Protein–RNA interactions for Protein: Q5SRH9

TTC39A, Tetratricopeptide repeat protein 39A, humanhuman

Predictions only

Length 613 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TTC39AQ5SRH9 SCN1B-203ENST00000595652 814 ntTSL 2 BASIC25.95■■□□□ 1.74
TTC39AQ5SRH9 MXRA8-203ENST00000445648 2001 ntTSL 2 BASIC25.95■■□□□ 1.74
TTC39AQ5SRH9 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
TTC39AQ5SRH9 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC25.94■■□□□ 1.74
TTC39AQ5SRH9 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
TTC39AQ5SRH9 CHRAC1-203ENST00000519533 1678 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
TTC39AQ5SRH9 ZNF784-201ENST00000325351 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
TTC39AQ5SRH9 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
TTC39AQ5SRH9 CCDC74B-205ENST00000409943 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
TTC39AQ5SRH9 AC243773.2-201ENST00000616341 490 ntTSL 2 BASIC25.94■■□□□ 1.74
TTC39AQ5SRH9 UBE2Q2P2-204ENST00000618775 648 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
TTC39AQ5SRH9 TRIM2-212ENST00000632856 656 ntTSL 3 BASIC25.94■■□□□ 1.74
TTC39AQ5SRH9 PACRGL-208ENST00000503585 1582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.94■■□□□ 1.74
TTC39AQ5SRH9 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
TTC39AQ5SRH9 SPRED3-202ENST00000586301 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
TTC39AQ5SRH9 HSF4-215ENST00000521374 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
TTC39AQ5SRH9 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
TTC39AQ5SRH9 NFKBIL1-203ENST00000376148 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
TTC39AQ5SRH9 SLC41A3-201ENST00000315891 1797 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
TTC39AQ5SRH9 CPED1-202ENST00000340646 1056 ntTSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
TTC39AQ5SRH9 CD47-202ENST00000361309 1285 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
TTC39AQ5SRH9 RASGRP2-209ENST00000394429 453 ntTSL 3 BASIC25.93■■□□□ 1.74
TTC39AQ5SRH9 ATP6V0B-205ENST00000472174 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
TTC39AQ5SRH9 DLX3-202ENST00000512495 834 ntTSL 2 BASIC25.93■■□□□ 1.74
TTC39AQ5SRH9 AP001363.2-201ENST00000538101 391 ntTSL 3 BASIC25.93■■□□□ 1.74
TTC39AQ5SRH9 AC138907.5-202ENST00000569484 235 ntBASIC25.93■■□□□ 1.74
TTC39AQ5SRH9 AC053503.5-201ENST00000601508 636 ntBASIC25.93■■□□□ 1.74
TTC39AQ5SRH9 RNASEH2B-206ENST00000611510 1257 ntTSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
TTC39AQ5SRH9 DMRT1-201ENST00000382276 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
TTC39AQ5SRH9 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC25.93■■□□□ 1.74
TTC39AQ5SRH9 LRP5L-203ENST00000444995 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
TTC39AQ5SRH9 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
TTC39AQ5SRH9 BICDL2-201ENST00000389347 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
TTC39AQ5SRH9 GCH1-202ENST00000395514 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
TTC39AQ5SRH9 ANKS6-201ENST00000353234 7164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
TTC39AQ5SRH9 ASCL2-201ENST00000331289 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
TTC39AQ5SRH9 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
TTC39AQ5SRH9 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
TTC39AQ5SRH9 EFCAB6-202ENST00000356087 1129 ntTSL 5 BASIC25.92■■□□□ 1.74
TTC39AQ5SRH9 AC106820.5-201ENST00000566085 789 ntTSL 3 BASIC25.92■■□□□ 1.74
TTC39AQ5SRH9 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
TTC39AQ5SRH9 FMNL2-201ENST00000288670 5575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
TTC39AQ5SRH9 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
TTC39AQ5SRH9 ATP8A1-207ENST00000510289 2238 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
TTC39AQ5SRH9 GPR137B-202ENST00000366592 2042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
TTC39AQ5SRH9 C3orf18-205ENST00000441239 1490 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
TTC39AQ5SRH9 TMEM165-201ENST00000381334 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
TTC39AQ5SRH9 MRPL37-201ENST00000336230 1179 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
TTC39AQ5SRH9 MLLT10-204ENST00000377091 905 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
TTC39AQ5SRH9 IZUMO4-203ENST00000395307 944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
TTC39AQ5SRH9 AC010141.2-201ENST00000452426 721 ntBASIC25.91■■□□□ 1.74
TTC39AQ5SRH9 SPI1-203ENST00000533030 661 ntTSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
TTC39AQ5SRH9 WWOX-218ENST00000627394 894 ntTSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
TTC39AQ5SRH9 GMDS-202ENST00000380815 1752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
TTC39AQ5SRH9 CNIH2-201ENST00000311445 1356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
TTC39AQ5SRH9 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
TTC39AQ5SRH9 ST3GAL4-215ENST00000532243 1825 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
TTC39AQ5SRH9 AC010542.4-201ENST00000563151 1910 ntBASIC25.9■■□□□ 1.74
TTC39AQ5SRH9 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
TTC39AQ5SRH9 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
TTC39AQ5SRH9 EFNA2-201ENST00000215368 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
TTC39AQ5SRH9 LIN7B-201ENST00000221459 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
TTC39AQ5SRH9 CDKN3-204ENST00000442975 727 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
TTC39AQ5SRH9 ZPBP-201ENST00000046087 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
TTC39AQ5SRH9 AL731577.2-201ENST00000508096 555 ntTSL 2 BASIC25.9■■□□□ 1.74
TTC39AQ5SRH9 C19orf84-201ENST00000570516 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
TTC39AQ5SRH9 AL032819.3-201ENST00000640283 925 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
TTC39AQ5SRH9 CDKN1C-204ENST00000440480 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
TTC39AQ5SRH9 MRPL37-206ENST00000605337 1582 ntTSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
TTC39AQ5SRH9 PHLDB2-210ENST00000478922 1861 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
TTC39AQ5SRH9 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
TTC39AQ5SRH9 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
TTC39AQ5SRH9 PARD3-209ENST00000374790 5825 ntTSL 5 BASIC25.89■■□□□ 1.74
TTC39AQ5SRH9 FAHD1-202ENST00000382668 1845 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
TTC39AQ5SRH9 AKT1S1-206ENST00000391834 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.89■■□□□ 1.74
TTC39AQ5SRH9 ADARB1-205ENST00000437626 5032 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
TTC39AQ5SRH9 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.89■■□□□ 1.74
TTC39AQ5SRH9 OLFM1-206ENST00000371799 961 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
TTC39AQ5SRH9 C19orf24-201ENST00000409293 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.89■■□□□ 1.74
TTC39AQ5SRH9 FGF12-AS2-201ENST00000443165 580 ntTSL 4 BASIC25.89■■□□□ 1.74
TTC39AQ5SRH9 ZNF302-209ENST00000507959 854 ntTSL 2 BASIC25.89■■□□□ 1.74
TTC39AQ5SRH9 SNAP23-214ENST00000567094 834 ntTSL 3 BASIC25.89■■□□□ 1.74
TTC39AQ5SRH9 FP565260.3-201ENST00000612610 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
TTC39AQ5SRH9 TTYH1-203ENST00000376531 1763 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
TTC39AQ5SRH9 USP45-202ENST00000329966 1444 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
TTC39AQ5SRH9 YBX1-201ENST00000321358 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
TTC39AQ5SRH9 RBBP7-202ENST00000380084 2036 ntTSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
TTC39AQ5SRH9 ZSWIM7-201ENST00000399277 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
TTC39AQ5SRH9 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
TTC39AQ5SRH9 HSD11B1L-201ENST00000301382 1457 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
TTC39AQ5SRH9 KRT18P11-201ENST00000435214 1283 ntBASIC25.88■■□□□ 1.73
TTC39AQ5SRH9 GATA3-AS1-204ENST00000438755 675 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
TTC39AQ5SRH9 RNF146-206ENST00000480444 843 ntTSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
TTC39AQ5SRH9 TSPAN11-202ENST00000535215 988 ntTSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
TTC39AQ5SRH9 AC110285.4-201ENST00000572590 424 ntTSL 3 BASIC25.88■■□□□ 1.73
TTC39AQ5SRH9 VPS53-216ENST00000574029 585 ntTSL 4 BASIC25.88■■□□□ 1.73
TTC39AQ5SRH9 UBE2DNL-204ENST00000602536 740 ntBASIC25.88■■□□□ 1.73
TTC39AQ5SRH9 TMEM230-210ENST00000612323 1231 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
TTC39AQ5SRH9 MRAS-202ENST00000423968 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
TTC39AQ5SRH9 NAA35-202ENST00000376040 1797 ntTSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 76.7 ms