Protein–RNA interactions for Protein: Q5SW79

CEP170, Centrosomal protein of 170 kDa, humanhuman

Predictions only

Length 1,584 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CEP170Q5SW79 KLC3-204ENST00000585434 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC34.71■■■■□ 3.15
CEP170Q5SW79 BOLA1-203ENST00000369153 1096 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC34.71■■■■□ 3.15
CEP170Q5SW79 UBE2K-204ENST00000503368 891 ntTSL 1 (best) BASIC34.71■■■■□ 3.15
CEP170Q5SW79 AL034346.1-201ENST00000568244 1277 ntBASIC34.71■■■■□ 3.15
CEP170Q5SW79 NOXO1-201ENST00000354249 1618 ntTSL 1 (best) BASIC34.71■■■■□ 3.15
CEP170Q5SW79 PTX4-203ENST00000447419 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.71■■■■□ 3.15
CEP170Q5SW79 GATS-209ENST00000454084 1030 ntTSL 3 BASIC34.7■■■■□ 3.15
CEP170Q5SW79 BNIP3L-204ENST00000520409 739 ntTSL 2 BASIC34.7■■■■□ 3.15
CEP170Q5SW79 AC091564.5-201ENST00000526456 820 ntTSL 4 BASIC34.7■■■■□ 3.15
CEP170Q5SW79 AC060766.5-201ENST00000590539 871 ntBASIC34.7■■■■□ 3.15
CEP170Q5SW79 PACRGL-227ENST00000513459 1773 ntTSL 5 BASIC34.7■■■■□ 3.15
CEP170Q5SW79 LINC01960-201ENST00000563759 1884 ntBASIC34.7■■■■□ 3.15
CEP170Q5SW79 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.7■■■■□ 3.15
CEP170Q5SW79 PICK1-202ENST00000404072 2164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.7■■■■□ 3.15
CEP170Q5SW79 HCFC1R1-202ENST00000354679 765 ntTSL 2 BASIC34.7■■■■□ 3.14
CEP170Q5SW79 HTT-AS-201ENST00000503893 515 ntTSL 4 BASIC34.7■■■■□ 3.14
CEP170Q5SW79 TGIF1-219ENST00000551541 990 ntTSL 2 BASIC34.7■■■■□ 3.14
CEP170Q5SW79 METTL23-208ENST00000588822 1049 ntTSL 3 BASIC34.7■■■■□ 3.14
CEP170Q5SW79 FP565260.3-201ENST00000612610 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC34.7■■■■□ 3.14
CEP170Q5SW79 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC34.69■■■■□ 3.14
CEP170Q5SW79 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC34.69■■■■□ 3.14
CEP170Q5SW79 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.69■■■■□ 3.14
CEP170Q5SW79 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC34.69■■■■□ 3.14
CEP170Q5SW79 CXCL3-201ENST00000296026 1075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.69■■■■□ 3.14
CEP170Q5SW79 PDZRN3-202ENST00000308537 1136 ntTSL 1 (best) BASIC34.69■■■■□ 3.14
CEP170Q5SW79 SYNE2-201ENST00000341472 1132 ntTSL 1 (best) BASIC34.69■■■■□ 3.14
CEP170Q5SW79 AL024498.1-202ENST00000606652 480 ntTSL 2 BASIC34.69■■■■□ 3.14
CEP170Q5SW79 AC005225.2-202ENST00000617980 408 ntTSL 4 BASIC34.69■■■■□ 3.14
CEP170Q5SW79 MIF4GD-202ENST00000325102 1306 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.69■■■■□ 3.14
CEP170Q5SW79 KRT17P1-201ENST00000399211 1546 ntBASIC34.69■■■■□ 3.14
CEP170Q5SW79 SMARCB1-202ENST00000344921 1728 ntTSL 2 BASIC34.69■■■■□ 3.14
CEP170Q5SW79 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.69■■■■□ 3.14
CEP170Q5SW79 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.68■■■■□ 3.14
CEP170Q5SW79 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC34.68■■■■□ 3.14
CEP170Q5SW79 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC34.68■■■■□ 3.14
CEP170Q5SW79 FAHD1-201ENST00000382666 1964 ntTSL 2 BASIC34.68■■■■□ 3.14
CEP170Q5SW79 AC073050.1-201ENST00000442316 462 ntTSL 3 BASIC34.68■■■■□ 3.14
CEP170Q5SW79 MNX1-AS1-201ENST00000480284 1041 ntTSL 1 (best) BASIC34.68■■■■□ 3.14
CEP170Q5SW79 RNASET2-214ENST00000620173 1391 ntTSL 5 BASIC34.68■■■■□ 3.14
CEP170Q5SW79 AC093762.2-201ENST00000641700 291 ntAPPRIS P1 BASIC34.68■■■■□ 3.14
CEP170Q5SW79 AC010531.6-201ENST00000602282 401 ntTSL 2 BASIC34.67■■■■□ 3.14
CEP170Q5SW79 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.67■■■■□ 3.14
CEP170Q5SW79 SLC22A31-201ENST00000562855 1909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.67■■■■□ 3.14
CEP170Q5SW79 C1orf174-201ENST00000361605 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.67■■■■□ 3.14
CEP170Q5SW79 LHPP-202ENST00000368842 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.67■■■■□ 3.14
CEP170Q5SW79 C22orf34-203ENST00000405854 1593 ntTSL 5 BASIC34.67■■■■□ 3.14
CEP170Q5SW79 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC34.67■■■■□ 3.14
CEP170Q5SW79 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.67■■■■□ 3.14
CEP170Q5SW79 TMEM5-201ENST00000261234 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.66■■■■□ 3.14
CEP170Q5SW79 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC34.66■■■■□ 3.14
CEP170Q5SW79 RHOG-202ENST00000396978 1066 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC34.66■■■■□ 3.14
CEP170Q5SW79 CALM1-202ENST00000447653 1104 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC34.66■■■■□ 3.14
CEP170Q5SW79 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC34.66■■■■□ 3.14
CEP170Q5SW79 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC34.66■■■■□ 3.14
CEP170Q5SW79 KLF1-201ENST00000264834 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.66■■■■□ 3.14
CEP170Q5SW79 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.66■■■■□ 3.14
CEP170Q5SW79 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC34.66■■■■□ 3.14
CEP170Q5SW79 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC34.66■■■■□ 3.14
CEP170Q5SW79 PRSS3-201ENST00000342836 1144 ntTSL 1 (best) BASIC34.66■■■■□ 3.14
CEP170Q5SW79 MIR718-201ENST00000390190 70 ntBASIC34.66■■■■□ 3.14
CEP170Q5SW79 AL121761.1-202ENST00000412571 415 ntTSL 2 BASIC34.66■■■■□ 3.14
CEP170Q5SW79 AL354712.1-201ENST00000563570 477 ntTSL 3 BASIC34.66■■■■□ 3.14
CEP170Q5SW79 AC233263.1-201ENST00000578059 224 ntBASIC34.66■■■■□ 3.14
CEP170Q5SW79 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC34.65■■■■□ 3.14
CEP170Q5SW79 DUSP28-201ENST00000343217 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.65■■■■□ 3.14
CEP170Q5SW79 PIGH-201ENST00000216452 1420 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.65■■■■□ 3.14
CEP170Q5SW79 RALGPS1-206ENST00000394011 819 ntTSL 1 (best) BASIC34.65■■■■□ 3.14
CEP170Q5SW79 CD99P1-203ENST00000431582 602 ntTSL 4 BASIC34.65■■■■□ 3.14
CEP170Q5SW79 GLYCTK-205ENST00000473032 935 ntTSL 1 (best) BASIC34.65■■■■□ 3.14
CEP170Q5SW79 AC244517.4-202ENST00000624089 484 ntTSL 3 BASIC34.65■■■■□ 3.14
CEP170Q5SW79 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.65■■■■□ 3.14
CEP170Q5SW79 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC34.65■■■■□ 3.14
CEP170Q5SW79 IFNGR2-203ENST00000405436 1684 ntTSL 5 BASIC34.64■■■■□ 3.14
CEP170Q5SW79 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC34.64■■■■□ 3.14
CEP170Q5SW79 OGG1-209ENST00000383826 1069 ntTSL 5 BASIC34.64■■■■□ 3.14
CEP170Q5SW79 SNORA78-201ENST00000459373 127 ntBASIC34.64■■■■□ 3.14
CEP170Q5SW79 AC006252.1-201ENST00000483834 1101 ntTSL 1 (best) BASIC34.64■■■■□ 3.14
CEP170Q5SW79 RPPH1-201ENST00000516869 333 ntBASIC34.64■■■■□ 3.14
CEP170Q5SW79 AC011446.2-202ENST00000592882 756 ntTSL 3 BASIC34.64■■■■□ 3.14
CEP170Q5SW79 AC243732.1-201ENST00000612648 864 ntBASIC34.64■■■■□ 3.14
CEP170Q5SW79 NAPSA-201ENST00000253719 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.64■■■■□ 3.14
CEP170Q5SW79 ALG1-202ENST00000544428 1419 ntTSL 2 BASIC34.64■■■■□ 3.14
CEP170Q5SW79 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.63■■■■□ 3.13
CEP170Q5SW79 SCARB1-211ENST00000546215 1597 ntTSL 1 (best) BASIC34.63■■■■□ 3.13
CEP170Q5SW79 RPS20-210ENST00000523936 899 ntTSL 2 BASIC34.63■■■■□ 3.13
CEP170Q5SW79 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC34.63■■■■□ 3.13
CEP170Q5SW79 KRT16P2-201ENST00000414673 1423 ntBASIC34.63■■■■□ 3.13
CEP170Q5SW79 SAC3D1-205ENST00000531072 1362 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.63■■■■□ 3.13
CEP170Q5SW79 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.63■■■■□ 3.13
CEP170Q5SW79 TMEM191C-214ENST00000621561 1337 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC34.63■■■■□ 3.13
CEP170Q5SW79 ZDHHC12-202ENST00000372667 1187 ntTSL 5 BASIC34.62■■■■□ 3.13
CEP170Q5SW79 RGCC-201ENST00000379359 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.62■■■■□ 3.13
CEP170Q5SW79 AC114730.2-201ENST00000417267 668 ntTSL 3 BASIC34.62■■■■□ 3.13
CEP170Q5SW79 SLC35A2-213ENST00000635015 1008 ntTSL 2 BASIC34.62■■■■□ 3.13
CEP170Q5SW79 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC34.62■■■■□ 3.13
CEP170Q5SW79 NPY4R-201ENST00000374312 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.62■■■■□ 3.13
CEP170Q5SW79 NPY4R2-201ENST00000576178 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.62■■■■□ 3.13
CEP170Q5SW79 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.62■■■■□ 3.13
CEP170Q5SW79 NDUFA8-201ENST00000373768 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.62■■■■□ 3.13
CEP170Q5SW79 PDCD10-202ENST00000461494 934 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC34.62■■■■□ 3.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 293.9 ms