Protein–RNA interactions for Protein: Q17RM4

CCDC142, Coiled-coil domain-containing protein 142, humanhuman

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Length 750 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC142Q17RM4 AC007773.1-201ENST00000592680 972 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CCDC142Q17RM4 AP006587.3-201ENST00000525742 1516 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
CCDC142Q17RM4 CBWD6-201ENST00000377391 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CCDC142Q17RM4 NABP2-203ENST00000380198 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CCDC142Q17RM4 DPP7-201ENST00000371579 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CCDC142Q17RM4 SOCS7-202ENST00000613678 1827 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CCDC142Q17RM4 CERS5-201ENST00000317551 2051 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CCDC142Q17RM4 PPT2-244ENST00000324816 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CCDC142Q17RM4 SEPT5-210ENST00000455784 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CCDC142Q17RM4 NOTUM-201ENST00000409678 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CCDC142Q17RM4 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CCDC142Q17RM4 PIP5KL1-202ENST00000388747 2198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CCDC142Q17RM4 WWC2-AS2-201ENST00000578387 2183 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
CCDC142Q17RM4 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CCDC142Q17RM4 TANGO2-202ENST00000398042 2011 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CCDC142Q17RM4 TDRKH-205ENST00000368827 2318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CCDC142Q17RM4 ANKRD19P-205ENST00000473204 2370 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CCDC142Q17RM4 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CCDC142Q17RM4 STX7-201ENST00000367937 1090 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CCDC142Q17RM4 ZSWIM7-205ENST00000472495 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CCDC142Q17RM4 HSD17B14-204ENST00000599157 991 ntTSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CCDC142Q17RM4 AL137784.2-201ENST00000607332 1000 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
CCDC142Q17RM4 PROSER2-205ENST00000622831 1646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CCDC142Q17RM4 RNF39-202ENST00000376751 1970 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CCDC142Q17RM4 NR0B1-202ENST00000378970 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CCDC142Q17RM4 TRAM2-AS1-204ENST00000606714 2453 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CCDC142Q17RM4 CBWD6-213ENST00000613716 1820 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CCDC142Q17RM4 BIN1-202ENST00000316724 2693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CCDC142Q17RM4 TNFRSF18-202ENST00000379265 705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CCDC142Q17RM4 ZNF292-204ENST00000392985 1096 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CCDC142Q17RM4 GRPEL2-202ENST00000416916 1006 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CCDC142Q17RM4 AC093627.4-202ENST00000479592 591 ntTSL 4 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CCDC142Q17RM4 DBI-210ENST00000542275 757 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CCDC142Q17RM4 IDH2-203ENST00000559482 1278 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CCDC142Q17RM4 TRAPPC2L-213ENST00000567895 854 ntTSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CCDC142Q17RM4 SUZ12P1-202ENST00000578070 929 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CCDC142Q17RM4 AC104187.1-201ENST00000607510 612 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
CCDC142Q17RM4 TMEM230-210ENST00000612323 1231 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CCDC142Q17RM4 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CCDC142Q17RM4 CCNE1-201ENST00000262643 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CCDC142Q17RM4 STEAP2-204ENST00000394626 2456 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CCDC142Q17RM4 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CCDC142Q17RM4 CBWD3-202ENST00000377342 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CCDC142Q17RM4 LGALS9B-201ENST00000324290 1243 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CCDC142Q17RM4 LARP6-202ENST00000344870 527 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CCDC142Q17RM4 IMPA2-212ENST00000625802 500 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CCDC142Q17RM4 B4GALNT1-202ENST00000418555 1861 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CCDC142Q17RM4 SPRED3-202ENST00000586301 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CCDC142Q17RM4 OLIG2-202ENST00000382357 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CCDC142Q17RM4 SOAT2-201ENST00000301466 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CCDC142Q17RM4 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CCDC142Q17RM4 HAUS4-201ENST00000206474 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CCDC142Q17RM4 DACT2-203ENST00000607983 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CCDC142Q17RM4 NKX2-5-201ENST00000329198 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CCDC142Q17RM4 TMEM200B-202ENST00000521452 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CCDC142Q17RM4 RHCE-204ENST00000349320 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CCDC142Q17RM4 POTED-202ENST00000620442 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CCDC142Q17RM4 ASRGL1-210ENST00000534571 639 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CCDC142Q17RM4 SEC11A-208ENST00000559729 1256 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CCDC142Q17RM4 ECHDC2-221ENST00000536120 1446 ntTSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CCDC142Q17RM4 KRT87P-202ENST00000534226 1464 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
CCDC142Q17RM4 WRNIP1-204ENST00000380773 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CCDC142Q17RM4 TUBG1-201ENST00000251413 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CCDC142Q17RM4 NOX4-209ENST00000527626 1774 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CCDC142Q17RM4 PPP3CC-202ENST00000289963 2135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
CCDC142Q17RM4 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
CCDC142Q17RM4 TESC-206ENST00000541210 936 ntTSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
CCDC142Q17RM4 AC092368.3-201ENST00000562549 1107 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
CCDC142Q17RM4 AC243773.2-201ENST00000616341 490 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
CCDC142Q17RM4 WT1-AS-205ENST00000494911 1320 ntTSL 4 BASIC22.7■■□□□ 1.22
CCDC142Q17RM4 RALGPS1-207ENST00000394022 1672 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
CCDC142Q17RM4 PRKACA-201ENST00000308677 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CCDC142Q17RM4 MOGS-202ENST00000409065 2668 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CCDC142Q17RM4 LOXL1-201ENST00000261921 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CCDC142Q17RM4 CLN6-201ENST00000249806 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CCDC142Q17RM4 TMEM165-201ENST00000381334 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CCDC142Q17RM4 EPHA8-202ENST00000374644 1802 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CCDC142Q17RM4 ZNF410-206ENST00000540593 1722 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CCDC142Q17RM4 DUX4-203ENST00000565211 1710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CCDC142Q17RM4 HNF4A-205ENST00000443598 1603 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CCDC142Q17RM4 DLX3-202ENST00000512495 834 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CCDC142Q17RM4 AP006621.1-202ENST00000528982 464 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CCDC142Q17RM4 RNASEH2B-206ENST00000611510 1257 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CCDC142Q17RM4 AC093762.3-201ENST00000641918 318 ntAPPRIS P1 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CCDC142Q17RM4 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CCDC142Q17RM4 TLX2-201ENST00000233638 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CCDC142Q17RM4 PLPP7-202ENST00000372264 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CCDC142Q17RM4 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CCDC142Q17RM4 IL15RA-206ENST00000397248 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CCDC142Q17RM4 SNX21-212ENST00000491381 1607 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CCDC142Q17RM4 MFF-207ENST00000409565 1548 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CCDC142Q17RM4 MYB-221ENST00000527615 2381 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CCDC142Q17RM4 EMC7-201ENST00000256545 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CCDC142Q17RM4 UCHL1-201ENST00000284440 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CCDC142Q17RM4 GPSM1-201ENST00000291775 2114 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CCDC142Q17RM4 HBM-201ENST00000356815 506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CCDC142Q17RM4 AC006015.1-201ENST00000429970 570 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
CCDC142Q17RM4 UCHL1-210ENST00000512788 785 ntTSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CCDC142Q17RM4 AC137761.2-201ENST00000561729 223 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
CCDC142Q17RM4 AC145350.3-201ENST00000569033 163 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
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