Protein–RNA interactions for Protein: Q2Q1W2

TRIM71, E3 ubiquitin-protein ligase TRIM71, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 868 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM71Q2Q1W2 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
TRIM71Q2Q1W2 CDCA4-202ENST00000392590 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
TRIM71Q2Q1W2 ASCL2-201ENST00000331289 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
TRIM71Q2Q1W2 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
TRIM71Q2Q1W2 PPP1CA-202ENST00000358239 1054 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
TRIM71Q2Q1W2 AC105001.1-201ENST00000506149 821 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
TRIM71Q2Q1W2 LINC02199-202ENST00000510067 1008 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
TRIM71Q2Q1W2 LIMD2-206ENST00000578993 602 ntTSL 3 BASIC23.35■■□□□ 1.33
TRIM71Q2Q1W2 ZNF784-201ENST00000325351 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
TRIM71Q2Q1W2 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
TRIM71Q2Q1W2 TOX2-201ENST00000341197 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
TRIM71Q2Q1W2 CASP16P-201ENST00000428155 1433 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
TRIM71Q2Q1W2 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
TRIM71Q2Q1W2 HAUS4-205ENST00000541587 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
TRIM71Q2Q1W2 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
TRIM71Q2Q1W2 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
TRIM71Q2Q1W2 RARRES2-201ENST00000223271 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
TRIM71Q2Q1W2 CUEDC2-201ENST00000369937 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
TRIM71Q2Q1W2 NAA60-204ENST00000421765 1045 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
TRIM71Q2Q1W2 AC025754.1-201ENST00000507566 407 ntTSL 3 BASIC23.34■■□□□ 1.33
TRIM71Q2Q1W2 COX6C-208ENST00000522940 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.34■■□□□ 1.33
TRIM71Q2Q1W2 ZNF263-205ENST00000574253 1139 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
TRIM71Q2Q1W2 CIRBP-211ENST00000586773 942 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
TRIM71Q2Q1W2 AC069236.1-201ENST00000604339 616 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
TRIM71Q2Q1W2 AC008175.2-201ENST00000612840 297 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
TRIM71Q2Q1W2 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
TRIM71Q2Q1W2 HSD11B1L-201ENST00000301382 1457 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
TRIM71Q2Q1W2 HLA-DPB1-211ENST00000418931 1560 ntAPPRIS P2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
TRIM71Q2Q1W2 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
TRIM71Q2Q1W2 GPR143-203ENST00000467482 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
TRIM71Q2Q1W2 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
TRIM71Q2Q1W2 C2orf82-203ENST00000409533 561 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC23.33■■□□□ 1.33
TRIM71Q2Q1W2 LINC01191-201ENST00000412690 844 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
TRIM71Q2Q1W2 POU5F1P4-201ENST00000413175 1085 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
TRIM71Q2Q1W2 ATPIF1-203ENST00000468425 539 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
TRIM71Q2Q1W2 RNA5SP413-201ENST00000516373 109 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
TRIM71Q2Q1W2 TPT1-AS1-210ENST00000520590 873 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
TRIM71Q2Q1W2 TMEM179B-205ENST00000533861 797 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
TRIM71Q2Q1W2 AC083880.1-201ENST00000608266 535 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
TRIM71Q2Q1W2 DHPS-223ENST00000614126 1124 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
TRIM71Q2Q1W2 FGF8-207ENST00000618991 856 ntTSL 3 BASIC23.33■■□□□ 1.33
TRIM71Q2Q1W2 GPX1-204ENST00000620890 897 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
TRIM71Q2Q1W2 ITM2C-210ENST00000620962 501 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
TRIM71Q2Q1W2 AL160396.2-202ENST00000636692 566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
TRIM71Q2Q1W2 IKBKG-212ENST00000617207 1949 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC23.33■■□□□ 1.32
TRIM71Q2Q1W2 DUSP26-201ENST00000256261 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
TRIM71Q2Q1W2 YBX1-201ENST00000321358 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
TRIM71Q2Q1W2 HAUS4-203ENST00000347758 1428 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.32
TRIM71Q2Q1W2 RBM17P2-201ENST00000616397 1405 ntBASIC23.33■■□□□ 1.32
TRIM71Q2Q1W2 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
TRIM71Q2Q1W2 TMEM176B-203ENST00000434545 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
TRIM71Q2Q1W2 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
TRIM71Q2Q1W2 MRAS-202ENST00000423968 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
TRIM71Q2Q1W2 MAL-201ENST00000309988 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
TRIM71Q2Q1W2 SPDYE2-201ENST00000341656 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
TRIM71Q2Q1W2 ASIP-201ENST00000374954 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
TRIM71Q2Q1W2 SPDYE2B-202ENST00000455020 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
TRIM71Q2Q1W2 UMAD1-202ENST00000463725 559 ntTSL 4 BASIC23.32■■□□□ 1.32
TRIM71Q2Q1W2 AC027451.1-201ENST00000530667 553 ntTSL 4 BASIC23.32■■□□□ 1.32
TRIM71Q2Q1W2 ZNF324-202ENST00000535298 1006 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
TRIM71Q2Q1W2 AC008694.1-202ENST00000636953 945 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
TRIM71Q2Q1W2 MYC-209ENST00000641252 345 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
TRIM71Q2Q1W2 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
TRIM71Q2Q1W2 CLN3-240ENST00000631023 1586 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
TRIM71Q2Q1W2 H2AFX-202ENST00000530167 1614 ntAPPRIS P1 BASIC23.31■■□□□ 1.32
TRIM71Q2Q1W2 LGALS9B-201ENST00000324290 1243 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
TRIM71Q2Q1W2 POLR2J-202ENST00000393794 784 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
TRIM71Q2Q1W2 BX276092.2-201ENST00000417668 665 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
TRIM71Q2Q1W2 AL391244.2-201ENST00000428932 543 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
TRIM71Q2Q1W2 ETHE1-205ENST00000600651 1052 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
TRIM71Q2Q1W2 AC120498.10-201ENST00000621827 505 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
TRIM71Q2Q1W2 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
TRIM71Q2Q1W2 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
TRIM71Q2Q1W2 KLF1-201ENST00000264834 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
TRIM71Q2Q1W2 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
TRIM71Q2Q1W2 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
TRIM71Q2Q1W2 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
TRIM71Q2Q1W2 AC138028.2-201ENST00000440406 1539 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
TRIM71Q2Q1W2 TNIP2-203ENST00000503235 1653 ntTSL 3 BASIC23.3■■□□□ 1.32
TRIM71Q2Q1W2 CAPN10-202ENST00000270364 1267 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
TRIM71Q2Q1W2 CD58-201ENST00000369487 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
TRIM71Q2Q1W2 CD58-202ENST00000369489 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
TRIM71Q2Q1W2 AKAIN1-201ENST00000434239 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
TRIM71Q2Q1W2 AC106738.2-202ENST00000558156 533 ntTSL 4 BASIC23.3■■□□□ 1.32
TRIM71Q2Q1W2 AL772284.2-201ENST00000620151 1147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
TRIM71Q2Q1W2 ADD3-AS1-204ENST00000627565 388 ntTSL 3 BASIC23.3■■□□□ 1.32
TRIM71Q2Q1W2 DPP7-201ENST00000371579 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
TRIM71Q2Q1W2 TLE3-216ENST00000559191 1575 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
TRIM71Q2Q1W2 MIF4GD-202ENST00000325102 1306 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
TRIM71Q2Q1W2 MMP23B-201ENST00000356026 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
TRIM71Q2Q1W2 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
TRIM71Q2Q1W2 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
TRIM71Q2Q1W2 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
TRIM71Q2Q1W2 TMEM175-212ENST00000508204 1399 ntTSL 3 BASIC23.29■■□□□ 1.32
TRIM71Q2Q1W2 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
TRIM71Q2Q1W2 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
TRIM71Q2Q1W2 PRORSD1P-201ENST00000295112 541 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
TRIM71Q2Q1W2 GRTP1-201ENST00000326039 1294 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
TRIM71Q2Q1W2 SDHC-201ENST00000342751 1127 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
TRIM71Q2Q1W2 TANGO2-202ENST00000398042 2011 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.4 ms