Protein–RNA interactions for Protein: Q53GI3

ZNF394, Zinc finger protein 394, humanhuman

Predictions only

Length 561 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF394Q53GI3 AC018553.2-201ENST00000637770 1064 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
ZNF394Q53GI3 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
ZNF394Q53GI3 NDUFB2-212ENST00000476279 1666 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
ZNF394Q53GI3 ILKAP-211ENST00000612675 1335 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
ZNF394Q53GI3 GUSB-201ENST00000304895 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
ZNF394Q53GI3 PROSER2-205ENST00000622831 1646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
ZNF394Q53GI3 ADAMTS13-204ENST00000371911 1155 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
ZNF394Q53GI3 FOXB2-201ENST00000376708 1299 ntAPPRIS P1 BASIC22.76■■□□□ 1.23
ZNF394Q53GI3 LRRC3C-201ENST00000377924 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
ZNF394Q53GI3 AC093817.1-201ENST00000507296 812 ntTSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
ZNF394Q53GI3 AL390816.2-201ENST00000554252 737 ntTSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
ZNF394Q53GI3 AC087623.3-201ENST00000607047 1098 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
ZNF394Q53GI3 CNTFR-202ENST00000378980 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
ZNF394Q53GI3 CBLN3-201ENST00000267406 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
ZNF394Q53GI3 TPST1-201ENST00000304842 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
ZNF394Q53GI3 ORAI1-202ENST00000617316 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
ZNF394Q53GI3 HERC2P8-204ENST00000567073 1988 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
ZNF394Q53GI3 POTEC-204ENST00000620346 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
ZNF394Q53GI3 NAA35-202ENST00000376040 1797 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
ZNF394Q53GI3 PFKFB3-216ENST00000625260 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
ZNF394Q53GI3 RASD1-202ENST00000579152 1404 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
ZNF394Q53GI3 LAMP5-AS1-201ENST00000443469 1928 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
ZNF394Q53GI3 MPST-205ENST00000404802 1453 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
ZNF394Q53GI3 WWC2-AS2-201ENST00000578387 2183 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
ZNF394Q53GI3 SLC18A3-201ENST00000374115 2420 ntAPPRIS P1 BASIC22.75■■□□□ 1.23
ZNF394Q53GI3 PHLDA3-201ENST00000367309 896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
ZNF394Q53GI3 RNF208-202ENST00000392827 1135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
ZNF394Q53GI3 FNDC3B-204ENST00000421757 946 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
ZNF394Q53GI3 AC026271.2-201ENST00000428091 497 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
ZNF394Q53GI3 AC097381.1-201ENST00000429019 1296 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
ZNF394Q53GI3 STEAP2-204ENST00000394626 2456 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
ZNF394Q53GI3 GFRA3-201ENST00000274721 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
ZNF394Q53GI3 CCDC38-201ENST00000344280 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
ZNF394Q53GI3 GJB6-203ENST00000400065 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
ZNF394Q53GI3 RPS6-203ENST00000380384 1355 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
ZNF394Q53GI3 PSPH-202ENST00000395471 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
ZNF394Q53GI3 AC079328.2-202ENST00000560903 1410 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
ZNF394Q53GI3 AC138649.1-201ENST00000619611 1449 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
ZNF394Q53GI3 TRIM54-202ENST00000380075 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
ZNF394Q53GI3 LRP5L-203ENST00000444995 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
ZNF394Q53GI3 MIR31HG-201ENST00000304425 745 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
ZNF394Q53GI3 ASMT-202ENST00000381233 989 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
ZNF394Q53GI3 P2RY2-203ENST00000393597 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
ZNF394Q53GI3 TERF1P2-201ENST00000583350 1212 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
ZNF394Q53GI3 AC008105.3-201ENST00000586376 844 ntTSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
ZNF394Q53GI3 MIR6821-201ENST00000617625 74 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
ZNF394Q53GI3 PGRMC2-201ENST00000296425 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
ZNF394Q53GI3 GTPBP6-201ENST00000326153 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
ZNF394Q53GI3 CACNB3-205ENST00000547392 2237 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
ZNF394Q53GI3 CENPB-201ENST00000379751 2840 ntAPPRIS P1 BASIC22.74■■□□□ 1.23
ZNF394Q53GI3 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
ZNF394Q53GI3 GPR35-204ENST00000430267 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
ZNF394Q53GI3 ANO8-201ENST00000159087 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
ZNF394Q53GI3 SPHK1-202ENST00000392496 1779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
ZNF394Q53GI3 SPTBN4-203ENST00000392023 2419 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
ZNF394Q53GI3 CDKN1C-204ENST00000440480 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
ZNF394Q53GI3 TMEM200B-201ENST00000420504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
ZNF394Q53GI3 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
ZNF394Q53GI3 BID-212ENST00000614949 1988 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
ZNF394Q53GI3 NEURL4-202ENST00000399464 5200 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
ZNF394Q53GI3 DCTN3-202ENST00000341694 899 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
ZNF394Q53GI3 DCTN3-205ENST00000378916 773 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
ZNF394Q53GI3 CALM1-202ENST00000447653 1104 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
ZNF394Q53GI3 CHTF8-210ENST00000523421 766 ntTSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
ZNF394Q53GI3 KRT18P14-201ENST00000534205 1250 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
ZNF394Q53GI3 PLD4-205ENST00000553861 667 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
ZNF394Q53GI3 GLI4-201ENST00000340042 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
ZNF394Q53GI3 TSPAN17-207ENST00000508164 2457 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
ZNF394Q53GI3 MEF2A-207ENST00000558812 2186 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
ZNF394Q53GI3 MFSD14C-208ENST00000637864 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
ZNF394Q53GI3 MEIS3-212ENST00000561293 1918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
ZNF394Q53GI3 DGKQ-201ENST00000273814 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
ZNF394Q53GI3 CBWD3-202ENST00000377342 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
ZNF394Q53GI3 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
ZNF394Q53GI3 SMURF1-201ENST00000361125 5737 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
ZNF394Q53GI3 PDXK-205ENST00000398081 2251 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
ZNF394Q53GI3 TTYH1-203ENST00000376531 1763 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
ZNF394Q53GI3 TMEM61-201ENST00000371268 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
ZNF394Q53GI3 AL137779.2-201ENST00000554859 448 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
ZNF394Q53GI3 AP003071.3-201ENST00000562506 366 ntTSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
ZNF394Q53GI3 RNF114-202ENST00000622920 1284 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
ZNF394Q53GI3 AL831711.1-201ENST00000636824 569 ntTSL 4 BASIC22.72■■□□□ 1.23
ZNF394Q53GI3 UCK2-201ENST00000367879 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
ZNF394Q53GI3 SH2B1-204ENST00000395532 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
ZNF394Q53GI3 MPPED1-203ENST00000443721 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
ZNF394Q53GI3 DCAF8-211ENST00000475733 1426 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
ZNF394Q53GI3 SARDH-203ENST00000371868 2266 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
ZNF394Q53GI3 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
ZNF394Q53GI3 DHRS2-202ENST00000344777 1678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
ZNF394Q53GI3 IFNGR2-203ENST00000405436 1684 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
ZNF394Q53GI3 CHADL-201ENST00000216241 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
ZNF394Q53GI3 SEPT5-210ENST00000455784 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
ZNF394Q53GI3 HACD1-201ENST00000326961 773 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
ZNF394Q53GI3 RORB-AS1-201ENST00000417576 1178 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
ZNF394Q53GI3 AC079140.4-201ENST00000507448 529 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
ZNF394Q53GI3 CPT2-209ENST00000636935 803 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
ZNF394Q53GI3 AP004608.1-201ENST00000531319 1402 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
ZNF394Q53GI3 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
ZNF394Q53GI3 B4GALNT1-203ENST00000449184 1633 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
ZNF394Q53GI3 KCNH6-203ENST00000580652 1703 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.8 ms