Protein–RNA interactions for Protein: Q5T0J3

C1orf220, Putative uncharacterized protein C1orf220, humanhuman

Predictions only

Length 134 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C1orf220Q5T0J3 RASD1-202ENST00000579152 1404 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
C1orf220Q5T0J3 TTYH1-201ENST00000301194 2088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
C1orf220Q5T0J3 MPST-205ENST00000404802 1453 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.03■■□□□ 1.28
C1orf220Q5T0J3 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
C1orf220Q5T0J3 DHRS2-202ENST00000344777 1678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
C1orf220Q5T0J3 PXK-211ENST00000484288 2031 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
C1orf220Q5T0J3 LINC01089-202ENST00000429892 1521 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
C1orf220Q5T0J3 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
C1orf220Q5T0J3 SPOP-206ENST00000504102 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
C1orf220Q5T0J3 ILDR2-204ENST00000525740 2242 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
C1orf220Q5T0J3 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
C1orf220Q5T0J3 EIF3J-202ENST00000424492 1550 ntTSL 4 BASIC23.02■■□□□ 1.28
C1orf220Q5T0J3 TFG-201ENST00000240851 1978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
C1orf220Q5T0J3 DCTD-202ENST00000438320 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
C1orf220Q5T0J3 EIF6-201ENST00000374436 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
C1orf220Q5T0J3 CDKN2AIPNL-201ENST00000395009 800 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
C1orf220Q5T0J3 YBX1P1-201ENST00000445822 960 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
C1orf220Q5T0J3 AC093817.1-201ENST00000507296 812 ntTSL 3 BASIC23.02■■□□□ 1.28
C1orf220Q5T0J3 AL390816.2-201ENST00000554252 737 ntTSL 3 BASIC23.02■■□□□ 1.28
C1orf220Q5T0J3 SERPINB5-201ENST00000382771 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
C1orf220Q5T0J3 RPS6-203ENST00000380384 1355 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
C1orf220Q5T0J3 SLC2A11-202ENST00000316185 1555 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
C1orf220Q5T0J3 CCDC189-206ENST00000543610 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
C1orf220Q5T0J3 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
C1orf220Q5T0J3 PRR20B-201ENST00000377930 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
C1orf220Q5T0J3 PRR20A-201ENST00000377931 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
C1orf220Q5T0J3 PRR20E-201ENST00000434815 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
C1orf220Q5T0J3 PRR20D-201ENST00000452123 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
C1orf220Q5T0J3 PRR20C-201ENST00000544357 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
C1orf220Q5T0J3 PRR20C-202ENST00000614894 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
C1orf220Q5T0J3 LTC4S-202ENST00000401985 486 ntTSL 3 BASIC23.01■■□□□ 1.27
C1orf220Q5T0J3 PEX5-204ENST00000412720 2105 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
C1orf220Q5T0J3 NEBL-AS1-202ENST00000439097 661 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
C1orf220Q5T0J3 AC123595.1-201ENST00000440769 1046 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
C1orf220Q5T0J3 AC104564.3-201ENST00000582367 638 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
C1orf220Q5T0J3 TERF1P2-201ENST00000583350 1212 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
C1orf220Q5T0J3 CT47B1-201ENST00000371311 1328 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
C1orf220Q5T0J3 RAB1A-202ENST00000409751 1333 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
C1orf220Q5T0J3 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
C1orf220Q5T0J3 SMPD5-201ENST00000528912 1390 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
C1orf220Q5T0J3 CDKN2C-203ENST00000396148 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
C1orf220Q5T0J3 Z98882.1-201ENST00000622160 2253 ntBASIC23■■□□□ 1.27
C1orf220Q5T0J3 ADRM1-204ENST00000491935 1530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
C1orf220Q5T0J3 NDUFS3-201ENST00000263774 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
C1orf220Q5T0J3 GDNF-203ENST00000381826 778 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
C1orf220Q5T0J3 ASPDH-202ENST00000389208 1040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
C1orf220Q5T0J3 AC073343.2-201ENST00000413182 548 ntTSL 4 BASIC23■■□□□ 1.27
C1orf220Q5T0J3 AC092675.2-201ENST00000413274 541 ntTSL 4 BASIC23■■□□□ 1.27
C1orf220Q5T0J3 GDNF-204ENST00000427982 856 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
C1orf220Q5T0J3 CHTF8-210ENST00000523421 766 ntTSL 3 BASIC23■■□□□ 1.27
C1orf220Q5T0J3 PRMT1-221ENST00000610806 1192 ntTSL 3 BASIC23■■□□□ 1.27
C1orf220Q5T0J3 SEPT5-210ENST00000455784 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
C1orf220Q5T0J3 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
C1orf220Q5T0J3 PDCD2-203ENST00000443345 1897 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
C1orf220Q5T0J3 PPP1R3F-203ENST00000466508 1885 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
C1orf220Q5T0J3 AC138649.1-201ENST00000619611 1449 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
C1orf220Q5T0J3 ARHGEF25-201ENST00000286494 2552 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
C1orf220Q5T0J3 PTPN18-202ENST00000347849 2472 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
C1orf220Q5T0J3 COMMD5-207ENST00000543949 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.99■■□□□ 1.27
C1orf220Q5T0J3 NDUFB2-201ENST00000247866 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
C1orf220Q5T0J3 ARHGAP24-206ENST00000503995 1273 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
C1orf220Q5T0J3 GLI4-210ENST00000523522 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
C1orf220Q5T0J3 AL137779.2-201ENST00000554859 448 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
C1orf220Q5T0J3 ELANE-202ENST00000590230 1028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
C1orf220Q5T0J3 RAB43-208ENST00000615093 783 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
C1orf220Q5T0J3 CXCL16-203ENST00000574412 1668 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
C1orf220Q5T0J3 CSNK1G3-206ENST00000511130 1356 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
C1orf220Q5T0J3 LINC02228-203ENST00000641970 1355 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
C1orf220Q5T0J3 FBXO27-202ENST00000509137 2130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
C1orf220Q5T0J3 CDCP1-202ENST00000425231 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
C1orf220Q5T0J3 GPR27-201ENST00000304411 2447 ntAPPRIS P1 BASIC22.98■■□□□ 1.27
C1orf220Q5T0J3 SGMS1-210ENST00000619438 1680 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
C1orf220Q5T0J3 MRPL14-201ENST00000372014 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
C1orf220Q5T0J3 LRRC3C-201ENST00000377924 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.98■■□□□ 1.27
C1orf220Q5T0J3 SDHAP3-201ENST00000436493 736 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
C1orf220Q5T0J3 AP003071.3-201ENST00000562506 366 ntTSL 3 BASIC22.98■■□□□ 1.27
C1orf220Q5T0J3 CCDC92B-201ENST00000575506 885 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
C1orf220Q5T0J3 AC011511.3-201ENST00000587088 355 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
C1orf220Q5T0J3 AC011446.1-201ENST00000591825 458 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
C1orf220Q5T0J3 NR2F2-204ENST00000453270 1712 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
C1orf220Q5T0J3 AC019069.1-201ENST00000610008 1333 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
C1orf220Q5T0J3 MEIS3-212ENST00000561293 1918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
C1orf220Q5T0J3 VGF-202ENST00000445482 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
C1orf220Q5T0J3 DACT1-204ENST00000541264 2610 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
C1orf220Q5T0J3 NOC4L-201ENST00000330579 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
C1orf220Q5T0J3 GNB1L-202ENST00000403325 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
C1orf220Q5T0J3 LPCAT4-201ENST00000314891 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
C1orf220Q5T0J3 PUF60-203ENST00000453551 1842 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
C1orf220Q5T0J3 CLN8-213ENST00000637156 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
C1orf220Q5T0J3 BCAP29-209ENST00000465919 942 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
C1orf220Q5T0J3 TPT1-AS1-211ENST00000520622 604 ntTSL 4 BASIC22.97■■□□□ 1.27
C1orf220Q5T0J3 FAM222B-213ENST00000583522 556 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
C1orf220Q5T0J3 RUNDC3B-207ENST00000493037 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
C1orf220Q5T0J3 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
C1orf220Q5T0J3 PBX4-201ENST00000251203 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
C1orf220Q5T0J3 CRHR1-201ENST00000293493 2621 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
C1orf220Q5T0J3 DPYS-201ENST00000351513 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
C1orf220Q5T0J3 AC009126.1-201ENST00000501338 2245 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
C1orf220Q5T0J3 SEC61A2-205ENST00000379033 2462 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
C1orf220Q5T0J3 RTCA-202ENST00000370126 538 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.8 ms