12orf60Q5U649 SLC7A5P1-201ENST00000568957 537 ntBASIC25.14■■□□□ 1.62
C12orf60Q5U649 NMRAL1-212ENST00000574425 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
C12orf60Q5U649 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
C12orf60Q5U649 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
C12orf60Q5U649 CHRAC1-203ENST00000519533 1678 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
C12orf60Q5U649 TPD52L1-203ENST00000368402 1308 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
C12orf60Q5U649 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
C12orf60Q5U649 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
C12orf60Q5U649 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
C12orf60Q5U649 DCXR-201ENST00000306869 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
C12orf60Q5U649 MANBAL-202ENST00000373606 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
C12orf60Q5U649 TMEM41B-205ENST00000533723 723 ntTSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
C12orf60Q5U649 TK2-208ENST00000545043 1120 ntTSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
C12orf60Q5U649 F2RL3-202ENST00000599210 613 ntTSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
C12orf60Q5U649 AC012313.6-201ENST00000599889 790 ntTSL 3 BASIC25.13■■□□□ 1.61
C12orf60Q5U649 MDK-213ENST00000617138 635 ntTSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
C12orf60Q5U649 POU5F1-209ENST00000638788 369 ntTSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
C12orf60Q5U649 CXCL16-203ENST00000574412 1668 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
C12orf60Q5U649 NAA35-202ENST00000376040 1797 ntTSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
C12orf60Q5U649 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
C12orf60Q5U649 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
C12orf60Q5U649 SPAST-204ENST00000621856 1715 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
C12orf60Q5U649 MGAT4D-208ENST00000515354 1806 ntTSL 3 BASIC25.12■■□□□ 1.61
C12orf60Q5U649 MXRA8-203ENST00000445648 2001 ntTSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
C12orf60Q5U649 VIM-AS1-202ENST00000605833 918 ntTSL 3 BASIC25.12■■□□□ 1.61
C12orf60Q5U649 CASTOR1-201ENST00000404953 1460 ntTSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
C12orf60Q5U649 AP000547.3-201ENST00000592918 1576 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
C12orf60Q5U649 C16orf59-201ENST00000361837 1662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
C12orf60Q5U649 RARG-204ENST00000543726 1779 ntTSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
C12orf60Q5U649 ANKHD1-205ENST00000394723 2135 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
C12orf60Q5U649 AC010542.4-201ENST00000563151 1910 ntBASIC25.12■■□□□ 1.61
C12orf60Q5U649 BICDL2-201ENST00000389347 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
C12orf60Q5U649 GMDS-202ENST00000380815 1752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.1 ms