Protein–RNA interactions for Protein: Q4ZHG4

FNDC1, Fibronectin type III domain-containing protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,894 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FNDC1Q4ZHG4 SEC23A-213ENST00000557280 561 ntTSL 4 BASIC22.94■■□□□ 1.26
FNDC1Q4ZHG4 NDUFB10-204ENST00000569148 628 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
FNDC1Q4ZHG4 TXNL4A-203ENST00000585474 1185 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
FNDC1Q4ZHG4 AC083880.1-201ENST00000608266 535 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
FNDC1Q4ZHG4 AC133041.1-202ENST00000642053 222 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
FNDC1Q4ZHG4 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
FNDC1Q4ZHG4 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
FNDC1Q4ZHG4 GRTP1-203ENST00000375431 1384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
FNDC1Q4ZHG4 SPINT2-202ENST00000454580 1367 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
FNDC1Q4ZHG4 NABP2-203ENST00000380198 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
FNDC1Q4ZHG4 AC009086.2-201ENST00000449759 610 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.94■■□□□ 1.26
FNDC1Q4ZHG4 ELOVL2-AS1-201ENST00000456190 737 ntTSL 3 BASIC22.94■■□□□ 1.26
FNDC1Q4ZHG4 AC008443.6-201ENST00000512508 500 ntTSL 4 BASIC22.94■■□□□ 1.26
FNDC1Q4ZHG4 TUSC3-203ENST00000503731 1498 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
FNDC1Q4ZHG4 STEAP1-201ENST00000297205 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
FNDC1Q4ZHG4 BST1-202ENST00000382346 1993 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
FNDC1Q4ZHG4 SNRK-203ENST00000437827 1995 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
FNDC1Q4ZHG4 HAUS4-205ENST00000541587 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
FNDC1Q4ZHG4 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
FNDC1Q4ZHG4 AC080112.2-201ENST00000578774 2094 ntTSL 4 BASIC22.93■■□□□ 1.26
FNDC1Q4ZHG4 TOX2-201ENST00000341197 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
FNDC1Q4ZHG4 LINC01191-201ENST00000412690 844 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
FNDC1Q4ZHG4 UMAD1-202ENST00000463725 559 ntTSL 4 BASIC22.93■■□□□ 1.26
FNDC1Q4ZHG4 RNA5SP413-201ENST00000516373 109 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
FNDC1Q4ZHG4 AL390816.2-201ENST00000554252 737 ntTSL 3 BASIC22.93■■□□□ 1.26
FNDC1Q4ZHG4 CHEK2P2-202ENST00000555186 864 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
FNDC1Q4ZHG4 ALDH3A2-224ENST00000626500 995 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
FNDC1Q4ZHG4 WDR86-207ENST00000621812 1542 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
FNDC1Q4ZHG4 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
FNDC1Q4ZHG4 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
FNDC1Q4ZHG4 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
FNDC1Q4ZHG4 PACRGL-227ENST00000513459 1773 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
FNDC1Q4ZHG4 ALKBH6-212ENST00000485128 959 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
FNDC1Q4ZHG4 CIRBP-246ENST00000628979 1043 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
FNDC1Q4ZHG4 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
FNDC1Q4ZHG4 FMR1-202ENST00000334557 1295 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
FNDC1Q4ZHG4 SERTAD4-AS1-201ENST00000437764 726 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
FNDC1Q4ZHG4 MAGIX-202ENST00000595224 1238 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
FNDC1Q4ZHG4 AP2S1-207ENST00000599990 829 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
FNDC1Q4ZHG4 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
FNDC1Q4ZHG4 TPD52L1-203ENST00000368402 1308 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
FNDC1Q4ZHG4 DHRS2-202ENST00000344777 1678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
FNDC1Q4ZHG4 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
FNDC1Q4ZHG4 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
FNDC1Q4ZHG4 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
FNDC1Q4ZHG4 FASTK-217ENST00000540185 1609 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
FNDC1Q4ZHG4 EIF4E3-203ENST00000421769 777 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
FNDC1Q4ZHG4 PPP1R14BP2-201ENST00000426284 444 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
FNDC1Q4ZHG4 OR10C1-204ENST00000622521 1039 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
FNDC1Q4ZHG4 AL160396.2-202ENST00000636692 566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
FNDC1Q4ZHG4 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
FNDC1Q4ZHG4 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
FNDC1Q4ZHG4 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
FNDC1Q4ZHG4 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
FNDC1Q4ZHG4 EMC6-202ENST00000397133 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
FNDC1Q4ZHG4 PSME3-210ENST00000590720 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
FNDC1Q4ZHG4 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
FNDC1Q4ZHG4 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
FNDC1Q4ZHG4 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
FNDC1Q4ZHG4 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
FNDC1Q4ZHG4 SOX18-201ENST00000340356 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
FNDC1Q4ZHG4 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
FNDC1Q4ZHG4 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
FNDC1Q4ZHG4 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
FNDC1Q4ZHG4 RNPS1-201ENST00000301730 1276 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
FNDC1Q4ZHG4 SPDYE2-201ENST00000341656 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
FNDC1Q4ZHG4 SPDYE2B-202ENST00000455020 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
FNDC1Q4ZHG4 AP000785.1-201ENST00000527314 613 ntTSL 4 BASIC22.9■■□□□ 1.26
FNDC1Q4ZHG4 PTGER2-202ENST00000557436 643 ntTSL 3 BASIC22.9■■□□□ 1.26
FNDC1Q4ZHG4 MIF4GD-202ENST00000325102 1306 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
FNDC1Q4ZHG4 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.26
FNDC1Q4ZHG4 MTHFS-201ENST00000258874 907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
FNDC1Q4ZHG4 MFSD3-201ENST00000301327 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
FNDC1Q4ZHG4 ZNF784-201ENST00000325351 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
FNDC1Q4ZHG4 AVPR2-201ENST00000337474 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
FNDC1Q4ZHG4 GPR143-203ENST00000467482 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
FNDC1Q4ZHG4 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
FNDC1Q4ZHG4 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
FNDC1Q4ZHG4 KRT16P2-201ENST00000414673 1423 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
FNDC1Q4ZHG4 MMP23B-201ENST00000356026 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
FNDC1Q4ZHG4 FAM229A-204ENST00000432622 699 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
FNDC1Q4ZHG4 LINC02199-202ENST00000510067 1008 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
FNDC1Q4ZHG4 SNHG6-203ENST00000520944 638 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
FNDC1Q4ZHG4 DHPS-223ENST00000614126 1124 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
FNDC1Q4ZHG4 ADD3-AS1-204ENST00000627565 388 ntTSL 3 BASIC22.88■■□□□ 1.25
FNDC1Q4ZHG4 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
FNDC1Q4ZHG4 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
FNDC1Q4ZHG4 TMEM176B-203ENST00000434545 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
FNDC1Q4ZHG4 PRR7-202ENST00000502922 1345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
FNDC1Q4ZHG4 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
FNDC1Q4ZHG4 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
FNDC1Q4ZHG4 FP565260.3-201ENST00000612610 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
FNDC1Q4ZHG4 AC008175.2-201ENST00000612840 297 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
FNDC1Q4ZHG4 ITM2C-210ENST00000620962 501 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
FNDC1Q4ZHG4 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
FNDC1Q4ZHG4 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
FNDC1Q4ZHG4 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
FNDC1Q4ZHG4 POU5F1P3-201ENST00000428824 1078 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
FNDC1Q4ZHG4 TMEM179B-205ENST00000533861 797 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
FNDC1Q4ZHG4 PLEKHJ1-205ENST00000587394 937 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.9 ms