Protein–RNA interactions for Protein: Q5C9Z4

NOM1, Nucleolar MIF4G domain-containing protein 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 860 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NOM1Q5C9Z4 CAVIN3-203ENST00000530979 957 ntTSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
NOM1Q5C9Z4 KCNQ5-205ENST00000370398 6345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
NOM1Q5C9Z4 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC25.35■■□□□ 1.65
NOM1Q5C9Z4 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
NOM1Q5C9Z4 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
NOM1Q5C9Z4 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
NOM1Q5C9Z4 AZIN2-204ENST00000373443 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
NOM1Q5C9Z4 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
NOM1Q5C9Z4 UBA5-208ENST00000473651 1513 ntTSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
NOM1Q5C9Z4 B4GAT1-201ENST00000311181 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
NOM1Q5C9Z4 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
NOM1Q5C9Z4 CTU2-201ENST00000312060 1672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
NOM1Q5C9Z4 ABHD14A-204ENST00000491470 674 ntTSL 3 BASIC25.34■■□□□ 1.65
NOM1Q5C9Z4 AC005697.1-201ENST00000582441 582 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC25.34■■□□□ 1.65
NOM1Q5C9Z4 MPND-202ENST00000359935 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
NOM1Q5C9Z4 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
NOM1Q5C9Z4 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
NOM1Q5C9Z4 FAM167A-204ENST00000528897 1620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
NOM1Q5C9Z4 ARPP19-201ENST00000249822 5301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
NOM1Q5C9Z4 C2orf82-203ENST00000409533 561 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC25.33■■□□□ 1.65
NOM1Q5C9Z4 ABCC6P2-202ENST00000542005 706 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
NOM1Q5C9Z4 ABCC6-204ENST00000575728 714 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
NOM1Q5C9Z4 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
NOM1Q5C9Z4 PSME3-210ENST00000590720 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
NOM1Q5C9Z4 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
NOM1Q5C9Z4 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.64
NOM1Q5C9Z4 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.64
NOM1Q5C9Z4 ARID1B-220ENST00000636930 8246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
NOM1Q5C9Z4 SCAND1-202ENST00000373991 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
NOM1Q5C9Z4 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
NOM1Q5C9Z4 EFNA2-201ENST00000215368 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
NOM1Q5C9Z4 GUK1-209ENST00000366730 937 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC25.32■■□□□ 1.64
NOM1Q5C9Z4 C16orf86-201ENST00000403458 1267 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
NOM1Q5C9Z4 AL365295.1-202ENST00000456100 562 ntTSL 4 BASIC25.32■■□□□ 1.64
NOM1Q5C9Z4 RPS2P52-201ENST00000469610 820 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
NOM1Q5C9Z4 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
NOM1Q5C9Z4 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
NOM1Q5C9Z4 MBNL3-202ENST00000370844 1643 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
NOM1Q5C9Z4 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
NOM1Q5C9Z4 HSPB2-201ENST00000304298 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
NOM1Q5C9Z4 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
NOM1Q5C9Z4 EPCAM-202ENST00000405271 1530 ntTSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
NOM1Q5C9Z4 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
NOM1Q5C9Z4 PICK1-202ENST00000404072 2164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
NOM1Q5C9Z4 PIKFYVE-203ENST00000392202 2039 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
NOM1Q5C9Z4 PARP1-202ENST00000366792 553 ntTSL 3 BASIC25.31■■□□□ 1.64
NOM1Q5C9Z4 C19orf81-201ENST00000425202 765 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
NOM1Q5C9Z4 AC106820.5-201ENST00000566085 789 ntTSL 3 BASIC25.31■■□□□ 1.64
NOM1Q5C9Z4 MIR4758-201ENST00000577688 71 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
NOM1Q5C9Z4 NOXA1-202ENST00000392815 1464 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
NOM1Q5C9Z4 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
NOM1Q5C9Z4 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
NOM1Q5C9Z4 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
NOM1Q5C9Z4 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
NOM1Q5C9Z4 MAGI2-202ENST00000419488 6800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
NOM1Q5C9Z4 PYURF-201ENST00000273968 1361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
NOM1Q5C9Z4 PLEKHF1-204ENST00000592810 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
NOM1Q5C9Z4 ANKS6-201ENST00000353234 7164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
NOM1Q5C9Z4 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
NOM1Q5C9Z4 LYRM9-201ENST00000379102 501 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
NOM1Q5C9Z4 AL731577.2-201ENST00000508096 555 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
NOM1Q5C9Z4 LYRM9-206ENST00000508862 807 ntTSL 3 BASIC25.3■■□□□ 1.64
NOM1Q5C9Z4 AC098934.4-201ENST00000564127 592 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
NOM1Q5C9Z4 AC016888.1-201ENST00000585285 565 ntTSL 3 BASIC25.3■■□□□ 1.64
NOM1Q5C9Z4 NEURL4-201ENST00000315614 5182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
NOM1Q5C9Z4 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
NOM1Q5C9Z4 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
NOM1Q5C9Z4 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
NOM1Q5C9Z4 PARD3-213ENST00000545260 5740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
NOM1Q5C9Z4 SERF1A-201ENST00000317633 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
NOM1Q5C9Z4 RAC1-202ENST00000356142 907 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
NOM1Q5C9Z4 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
NOM1Q5C9Z4 EDA-210ENST00000527388 927 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
NOM1Q5C9Z4 AC105036.2-201ENST00000569468 176 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
NOM1Q5C9Z4 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC25.29■■□□□ 1.64
NOM1Q5C9Z4 LACTBL1-201ENST00000426928 1641 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
NOM1Q5C9Z4 RBM42-203ENST00000588161 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
NOM1Q5C9Z4 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
NOM1Q5C9Z4 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC25.28■■□□□ 1.64
NOM1Q5C9Z4 P2RX2-201ENST00000343948 1494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
NOM1Q5C9Z4 H1FX-201ENST00000333762 1507 ntAPPRIS P1 BASIC25.28■■□□□ 1.64
NOM1Q5C9Z4 UCHL5-201ENST00000367448 1534 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
NOM1Q5C9Z4 INS-203ENST00000397262 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
NOM1Q5C9Z4 ARL6IP4-205ENST00000412505 818 ntTSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
NOM1Q5C9Z4 ZNF346-203ENST00000503425 1191 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
NOM1Q5C9Z4 AL355102.2-201ENST00000553811 600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
NOM1Q5C9Z4 PTGER2-202ENST00000557436 643 ntTSL 3 BASIC25.28■■□□□ 1.64
NOM1Q5C9Z4 CIRBP-214ENST00000587896 1081 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
NOM1Q5C9Z4 AC104187.1-201ENST00000607510 612 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
NOM1Q5C9Z4 TANGO2-210ENST00000432883 2084 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
NOM1Q5C9Z4 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
NOM1Q5C9Z4 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
NOM1Q5C9Z4 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
NOM1Q5C9Z4 ATG101-201ENST00000336854 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
NOM1Q5C9Z4 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
NOM1Q5C9Z4 AC096677.1-201ENST00000454651 1516 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
NOM1Q5C9Z4 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
NOM1Q5C9Z4 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
NOM1Q5C9Z4 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
NOM1Q5C9Z4 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.1 ms