Protein–RNA interactions for Protein: Q5SRE5

NUP188, Nucleoporin NUP188 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 1,749 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NUP188Q5SRE5 CRNDE-210ENST00000560912 459 ntTSL 5 BASIC27.81■■■□□ 2.04
NUP188Q5SRE5 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.8■■■□□ 2.04
NUP188Q5SRE5 ELOA3B-201ENST00000611323 1641 ntAPPRIS P1 BASIC27.8■■■□□ 2.04
NUP188Q5SRE5 ELOA3D-201ENST00000620881 1641 ntAPPRIS P1 BASIC27.8■■■□□ 2.04
NUP188Q5SRE5 RORA-204ENST00000449337 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
NUP188Q5SRE5 RAB28-201ENST00000288723 1810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
NUP188Q5SRE5 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC27.8■■■□□ 2.04
NUP188Q5SRE5 ASPSCR1-208ENST00000580534 1776 ntTSL 2 BASIC27.8■■■□□ 2.04
NUP188Q5SRE5 HSD11B1L-201ENST00000301382 1457 ntTSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
NUP188Q5SRE5 POMC-202ENST00000380794 1295 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.8■■■□□ 2.04
NUP188Q5SRE5 SPI1-204ENST00000533968 1290 ntTSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
NUP188Q5SRE5 NUDT22-204ENST00000441250 986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.79■■■□□ 2.04
NUP188Q5SRE5 LINC01301-204ENST00000530725 577 ntTSL 4 BASIC27.79■■■□□ 2.04
NUP188Q5SRE5 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC27.79■■■□□ 2.04
NUP188Q5SRE5 AC055733.4-201ENST00000638462 1354 ntBASIC27.79■■■□□ 2.04
NUP188Q5SRE5 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC27.78■■■□□ 2.04
NUP188Q5SRE5 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC27.78■■■□□ 2.04
NUP188Q5SRE5 GCC2-AS1-201ENST00000322353 558 ntTSL 2 BASIC27.78■■■□□ 2.04
NUP188Q5SRE5 AL390719.1-201ENST00000427998 977 ntTSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
NUP188Q5SRE5 AC009086.2-201ENST00000449759 610 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.78■■■□□ 2.04
NUP188Q5SRE5 ABCC3-217ENST00000515707 656 ntTSL 3 BASIC27.78■■■□□ 2.04
NUP188Q5SRE5 CFL1-211ENST00000531407 1062 ntTSL 2 BASIC27.78■■■□□ 2.04
NUP188Q5SRE5 YIF1B-213ENST00000591755 1077 ntTSL 2 BASIC27.78■■■□□ 2.04
NUP188Q5SRE5 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
NUP188Q5SRE5 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC27.78■■■□□ 2.04
NUP188Q5SRE5 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
NUP188Q5SRE5 C10orf91-201ENST00000321248 1257 ntTSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
NUP188Q5SRE5 AL360181.5-201ENST00000368554 1044 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.78■■■□□ 2.04
NUP188Q5SRE5 KRT8P12-201ENST00000468527 998 ntTSL 2 BASIC27.78■■■□□ 2.04
NUP188Q5SRE5 HTATIP2-208ENST00000532505 595 ntTSL 2 BASIC27.78■■■□□ 2.04
NUP188Q5SRE5 FAM197Y4-202ENST00000622692 608 ntBASIC27.78■■■□□ 2.04
NUP188Q5SRE5 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
NUP188Q5SRE5 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC27.77■■■□□ 2.04
NUP188Q5SRE5 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC27.77■■■□□ 2.04
NUP188Q5SRE5 RPS14-201ENST00000312037 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
NUP188Q5SRE5 SERTAD3-201ENST00000322354 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
NUP188Q5SRE5 MCAT-202ENST00000327555 1134 ntTSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
NUP188Q5SRE5 ASMTL-AS1-203ENST00000425740 840 ntTSL 2 BASIC27.77■■■□□ 2.04
NUP188Q5SRE5 MCRIP1-206ENST00000573478 1123 ntTSL 2 BASIC27.77■■■□□ 2.04
NUP188Q5SRE5 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC27.77■■■□□ 2.04
NUP188Q5SRE5 KCNK4-201ENST00000394525 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
NUP188Q5SRE5 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
NUP188Q5SRE5 TPPP3-204ENST00000562206 1410 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.76■■■□□ 2.03
NUP188Q5SRE5 SLC47A1P1-201ENST00000420951 500 ntTSL 5 BASIC27.76■■■□□ 2.03
NUP188Q5SRE5 AC021660.2-201ENST00000502999 388 ntTSL 3 BASIC27.76■■■□□ 2.03
NUP188Q5SRE5 AC009052.1-201ENST00000567090 298 ntTSL 3 BASIC27.76■■■□□ 2.03
NUP188Q5SRE5 MAPK14-210ENST00000622903 1003 ntTSL 5 BASIC27.76■■■□□ 2.03
NUP188Q5SRE5 CNTD2-202ENST00000430325 1817 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.76■■■□□ 2.03
NUP188Q5SRE5 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
NUP188Q5SRE5 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
NUP188Q5SRE5 MRPL37-206ENST00000605337 1582 ntTSL 5 BASIC27.76■■■□□ 2.03
NUP188Q5SRE5 YBEY-204ENST00000397692 433 ntTSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
NUP188Q5SRE5 ZPBP-201ENST00000046087 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
NUP188Q5SRE5 AC091564.5-201ENST00000526456 820 ntTSL 4 BASIC27.75■■■□□ 2.03
NUP188Q5SRE5 JPT2-204ENST00000561516 1065 ntTSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
NUP188Q5SRE5 ZNF264-205ENST00000599653 705 ntTSL 2 BASIC27.75■■■□□ 2.03
NUP188Q5SRE5 SLC41A3-201ENST00000315891 1797 ntTSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
NUP188Q5SRE5 PDLIM3-203ENST00000284771 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
NUP188Q5SRE5 PICK1-202ENST00000404072 2164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.75■■■□□ 2.03
NUP188Q5SRE5 FAM207A-201ENST00000291634 927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
NUP188Q5SRE5 BOLA1-203ENST00000369153 1096 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.75■■■□□ 2.03
NUP188Q5SRE5 AC010531.6-201ENST00000602282 401 ntTSL 2 BASIC27.75■■■□□ 2.03
NUP188Q5SRE5 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
NUP188Q5SRE5 CASP9-203ENST00000375890 1351 ntTSL 2 BASIC27.74■■■□□ 2.03
NUP188Q5SRE5 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
NUP188Q5SRE5 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
NUP188Q5SRE5 NAA20-201ENST00000310450 920 ntTSL 2 BASIC27.74■■■□□ 2.03
NUP188Q5SRE5 NAA20-202ENST00000334982 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
NUP188Q5SRE5 NENF-201ENST00000366988 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
NUP188Q5SRE5 RALGPS1-206ENST00000394011 819 ntTSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
NUP188Q5SRE5 UBB-203ENST00000395839 1012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.74■■■□□ 2.03
NUP188Q5SRE5 HDAC11-205ENST00000404548 577 ntTSL 4 BASIC27.74■■■□□ 2.03
NUP188Q5SRE5 METTL23-208ENST00000588822 1049 ntTSL 3 BASIC27.74■■■□□ 2.03
NUP188Q5SRE5 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC27.74■■■□□ 2.03
NUP188Q5SRE5 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
NUP188Q5SRE5 IFI27L2-201ENST00000238609 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
NUP188Q5SRE5 SLX1A-201ENST00000251303 1091 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
NUP188Q5SRE5 RAC3-201ENST00000306897 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
NUP188Q5SRE5 SLX1B-201ENST00000330181 1165 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
NUP188Q5SRE5 ZFYVE1-202ENST00000394207 1183 ntTSL 2 BASIC27.73■■■□□ 2.03
NUP188Q5SRE5 HAGLR-207ENST00000452365 661 ntTSL 4 BASIC27.73■■■□□ 2.03
NUP188Q5SRE5 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC27.73■■■□□ 2.03
NUP188Q5SRE5 AC010980.2-201ENST00000587099 1412 ntBASIC27.73■■■□□ 2.03
NUP188Q5SRE5 RBM42-203ENST00000588161 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
NUP188Q5SRE5 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.73■■■□□ 2.03
NUP188Q5SRE5 PLPP2-201ENST00000269812 1228 ntTSL 3 BASIC27.72■■■□□ 2.03
NUP188Q5SRE5 MDFI-202ENST00000373050 809 ntTSL 2 BASIC27.72■■■□□ 2.03
NUP188Q5SRE5 AC073050.1-201ENST00000442316 462 ntTSL 3 BASIC27.72■■■□□ 2.03
NUP188Q5SRE5 COL19A1-203ENST00000478620 589 ntTSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
NUP188Q5SRE5 AC008694.1-202ENST00000636953 945 ntBASIC27.72■■■□□ 2.03
NUP188Q5SRE5 WDR37-206ENST00000620998 1303 ntTSL 5 BASIC27.72■■■□□ 2.03
NUP188Q5SRE5 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
NUP188Q5SRE5 CASP16P-201ENST00000428155 1433 ntTSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
NUP188Q5SRE5 GPR137-201ENST00000313074 1485 ntTSL 5 BASIC27.72■■■□□ 2.03
NUP188Q5SRE5 GPR137-203ENST00000411458 1495 ntTSL 2 BASIC27.72■■■□□ 2.03
NUP188Q5SRE5 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
NUP188Q5SRE5 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC27.72■■■□□ 2.03
NUP188Q5SRE5 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.72■■■□□ 2.03
NUP188Q5SRE5 TSPAN14-205ENST00000372158 1095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.72■■■□□ 2.03
NUP188Q5SRE5 BX088651.1-201ENST00000540551 451 ntBASIC27.72■■■□□ 2.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.8 ms