Protein–RNA interactions for Protein: Q5TF21

SOGA3, Protein SOGA3, humanhuman

Predictions only

Length 947 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SOGA3Q5TF21 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
SOGA3Q5TF21 NUDT22-201ENST00000279206 1094 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
SOGA3Q5TF21 LINC00471-201ENST00000313064 1282 ntTSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
SOGA3Q5TF21 GRTP1-201ENST00000326039 1294 ntTSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
SOGA3Q5TF21 MTHFD1L-201ENST00000367307 1049 ntTSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
SOGA3Q5TF21 GNAS-AS1-201ENST00000424094 1156 ntTSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
SOGA3Q5TF21 NUDT22-204ENST00000441250 986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.25■■□□□ 1.79
SOGA3Q5TF21 AC026366.1-201ENST00000488803 879 ntBASIC26.25■■□□□ 1.79
SOGA3Q5TF21 CFL1-211ENST00000531407 1062 ntTSL 2 BASIC26.25■■□□□ 1.79
SOGA3Q5TF21 ETHE1-205ENST00000600651 1052 ntTSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
SOGA3Q5TF21 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
SOGA3Q5TF21 FHL3-201ENST00000373016 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
SOGA3Q5TF21 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC26.24■■□□□ 1.79
SOGA3Q5TF21 AC010980.2-201ENST00000587099 1412 ntBASIC26.24■■□□□ 1.79
SOGA3Q5TF21 CSNK1G3-206ENST00000511130 1356 ntTSL 2 BASIC26.24■■□□□ 1.79
SOGA3Q5TF21 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
SOGA3Q5TF21 TRPT1-201ENST00000317459 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
SOGA3Q5TF21 SYNE2-201ENST00000341472 1132 ntTSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
SOGA3Q5TF21 DNPH1-202ENST00000393987 796 ntTSL 2 BASIC26.24■■□□□ 1.79
SOGA3Q5TF21 KRTAP5-8-201ENST00000398534 1183 ntAPPRIS P1 BASIC26.24■■□□□ 1.79
SOGA3Q5TF21 LTB-210ENST00000429299 897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
SOGA3Q5TF21 HOTAIRM1-203ENST00000429611 722 ntTSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
SOGA3Q5TF21 HAGLR-207ENST00000452365 661 ntTSL 4 BASIC26.24■■□□□ 1.79
SOGA3Q5TF21 RTBDN-203ENST00000458671 1066 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
SOGA3Q5TF21 UNC93B4-201ENST00000505679 747 ntBASIC26.24■■□□□ 1.79
SOGA3Q5TF21 EIF3J-AS1-205ENST00000560750 1093 ntTSL 3 BASIC26.24■■□□□ 1.79
SOGA3Q5TF21 AC093762.2-201ENST00000641700 291 ntAPPRIS P1 BASIC26.24■■□□□ 1.79
SOGA3Q5TF21 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
SOGA3Q5TF21 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
SOGA3Q5TF21 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC26.24■■□□□ 1.79
SOGA3Q5TF21 TRABD2A-203ENST00000409520 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
SOGA3Q5TF21 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
SOGA3Q5TF21 SLC22A31-201ENST00000562855 1909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.24■■□□□ 1.79
SOGA3Q5TF21 PRAF2-202ENST00000553851 1334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
SOGA3Q5TF21 TNIP2-203ENST00000503235 1653 ntTSL 3 BASIC26.23■■□□□ 1.79
SOGA3Q5TF21 POU5F1P4-201ENST00000413175 1085 ntBASIC26.23■■□□□ 1.79
SOGA3Q5TF21 DLEU2-203ENST00000425586 1267 ntTSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
SOGA3Q5TF21 STPG4-207ENST00000445927 891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.23■■□□□ 1.79
SOGA3Q5TF21 CALM1-202ENST00000447653 1104 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.23■■□□□ 1.79
SOGA3Q5TF21 UNC93B5-201ENST00000530315 699 ntBASIC26.23■■□□□ 1.79
SOGA3Q5TF21 FAM213B-215ENST00000537325 1096 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.23■■□□□ 1.79
SOGA3Q5TF21 IGFBP6-203ENST00000548547 1177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.23■■□□□ 1.79
SOGA3Q5TF21 AP2S1-207ENST00000599990 829 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.23■■□□□ 1.79
SOGA3Q5TF21 AL591742.1-201ENST00000604433 565 ntBASIC26.23■■□□□ 1.79
SOGA3Q5TF21 AP006587.3-201ENST00000525742 1516 ntBASIC26.23■■□□□ 1.79
SOGA3Q5TF21 FUZ-212ENST00000528094 1479 ntTSL 2 BASIC26.23■■□□□ 1.79
SOGA3Q5TF21 CASP16P-201ENST00000428155 1433 ntTSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
SOGA3Q5TF21 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
SOGA3Q5TF21 SH3GLB2-202ENST00000372559 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
SOGA3Q5TF21 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC26.22■■□□□ 1.79
SOGA3Q5TF21 LINC01960-201ENST00000563759 1884 ntBASIC26.22■■□□□ 1.79
SOGA3Q5TF21 UMAD1-202ENST00000463725 559 ntTSL 4 BASIC26.22■■□□□ 1.79
SOGA3Q5TF21 AF274858.3-202ENST00000569906 755 ntTSL 3 BASIC26.22■■□□□ 1.79
SOGA3Q5TF21 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
SOGA3Q5TF21 TPM1-204ENST00000334895 1637 ntTSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
SOGA3Q5TF21 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
SOGA3Q5TF21 C22orf34-203ENST00000405854 1593 ntTSL 5 BASIC26.21■■□□□ 1.79
SOGA3Q5TF21 CCDC107-202ENST00000378406 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.21■■□□□ 1.79
SOGA3Q5TF21 DGCR6L-202ENST00000405465 962 ntTSL 3 BASIC26.21■■□□□ 1.79
SOGA3Q5TF21 SGO1-AS1-202ENST00000448208 819 ntTSL 3 BASIC26.21■■□□□ 1.79
SOGA3Q5TF21 AC006435.1-201ENST00000571775 1065 ntTSL 5 BASIC26.21■■□□□ 1.79
SOGA3Q5TF21 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
SOGA3Q5TF21 SMARCB1-202ENST00000344921 1728 ntTSL 2 BASIC26.21■■□□□ 1.79
SOGA3Q5TF21 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
SOGA3Q5TF21 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.21■■□□□ 1.79
SOGA3Q5TF21 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC26.2■■□□□ 1.79
SOGA3Q5TF21 PICK1-202ENST00000404072 2164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.2■■□□□ 1.79
SOGA3Q5TF21 OLFM1-202ENST00000277415 1014 ntTSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
SOGA3Q5TF21 AC089999.2-201ENST00000552525 248 ntTSL 3 BASIC26.2■■□□□ 1.78
SOGA3Q5TF21 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
SOGA3Q5TF21 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
SOGA3Q5TF21 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC26.2■■□□□ 1.78
SOGA3Q5TF21 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
SOGA3Q5TF21 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
SOGA3Q5TF21 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
SOGA3Q5TF21 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
SOGA3Q5TF21 C10orf91-201ENST00000321248 1257 ntTSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
SOGA3Q5TF21 FDX2-202ENST00000393708 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
SOGA3Q5TF21 SERPINH1P1-201ENST00000419794 1249 ntBASIC26.19■■□□□ 1.78
SOGA3Q5TF21 AC007405.3-201ENST00000429172 561 ntTSL 3 BASIC26.19■■□□□ 1.78
SOGA3Q5TF21 PBX1-209ENST00000485769 834 ntTSL 2 BASIC26.19■■□□□ 1.78
SOGA3Q5TF21 AP003097.1-201ENST00000530657 1135 ntBASIC26.19■■□□□ 1.78
SOGA3Q5TF21 SCN1B-203ENST00000595652 814 ntTSL 2 BASIC26.19■■□□□ 1.78
SOGA3Q5TF21 TIMM50-213ENST00000599794 786 ntTSL 2 BASIC26.19■■□□□ 1.78
SOGA3Q5TF21 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.19■■□□□ 1.78
SOGA3Q5TF21 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
SOGA3Q5TF21 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
SOGA3Q5TF21 HOXD12-201ENST00000404162 841 ntTSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
SOGA3Q5TF21 SLC25A24P1-201ENST00000411846 1569 ntTSL 5 BASIC26.18■■□□□ 1.78
SOGA3Q5TF21 ELOVL2-AS1-201ENST00000456190 737 ntTSL 3 BASIC26.18■■□□□ 1.78
SOGA3Q5TF21 AC006252.1-201ENST00000483834 1101 ntTSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
SOGA3Q5TF21 AC008550.1-201ENST00000511500 884 ntBASIC26.18■■□□□ 1.78
SOGA3Q5TF21 RAP1B-220ENST00000539091 977 ntTSL 2 BASIC26.18■■□□□ 1.78
SOGA3Q5TF21 ANP32AP1-202ENST00000560832 1074 ntTSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
SOGA3Q5TF21 PLEKHJ1-205ENST00000587394 937 ntTSL 2 BASIC26.18■■□□□ 1.78
SOGA3Q5TF21 MAGIX-206ENST00000615626 1057 ntTSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
SOGA3Q5TF21 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.18■■□□□ 1.78
SOGA3Q5TF21 AC073648.6-201ENST00000641589 218 ntBASIC26.18■■□□□ 1.78
SOGA3Q5TF21 AKR7A2-201ENST00000235835 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
SOGA3Q5TF21 SMPD5-201ENST00000528912 1390 ntTSL 5 BASIC26.18■■□□□ 1.78
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.3 ms