Protein–RNA interactions for Protein: Q53S48

ALF, STON1-GTF2A1L readthrough, humanhuman

Predictions only

Length 1,182 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ALFQ53S48 C11orf96-202ENST00000528572 1834 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
ALFQ53S48 FAM19A5-202ENST00000358295 2638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
ALFQ53S48 KCNH6-203ENST00000580652 1703 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
ALFQ53S48 CHRAC1-203ENST00000519533 1678 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
ALFQ53S48 ANKRD28-201ENST00000399451 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
ALFQ53S48 ADRM1-204ENST00000491935 1530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
ALFQ53S48 ENTPD5-206ENST00000556242 1437 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
ALFQ53S48 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC21.91■■□□□ 1.1
ALFQ53S48 SOAT2-201ENST00000301466 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
ALFQ53S48 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
ALFQ53S48 GALNS-213ENST00000569433 723 ntTSL 3 BASIC21.91■■□□□ 1.1
ALFQ53S48 HSD17B14-204ENST00000599157 991 ntTSL 3 BASIC21.91■■□□□ 1.1
ALFQ53S48 GCH1-206ENST00000543643 1897 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
ALFQ53S48 STK25-234ENST00000535007 2459 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
ALFQ53S48 FMR1-AS1-202ENST00000596112 1845 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
ALFQ53S48 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
ALFQ53S48 DISC1-205ENST00000366636 2224 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
ALFQ53S48 FDFT1-201ENST00000220584 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
ALFQ53S48 HLA-DPB1-211ENST00000418931 1560 ntAPPRIS P2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
ALFQ53S48 SEPT5-210ENST00000455784 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
ALFQ53S48 SPI1-202ENST00000378538 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
ALFQ53S48 SOS2-201ENST00000216373 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
ALFQ53S48 C16orf58-209ENST00000567994 1845 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
ALFQ53S48 RHBDD2-201ENST00000006777 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
ALFQ53S48 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
ALFQ53S48 DAZAP1-211ENST00000592522 2157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
ALFQ53S48 LRP5L-203ENST00000444995 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
ALFQ53S48 FXN-202ENST00000396364 980 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
ALFQ53S48 ATPIF1-204ENST00000497986 599 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
ALFQ53S48 SFTPC-205ENST00000521315 1046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
ALFQ53S48 DHRS2-202ENST00000344777 1678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
ALFQ53S48 SLC2A11-202ENST00000316185 1555 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
ALFQ53S48 RUSC1-AS1-203ENST00000450199 1636 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
ALFQ53S48 ME2-206ENST00000638410 2289 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
ALFQ53S48 ME2-210ENST00000639255 2262 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
ALFQ53S48 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
ALFQ53S48 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
ALFQ53S48 PARL-206ENST00000435888 1098 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
ALFQ53S48 AC068385.1-201ENST00000533218 409 ntTSL 3 BASIC21.89■■□□□ 1.09
ALFQ53S48 TRAPPC2L-213ENST00000567895 854 ntTSL 3 BASIC21.89■■□□□ 1.09
ALFQ53S48 TMEM121-201ENST00000392519 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
ALFQ53S48 NAA35-202ENST00000376040 1797 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
ALFQ53S48 TTYH1-203ENST00000376531 1763 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
ALFQ53S48 PACRGL-227ENST00000513459 1773 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
ALFQ53S48 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
ALFQ53S48 NOC4L-201ENST00000330579 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
ALFQ53S48 CYB561D2-205ENST00000425346 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
ALFQ53S48 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
ALFQ53S48 KCNQ5-205ENST00000370398 6345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
ALFQ53S48 FAHD1-202ENST00000382668 1845 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
ALFQ53S48 UBE2D3-201ENST00000321805 1087 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
ALFQ53S48 TESC-206ENST00000541210 936 ntTSL 3 BASIC21.88■■□□□ 1.09
ALFQ53S48 AC104187.1-201ENST00000607510 612 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
ALFQ53S48 MAGIX-207ENST00000615915 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
ALFQ53S48 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
ALFQ53S48 TDRKH-206ENST00000440583 2296 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
ALFQ53S48 SLC12A5-AS1-202ENST00000535913 1957 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
ALFQ53S48 AC091230.1-202ENST00000564823 5356 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
ALFQ53S48 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
ALFQ53S48 IRX4-207ENST00000613726 2403 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
ALFQ53S48 PSMD7-201ENST00000219313 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
ALFQ53S48 CSNK1G3-206ENST00000511130 1356 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
ALFQ53S48 SMPD5-201ENST00000528912 1390 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
ALFQ53S48 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
ALFQ53S48 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
ALFQ53S48 CTU2-202ENST00000453996 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
ALFQ53S48 LARP6-202ENST00000344870 527 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
ALFQ53S48 AC093627.4-202ENST00000479592 591 ntTSL 4 BASIC21.87■■□□□ 1.09
ALFQ53S48 AC011825.4-201ENST00000582233 473 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
ALFQ53S48 DISC1-224ENST00000639374 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
ALFQ53S48 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC21.87■■□□□ 1.09
ALFQ53S48 NARF-202ENST00000345415 1487 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
ALFQ53S48 NFKBIL1-203ENST00000376148 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
ALFQ53S48 CDKN1C-204ENST00000440480 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
ALFQ53S48 MFSD14C-208ENST00000637864 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
ALFQ53S48 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
ALFQ53S48 PEX10-202ENST00000447513 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
ALFQ53S48 NOTUM-201ENST00000409678 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
ALFQ53S48 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
ALFQ53S48 EPO-201ENST00000252723 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
ALFQ53S48 SLC35A3-204ENST00000427993 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
ALFQ53S48 ZNF784-201ENST00000325351 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
ALFQ53S48 PARD3-202ENST00000346874 5894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
ALFQ53S48 PARD3-203ENST00000350537 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
ALFQ53S48 NFKBIB-201ENST00000313582 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
ALFQ53S48 IL15RA-201ENST00000379971 588 ntTSL 3 BASIC21.86■■□□□ 1.09
ALFQ53S48 C19orf12-205ENST00000392278 895 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
ALFQ53S48 MPRIP-203ENST00000395806 527 ntTSL 3 BASIC21.86■■□□□ 1.09
ALFQ53S48 GXYLT1P2-201ENST00000433312 1230 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
ALFQ53S48 ZSWIM7-205ENST00000472495 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
ALFQ53S48 IGFALS-203ENST00000568221 730 ntTSL 4 BASIC21.86■■□□□ 1.09
ALFQ53S48 AC104564.3-201ENST00000582367 638 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
ALFQ53S48 AC022517.1-201ENST00000592429 346 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
ALFQ53S48 PFKFB3-216ENST00000625260 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
ALFQ53S48 MPST-202ENST00000397225 2116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
ALFQ53S48 DTNBP1-201ENST00000338950 1880 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
ALFQ53S48 VPS29-206ENST00000549578 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
ALFQ53S48 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
ALFQ53S48 HNF4A-205ENST00000443598 1603 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
ALFQ53S48 PLK5-202ENST00000454744 1930 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.6 ms