Protein–RNA interactions for Protein: Q4G0U5

CFAP221, Cilia- and flagella-associated protein 221, humanhuman

Predictions only

Length 840 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CFAP221Q4G0U5 PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 1133 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
CFAP221Q4G0U5 ZNF696-205ENST00000521537 705 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
CFAP221Q4G0U5 AP2S1-203ENST00000593442 636 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
CFAP221Q4G0U5 PLEKHO1-201ENST00000369124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
CFAP221Q4G0U5 OXCT2P1-201ENST00000447263 1535 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
CFAP221Q4G0U5 AC090377.1-201ENST00000585691 1762 ntTSL 3 BASIC23.11■■□□□ 1.29
CFAP221Q4G0U5 NTN1-201ENST00000173229 5954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
CFAP221Q4G0U5 AZIN2-204ENST00000373443 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
CFAP221Q4G0U5 ZYG11B-202ENST00000545132 2294 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
CFAP221Q4G0U5 GPSM1-206ENST00000616132 2270 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
CFAP221Q4G0U5 LONP1-203ENST00000585374 2882 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
CFAP221Q4G0U5 DNAJA4-202ENST00000394852 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
CFAP221Q4G0U5 RAB24-201ENST00000303251 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
CFAP221Q4G0U5 PARD3-214ENST00000545693 5962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
CFAP221Q4G0U5 DRD2-202ENST00000362072 2789 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
CFAP221Q4G0U5 CCDC130-201ENST00000221554 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
CFAP221Q4G0U5 ANKRD19P-205ENST00000473204 2370 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
CFAP221Q4G0U5 URAD-201ENST00000332715 931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
CFAP221Q4G0U5 FAM219A-202ENST00000379078 770 ntTSL 3 BASIC23.1■■□□□ 1.29
CFAP221Q4G0U5 AL162430.1-201ENST00000480705 870 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
CFAP221Q4G0U5 AC093817.1-201ENST00000507296 812 ntTSL 3 BASIC23.1■■□□□ 1.29
CFAP221Q4G0U5 SLC12A5-217ENST00000626937 1224 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
CFAP221Q4G0U5 PABPC1L2A-201ENST00000373519 2237 ntAPPRIS P1 BASIC23.1■■□□□ 1.29
CFAP221Q4G0U5 PTDSS2-201ENST00000308020 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
CFAP221Q4G0U5 PDLIM3-203ENST00000284771 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
CFAP221Q4G0U5 KREMEN2-203ENST00000571007 1877 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
CFAP221Q4G0U5 DACT1-204ENST00000541264 2610 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
CFAP221Q4G0U5 THEM6-201ENST00000336138 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
CFAP221Q4G0U5 PALM-208ENST00000592155 2272 ntTSL 4 BASIC23.09■■□□□ 1.29
CFAP221Q4G0U5 PYY-201ENST00000360085 1053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
CFAP221Q4G0U5 PCMT1-201ENST00000367378 1293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
CFAP221Q4G0U5 MFSD14C-201ENST00000375223 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
CFAP221Q4G0U5 FAM219A-205ENST00000379084 893 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
CFAP221Q4G0U5 AC034268.1-201ENST00000441047 882 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
CFAP221Q4G0U5 LINC01942-201ENST00000521373 513 ntTSL 4 BASIC23.09■■□□□ 1.29
CFAP221Q4G0U5 PTGDR-202ENST00000553372 1216 ntTSL 3 BASIC23.09■■□□□ 1.29
CFAP221Q4G0U5 PYCARD-AS1-201ENST00000561916 1095 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
CFAP221Q4G0U5 SPN-202ENST00000395389 1935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
CFAP221Q4G0U5 SEC22C-207ENST00000423701 1458 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
CFAP221Q4G0U5 CARM1-201ENST00000327064 3330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
CFAP221Q4G0U5 ATP8A1-207ENST00000510289 2238 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
CFAP221Q4G0U5 TRIM3-214ENST00000536344 2704 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
CFAP221Q4G0U5 ACHE-201ENST00000241069 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
CFAP221Q4G0U5 DAPK3-202ENST00000545797 2257 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
CFAP221Q4G0U5 SLC41A3-202ENST00000346785 1705 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
CFAP221Q4G0U5 TRADD-202ENST00000486556 1833 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
CFAP221Q4G0U5 DTWD2-203ENST00000510708 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
CFAP221Q4G0U5 PCSK1N-201ENST00000218230 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
CFAP221Q4G0U5 NT5C3AP1-201ENST00000394500 1012 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
CFAP221Q4G0U5 AL831711.1-201ENST00000636824 569 ntTSL 4 BASIC23.08■■□□□ 1.29
CFAP221Q4G0U5 ANKRD11-217ENST00000613312 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
CFAP221Q4G0U5 SPIRE2-202ENST00000393062 2172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
CFAP221Q4G0U5 CYHR1-201ENST00000306145 1409 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
CFAP221Q4G0U5 CDCP1-202ENST00000425231 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
CFAP221Q4G0U5 NRXN2-203ENST00000377551 6373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
CFAP221Q4G0U5 CDK5-204ENST00000485972 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
CFAP221Q4G0U5 EIF2B4-211ENST00000616081 1754 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
CFAP221Q4G0U5 CCNG2-204ENST00000502280 1459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
CFAP221Q4G0U5 LINC02228-203ENST00000641970 1355 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
CFAP221Q4G0U5 MPC1-202ENST00000360961 962 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
CFAP221Q4G0U5 MOSPD3-202ENST00000379527 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
CFAP221Q4G0U5 LRRC37A17P-202ENST00000570478 572 ntTSL 4 BASIC23.07■■□□□ 1.28
CFAP221Q4G0U5 AC104564.3-201ENST00000582367 638 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
CFAP221Q4G0U5 TBC1D22A-206ENST00000407381 1949 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
CFAP221Q4G0U5 CKMT1B-207ENST00000441322 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
CFAP221Q4G0U5 FMR1-201ENST00000218200 4333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
CFAP221Q4G0U5 CHST7-201ENST00000276055 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
CFAP221Q4G0U5 CPEB1-218ENST00000620182 2422 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
CFAP221Q4G0U5 SMUG1-215ENST00000508394 1697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
CFAP221Q4G0U5 FBXO17-201ENST00000292852 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
CFAP221Q4G0U5 ANKRD13D-202ENST00000447274 2881 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
CFAP221Q4G0U5 STK11-205ENST00000586243 2777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
CFAP221Q4G0U5 NXT1-201ENST00000254998 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
CFAP221Q4G0U5 TUSC3-209ENST00000509380 1266 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
CFAP221Q4G0U5 TMEM70-203ENST00000517439 617 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
CFAP221Q4G0U5 DUX4L2-201ENST00000561772 1275 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
CFAP221Q4G0U5 TERF1P2-201ENST00000583350 1212 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
CFAP221Q4G0U5 SMUG1P1-201ENST00000590640 811 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
CFAP221Q4G0U5 CTAG1A-201ENST00000593606 993 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
CFAP221Q4G0U5 DUX4-206ENST00000616166 1275 ntAPPRIS P2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
CFAP221Q4G0U5 DUX4L6-201ENST00000626483 1275 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
CFAP221Q4G0U5 DUX4L1-201ENST00000627662 1275 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
CFAP221Q4G0U5 DUX4L8-201ENST00000629013 1275 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
CFAP221Q4G0U5 DUX4L3-201ENST00000630187 1275 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
CFAP221Q4G0U5 DUX4L7-201ENST00000630678 1275 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
CFAP221Q4G0U5 DUX4L5-201ENST00000630834 1275 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
CFAP221Q4G0U5 ARRB2-201ENST00000269260 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
CFAP221Q4G0U5 GPR143-203ENST00000467482 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
CFAP221Q4G0U5 KLC3-204ENST00000585434 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
CFAP221Q4G0U5 UQCR11-203ENST00000591899 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
CFAP221Q4G0U5 PABPC1L2B-201ENST00000373521 2197 ntAPPRIS P1 BASIC23.06■■□□□ 1.28
CFAP221Q4G0U5 DECR2-201ENST00000219481 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
CFAP221Q4G0U5 LINC01960-201ENST00000563759 1884 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
CFAP221Q4G0U5 FAM20C-201ENST00000313766 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
CFAP221Q4G0U5 AC138028.2-201ENST00000440406 1539 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
CFAP221Q4G0U5 GFI1-203ENST00000427103 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
CFAP221Q4G0U5 PRR25-201ENST00000301698 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
CFAP221Q4G0U5 HACD1-201ENST00000326961 773 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
CFAP221Q4G0U5 CCDC92B-201ENST00000575506 885 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
CFAP221Q4G0U5 NKX6-1-202ENST00000515820 2194 ntTSL 3 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.7 ms