Protein–RNA interactions for Protein: Q30201

HFE, Hereditary hemochromatosis protein, humanhuman

Predictions only

Length 348 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HFEQ30201 KIF12-207ENST00000640217 2194 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
HFEQ30201 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
HFEQ30201 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
HFEQ30201 SEC22C-207ENST00000423701 1458 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
HFEQ30201 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.53
HFEQ30201 RAB24-201ENST00000303251 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
HFEQ30201 CT47B1-201ENST00000371311 1328 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.53
HFEQ30201 URAD-201ENST00000332715 931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
HFEQ30201 GDNF-203ENST00000381826 778 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
HFEQ30201 GDNF-204ENST00000427982 856 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
HFEQ30201 RAB43-208ENST00000615093 783 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
HFEQ30201 POLR2E-214ENST00000619917 932 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
HFEQ30201 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
HFEQ30201 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
HFEQ30201 ABCG4-204ENST00000615496 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
HFEQ30201 PRMT5-204ENST00000397441 2418 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
HFEQ30201 TTC7A-201ENST00000319190 5157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
HFEQ30201 CDK13-207ENST00000613626 3099 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
HFEQ30201 STAP2-206ENST00000600324 1508 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
HFEQ30201 SAP30L-201ENST00000297109 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
HFEQ30201 C7orf26-201ENST00000344417 2182 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
HFEQ30201 DAZAP1-211ENST00000592522 2157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
HFEQ30201 KCTD13-207ENST00000568000 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
HFEQ30201 CDC42BPB-201ENST00000361246 6758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
HFEQ30201 SLC35A3-204ENST00000427993 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
HFEQ30201 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
HFEQ30201 REV1-201ENST00000258428 4751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
HFEQ30201 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
HFEQ30201 KLF9-201ENST00000377126 5175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
HFEQ30201 MFSD14C-201ENST00000375223 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
HFEQ30201 ORMDL1-202ENST00000392349 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
HFEQ30201 AC019068.1-201ENST00000415226 552 ntTSL 4 BASIC18.32■□□□□ 0.52
HFEQ30201 PYCARD-AS1-201ENST00000561916 1095 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
HFEQ30201 CTAG1A-201ENST00000593606 993 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
HFEQ30201 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
HFEQ30201 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
HFEQ30201 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
HFEQ30201 TMCC2-209ENST00000637895 1455 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
HFEQ30201 SMURF1-202ENST00000361368 5581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
HFEQ30201 C19orf35-201ENST00000342063 2574 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
HFEQ30201 PDLIM3-203ENST00000284771 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
HFEQ30201 ST8SIA2-201ENST00000268164 5708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
HFEQ30201 IQCJ-SCHIP1-204ENST00000485419 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
HFEQ30201 MFSD7-203ENST00000404286 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
HFEQ30201 MOSPD3-202ENST00000379527 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
HFEQ30201 PARL-206ENST00000435888 1098 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
HFEQ30201 ZNF511-202ENST00000361518 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
HFEQ30201 BX005040.4-201ENST00000637145 1518 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
HFEQ30201 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
HFEQ30201 GRIK4-205ENST00000527524 5861 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
HFEQ30201 NOS3-204ENST00000467517 2377 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
HFEQ30201 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
HFEQ30201 TAF6L-201ENST00000294168 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
HFEQ30201 BHLHA9-201ENST00000391429 902 ntAPPRIS P1 BASIC18.3■□□□□ 0.52
HFEQ30201 LINC01942-201ENST00000521373 513 ntTSL 4 BASIC18.3■□□□□ 0.52
HFEQ30201 SMUG1P1-201ENST00000590640 811 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
HFEQ30201 TMEM44-204ENST00000392432 2490 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
HFEQ30201 CYHR1-201ENST00000306145 1409 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
HFEQ30201 DECR2-201ENST00000219481 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
HFEQ30201 ZNF467-201ENST00000302017 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
HFEQ30201 SAMD10-201ENST00000369886 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
HFEQ30201 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
HFEQ30201 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
HFEQ30201 AVPR2-203ENST00000370049 1307 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
HFEQ30201 NXT1-201ENST00000254998 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
HFEQ30201 PRR25-201ENST00000301698 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
HFEQ30201 TESC-201ENST00000335209 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
HFEQ30201 C16orf86-201ENST00000403458 1267 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
HFEQ30201 ZNF696-205ENST00000521537 705 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
HFEQ30201 AC104564.3-201ENST00000582367 638 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
HFEQ30201 NPY4R-201ENST00000374312 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
HFEQ30201 NPY4R2-201ENST00000576178 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
HFEQ30201 SAXO1-201ENST00000380530 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
HFEQ30201 TRIM46-204ENST00000368385 1864 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
HFEQ30201 RUNDC3B-207ENST00000493037 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
HFEQ30201 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
HFEQ30201 DOK3-201ENST00000312943 2292 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
HFEQ30201 RBPJL-202ENST00000372741 1636 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
HFEQ30201 C1QL1-201ENST00000253407 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
HFEQ30201 PYY-201ENST00000360085 1053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
HFEQ30201 FAM219A-205ENST00000379084 893 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
HFEQ30201 ASMT-202ENST00000381233 989 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
HFEQ30201 RNF208-201ENST00000391553 1077 ntAPPRIS P1 BASIC18.28■□□□□ 0.52
HFEQ30201 RNF208-202ENST00000392827 1135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
HFEQ30201 SPOCK2-203ENST00000412663 1284 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
HFEQ30201 AL162430.1-201ENST00000480705 870 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
HFEQ30201 AC093817.1-201ENST00000507296 812 ntTSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
HFEQ30201 TMEM70-203ENST00000517439 617 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
HFEQ30201 SLC25A45-206ENST00000526432 894 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
HFEQ30201 AP001005.4-202ENST00000575325 560 ntTSL 4 BASIC18.28■□□□□ 0.52
HFEQ30201 AC004528.2-201ENST00000610701 440 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
HFEQ30201 SLC12A5-217ENST00000626937 1224 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
HFEQ30201 CDCP1-202ENST00000425231 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
HFEQ30201 HNRNPLL-203ENST00000378915 2523 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
HFEQ30201 ADAP2-204ENST00000580525 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
HFEQ30201 CADPS-202ENST00000357948 5190 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
HFEQ30201 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
HFEQ30201 DUSP9-202ENST00000370167 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
HFEQ30201 PLEKHH3-201ENST00000293349 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
HFEQ30201 TMEM250-205ENST00000561457 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.1 ms