Protein–RNA interactions for Protein: Q53G59

KLHL12, Kelch-like protein 12, humanhuman

Predictions only

Length 568 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLHL12Q53G59 FFAR1-201ENST00000246553 2311 ntAPPRIS P1 BASIC19.24■□□□□ 0.67
KLHL12Q53G59 CDV3-201ENST00000264993 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
KLHL12Q53G59 RAI14-201ENST00000265109 5092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
KLHL12Q53G59 GRTP1-202ENST00000375430 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
KLHL12Q53G59 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
KLHL12Q53G59 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
KLHL12Q53G59 EZH2-201ENST00000320356 2639 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
KLHL12Q53G59 ULK1-201ENST00000321867 5310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
KLHL12Q53G59 GLT1D1-204ENST00000442111 2995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
KLHL12Q53G59 USP48-201ENST00000308271 4595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
KLHL12Q53G59 RAP2C-202ENST00000370874 2333 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
KLHL12Q53G59 ZNF446-208ENST00000622313 1884 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
KLHL12Q53G59 KLHDC1-201ENST00000359332 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
KLHL12Q53G59 DOCK9-206ENST00000427887 4176 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
KLHL12Q53G59 GPSM1-201ENST00000291775 2114 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
KLHL12Q53G59 UNC119-201ENST00000301032 1653 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
KLHL12Q53G59 PRSS33-202ENST00000570702 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
KLHL12Q53G59 EEF1D-246ENST00000532741 2387 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
KLHL12Q53G59 CCDC88B-203ENST00000359902 2326 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
KLHL12Q53G59 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
KLHL12Q53G59 DYRK3-202ENST00000367108 2218 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
KLHL12Q53G59 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
KLHL12Q53G59 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
KLHL12Q53G59 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
KLHL12Q53G59 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
KLHL12Q53G59 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC19.23■□□□□ 0.67
KLHL12Q53G59 AC104564.3-201ENST00000582367 638 ntBASIC19.23■□□□□ 0.67
KLHL12Q53G59 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
KLHL12Q53G59 PPTC7-201ENST00000354300 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
KLHL12Q53G59 ERI3-201ENST00000372257 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
KLHL12Q53G59 ZNF707-201ENST00000358656 2183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
KLHL12Q53G59 EHBP1-209ENST00000431489 5076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
KLHL12Q53G59 LINC01011-201ENST00000445000 2811 ntTSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
KLHL12Q53G59 PPP1R12B-212ENST00000480184 1808 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
KLHL12Q53G59 MIS18A-201ENST00000290130 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
KLHL12Q53G59 ZNRF3-203ENST00000544604 6851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
KLHL12Q53G59 CPEB1-AS1-201ENST00000560650 2138 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
KLHL12Q53G59 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
KLHL12Q53G59 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
KLHL12Q53G59 CHN1-203ENST00000409156 1761 ntTSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
KLHL12Q53G59 KCTD13-202ENST00000561540 1773 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
KLHL12Q53G59 FRMD3-204ENST00000376438 2198 ntTSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
KLHL12Q53G59 UCHL5-201ENST00000367448 1534 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
KLHL12Q53G59 PRICKLE3-206ENST00000599218 2062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
KLHL12Q53G59 PGF-201ENST00000238607 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.22■□□□□ 0.67
KLHL12Q53G59 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.22■□□□□ 0.67
KLHL12Q53G59 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC19.22■□□□□ 0.67
KLHL12Q53G59 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
KLHL12Q53G59 C22orf34-203ENST00000405854 1593 ntTSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
KLHL12Q53G59 CCDC106-207ENST00000591578 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
KLHL12Q53G59 MARK1-205ENST00000611084 5321 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
KLHL12Q53G59 RPS6KL1-216ENST00000557413 2425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
KLHL12Q53G59 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
KLHL12Q53G59 CCDC102A-201ENST00000258214 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
KLHL12Q53G59 ZFP64-206ENST00000371523 2234 ntTSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
KLHL12Q53G59 PDLIM3-203ENST00000284771 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
KLHL12Q53G59 LINC01123-202ENST00000419296 2436 ntTSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
KLHL12Q53G59 SLC1A6-203ENST00000544886 2420 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
KLHL12Q53G59 ZNF467-201ENST00000302017 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
KLHL12Q53G59 PPP1CC-201ENST00000335007 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
KLHL12Q53G59 ESR2-204ENST00000353772 2454 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
KLHL12Q53G59 TANGO2-202ENST00000398042 2011 ntTSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
KLHL12Q53G59 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
KLHL12Q53G59 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC19.21■□□□□ 0.67
KLHL12Q53G59 AC084116.4-201ENST00000524320 484 ntTSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
KLHL12Q53G59 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC19.21■□□□□ 0.67
KLHL12Q53G59 CDK5R2-201ENST00000302625 2508 ntAPPRIS P1 BASIC19.21■□□□□ 0.67
KLHL12Q53G59 KLC2-207ENST00000421552 2721 ntTSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
KLHL12Q53G59 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
KLHL12Q53G59 CPNE7-202ENST00000319518 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
KLHL12Q53G59 IKBKG-206ENST00000594239 2299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
KLHL12Q53G59 MFSD14C-208ENST00000637864 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
KLHL12Q53G59 TMEM44-204ENST00000392432 2490 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
KLHL12Q53G59 LINC00094-201ENST00000432807 2300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
KLHL12Q53G59 HAUS7-202ENST00000370211 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
KLHL12Q53G59 RHOBTB2-201ENST00000251822 5451 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
KLHL12Q53G59 JAKMIP1-201ENST00000282924 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
KLHL12Q53G59 ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 1409 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
KLHL12Q53G59 PFKFB3-216ENST00000625260 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
KLHL12Q53G59 AL121749.1-201ENST00000635993 1768 ntTSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
KLHL12Q53G59 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC19.2■□□□□ 0.66
KLHL12Q53G59 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
KLHL12Q53G59 AC010336.5-201ENST00000594308 317 ntTSL 3 BASIC19.2■□□□□ 0.66
KLHL12Q53G59 PMPCA-203ENST00000399219 1987 ntTSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
KLHL12Q53G59 STX4-202ENST00000394998 1498 ntTSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
KLHL12Q53G59 CACNA1B-206ENST00000371372 9790 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
KLHL12Q53G59 ZFP92-201ENST00000338647 6105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
KLHL12Q53G59 KDM5C-203ENST00000375383 5122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
KLHL12Q53G59 EXOC3L2-202ENST00000413988 2964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
KLHL12Q53G59 CLK3-202ENST00000395066 2621 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
KLHL12Q53G59 NSUN2-206ENST00000506139 2619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
KLHL12Q53G59 KLHL29-203ENST00000486442 5287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
KLHL12Q53G59 PIAS2-203ENST00000545673 1590 ntTSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
KLHL12Q53G59 WNT10A-201ENST00000258411 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
KLHL12Q53G59 WNK2-204ENST00000427277 6108 ntTSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
KLHL12Q53G59 LMAN2-201ENST00000303127 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
KLHL12Q53G59 EED-201ENST00000263360 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
KLHL12Q53G59 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC19.19■□□□□ 0.66
KLHL12Q53G59 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
KLHL12Q53G59 UBA5-211ENST00000493720 2058 ntTSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.2 ms