Protein–RNA interactions for Protein: Q587J8

KHDC3L, KHDC3-like protein, humanhuman

Predictions only

Length 217 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KHDC3LQ587J8 CSPG5-203ENST00000456150 2089 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
KHDC3LQ587J8 FDXR-201ENST00000293195 1875 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
KHDC3LQ587J8 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
KHDC3LQ587J8 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
KHDC3LQ587J8 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
KHDC3LQ587J8 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.89■□□□□ 0.29
KHDC3LQ587J8 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
KHDC3LQ587J8 NUTM2D-201ENST00000381697 3290 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
KHDC3LQ587J8 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
KHDC3LQ587J8 APBB3-203ENST00000357560 2218 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
KHDC3LQ587J8 HOXC6-202ENST00000394331 2943 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
KHDC3LQ587J8 TUBGCP3-204ENST00000464139 2461 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
KHDC3LQ587J8 UCHL5-205ENST00000367454 1815 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
KHDC3LQ587J8 TSPAN3-202ENST00000346495 1647 ntTSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
KHDC3LQ587J8 FHL3-201ENST00000373016 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
KHDC3LQ587J8 KCTD15-202ENST00000430256 2555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
KHDC3LQ587J8 DTNBP1-201ENST00000338950 1880 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
KHDC3LQ587J8 SOX18-201ENST00000340356 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
KHDC3LQ587J8 AP001626.1-201ENST00000424890 2854 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
KHDC3LQ587J8 GATAD1-201ENST00000287957 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
KHDC3LQ587J8 EHBP1-209ENST00000431489 5076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
KHDC3LQ587J8 PRKAR1B-212ENST00000544935 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
KHDC3LQ587J8 INPP5J-203ENST00000401755 1751 ntTSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
KHDC3LQ587J8 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
KHDC3LQ587J8 BRSK1-201ENST00000309383 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
KHDC3LQ587J8 PITX2-201ENST00000306732 2320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
KHDC3LQ587J8 MOGS-201ENST00000233616 2895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
KHDC3LQ587J8 PIAS2-203ENST00000545673 1590 ntTSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
KHDC3LQ587J8 FIP1L1-201ENST00000306932 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
KHDC3LQ587J8 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
KHDC3LQ587J8 TXNRD3-204ENST00000640433 1932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
KHDC3LQ587J8 CACNA1A-246ENST00000637736 8340 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
KHDC3LQ587J8 LARGE2-202ENST00000401752 2516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
KHDC3LQ587J8 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC16.87■□□□□ 0.29
KHDC3LQ587J8 C16orf70-201ENST00000219139 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
KHDC3LQ587J8 NEURL3-201ENST00000310865 1710 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
KHDC3LQ587J8 PMPCB-202ENST00000428154 1714 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
KHDC3LQ587J8 TPD52-209ENST00000518937 2856 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
KHDC3LQ587J8 ADAMTS2-202ENST00000274609 2044 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
KHDC3LQ587J8 AL158151.1-201ENST00000372490 2047 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
KHDC3LQ587J8 PCDHA13-203ENST00000617769 2427 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
KHDC3LQ587J8 XKR6-203ENST00000416569 3382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
KHDC3LQ587J8 SOCS2-201ENST00000340600 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
KHDC3LQ587J8 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
KHDC3LQ587J8 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
KHDC3LQ587J8 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
KHDC3LQ587J8 LRCH4-201ENST00000310300 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
KHDC3LQ587J8 BHLHE22-201ENST00000321870 3262 ntAPPRIS P1 BASIC16.87■□□□□ 0.29
KHDC3LQ587J8 DMWD-202ENST00000377735 3292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
KHDC3LQ587J8 AR-204ENST00000504326 3615 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
KHDC3LQ587J8 SAE1-203ENST00000413379 2313 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
KHDC3LQ587J8 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
KHDC3LQ587J8 RBBP7-202ENST00000380084 2036 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
KHDC3LQ587J8 LTBP3-217ENST00000530785 2461 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
KHDC3LQ587J8 NRG2-202ENST00000289422 2923 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
KHDC3LQ587J8 AL445183.2-201ENST00000439621 1871 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
KHDC3LQ587J8 TDRP-203ENST00000523656 2622 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
KHDC3LQ587J8 PAXIP1-AS1-201ENST00000608317 2256 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
KHDC3LQ587J8 OXCT2P1-201ENST00000447263 1535 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
KHDC3LQ587J8 FAHD1-201ENST00000382666 1964 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
KHDC3LQ587J8 AL034417.2-201ENST00000445300 2044 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
KHDC3LQ587J8 RAB5A-201ENST00000273047 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
KHDC3LQ587J8 AOC3-204ENST00000591562 2522 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
KHDC3LQ587J8 CCDC34-202ENST00000328697 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
KHDC3LQ587J8 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
KHDC3LQ587J8 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
KHDC3LQ587J8 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
KHDC3LQ587J8 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC16.86■□□□□ 0.29
KHDC3LQ587J8 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
KHDC3LQ587J8 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
KHDC3LQ587J8 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
KHDC3LQ587J8 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
KHDC3LQ587J8 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
KHDC3LQ587J8 ACAA1-202ENST00000333167 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
KHDC3LQ587J8 GABARAPL3-202ENST00000624044 1851 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
KHDC3LQ587J8 MARK1-203ENST00000402574 5273 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
KHDC3LQ587J8 ADAP1-218ENST00000617043 1946 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
KHDC3LQ587J8 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
KHDC3LQ587J8 ITPKB-203ENST00000429204 6162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
KHDC3LQ587J8 EYA2-210ENST00000611592 2612 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
KHDC3LQ587J8 INPP1-202ENST00000392329 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
KHDC3LQ587J8 C1orf174-201ENST00000361605 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
KHDC3LQ587J8 DET1-201ENST00000268148 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
KHDC3LQ587J8 TSR1-201ENST00000301364 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
KHDC3LQ587J8 MTA1-207ENST00000435036 2888 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
KHDC3LQ587J8 HCN1-202ENST00000634658 4738 ntTSL 3 BASIC16.85■□□□□ 0.29
KHDC3LQ587J8 XBP1-207ENST00000611155 1794 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
KHDC3LQ587J8 CRLF3-201ENST00000324238 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
KHDC3LQ587J8 HSF2BP-201ENST00000291560 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
KHDC3LQ587J8 RHNO1-204ENST00000489288 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
KHDC3LQ587J8 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
KHDC3LQ587J8 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC16.85■□□□□ 0.29
KHDC3LQ587J8 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
KHDC3LQ587J8 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
KHDC3LQ587J8 GPR108-201ENST00000264080 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
KHDC3LQ587J8 PRICKLE3-206ENST00000599218 2062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
KHDC3LQ587J8 ADGRL1-202ENST00000361434 5610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
KHDC3LQ587J8 CFP-202ENST00000377005 1435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
KHDC3LQ587J8 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.85■□□□□ 0.29
KHDC3LQ587J8 DNASE1L2-203ENST00000564065 2194 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 9.9 ms