Protein–RNA interactions for Protein: Q17RB0

RTL8B, Retrotransposon Gag-like protein 8B, humanhuman

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Length 113 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RTL8BQ17RB0 TRIM14-202ENST00000342043 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
RTL8BQ17RB0 WT1-210ENST00000639563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
RTL8BQ17RB0 ODC1-201ENST00000234111 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
RTL8BQ17RB0 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
RTL8BQ17RB0 SNX3-202ENST00000349379 890 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
RTL8BQ17RB0 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC17.33■□□□□ 0.36
RTL8BQ17RB0 Z97653.1-201ENST00000567096 446 ntTSL 3 BASIC17.33■□□□□ 0.36
RTL8BQ17RB0 GALNS-211ENST00000568311 703 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
RTL8BQ17RB0 GPSM1-201ENST00000291775 2114 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
RTL8BQ17RB0 SNX8-201ENST00000222990 4727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
RTL8BQ17RB0 GJB6-203ENST00000400065 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
RTL8BQ17RB0 BAALC-205ENST00000438105 2662 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
RTL8BQ17RB0 SCRN2-212ENST00000584123 1745 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
RTL8BQ17RB0 AP004607.7-201ENST00000527152 1677 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
RTL8BQ17RB0 PRSS33-202ENST00000570702 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
RTL8BQ17RB0 SGMS1-210ENST00000619438 1680 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
RTL8BQ17RB0 DNAJB11-202ENST00000439351 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
RTL8BQ17RB0 LINC01140-202ENST00000467438 2375 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
RTL8BQ17RB0 ACP1-201ENST00000272065 1549 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
RTL8BQ17RB0 SPIRE2-202ENST00000393062 2172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
RTL8BQ17RB0 P4HTM-202ENST00000383729 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
RTL8BQ17RB0 TTYH3-201ENST00000258796 4840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
RTL8BQ17RB0 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
RTL8BQ17RB0 PHPT1-201ENST00000247665 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
RTL8BQ17RB0 BX842568.3-201ENST00000418104 571 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
RTL8BQ17RB0 AL161908.1-203ENST00000425370 506 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
RTL8BQ17RB0 AC018553.2-201ENST00000637770 1064 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
RTL8BQ17RB0 PTP4A3-203ENST00000520105 1866 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
RTL8BQ17RB0 AC026310.3-201ENST00000625186 2373 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
RTL8BQ17RB0 NAA35-202ENST00000376040 1797 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
RTL8BQ17RB0 KCTD13-202ENST00000561540 1773 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
RTL8BQ17RB0 QKI-205ENST00000392127 7911 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
RTL8BQ17RB0 YAP1-201ENST00000282441 5386 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
RTL8BQ17RB0 IRX2-201ENST00000302057 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
RTL8BQ17RB0 NFS1-204ENST00000397425 1956 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
RTL8BQ17RB0 MARK1-205ENST00000611084 5321 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
RTL8BQ17RB0 TBL1Y-202ENST00000355162 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
RTL8BQ17RB0 UPF3A-202ENST00000375299 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
RTL8BQ17RB0 LOXL1-AS1-210ENST00000567257 2358 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
RTL8BQ17RB0 SYNGR2-201ENST00000225777 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
RTL8BQ17RB0 RREB1-203ENST00000379933 5826 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
RTL8BQ17RB0 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
RTL8BQ17RB0 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
RTL8BQ17RB0 POLR3GL-201ENST00000369313 818 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
RTL8BQ17RB0 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
RTL8BQ17RB0 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
RTL8BQ17RB0 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC17.31■□□□□ 0.36
RTL8BQ17RB0 MIR4767-201ENST00000582827 78 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
RTL8BQ17RB0 CHRNA7-203ENST00000454250 2093 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
RTL8BQ17RB0 ZIM2-201ENST00000593711 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
RTL8BQ17RB0 AZIN2-204ENST00000373443 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
RTL8BQ17RB0 DNM2-205ENST00000585892 2774 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
RTL8BQ17RB0 Z98882.1-201ENST00000622160 2253 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
RTL8BQ17RB0 FBXO25-202ENST00000350302 2229 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
RTL8BQ17RB0 OXCT2-201ENST00000327582 1826 ntAPPRIS P1 BASIC17.31■□□□□ 0.36
RTL8BQ17RB0 MALT1-201ENST00000345724 2866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
RTL8BQ17RB0 CCDC130-201ENST00000221554 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
RTL8BQ17RB0 QPCT-201ENST00000338415 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
RTL8BQ17RB0 DOK3-202ENST00000357198 1729 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
RTL8BQ17RB0 SOX17-201ENST00000297316 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
RTL8BQ17RB0 CCDC189-206ENST00000543610 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
RTL8BQ17RB0 KRT18P55-201ENST00000577198 1950 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
RTL8BQ17RB0 FDX2-202ENST00000393708 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
RTL8BQ17RB0 AC061979.1-201ENST00000532061 434 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
RTL8BQ17RB0 AP001107.5-202ENST00000533759 948 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
RTL8BQ17RB0 USP48-205ENST00000421625 2818 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
RTL8BQ17RB0 KCNH2-201ENST00000262186 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
RTL8BQ17RB0 BRPF3-202ENST00000357641 6052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
RTL8BQ17RB0 ITGB1BP1-203ENST00000359712 2126 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
RTL8BQ17RB0 MGAT5B-201ENST00000301618 4486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
RTL8BQ17RB0 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
RTL8BQ17RB0 B4GAT1-201ENST00000311181 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
RTL8BQ17RB0 GNB2-209ENST00000436220 1479 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
RTL8BQ17RB0 BSN-AS2-201ENST00000421598 2603 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
RTL8BQ17RB0 TGFBR1-201ENST00000374990 5720 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
RTL8BQ17RB0 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
RTL8BQ17RB0 SH2B1-202ENST00000337120 6043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
RTL8BQ17RB0 ACHE-201ENST00000241069 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
RTL8BQ17RB0 KIF12-202ENST00000468460 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
RTL8BQ17RB0 PPP2R5E-204ENST00000555899 2164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
RTL8BQ17RB0 DACT1-204ENST00000541264 2610 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
RTL8BQ17RB0 LMAN2-201ENST00000303127 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
RTL8BQ17RB0 RNPEPL1-201ENST00000270357 5658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
RTL8BQ17RB0 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
RTL8BQ17RB0 CKLF-205ENST00000417030 628 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC17.29■□□□□ 0.36
RTL8BQ17RB0 TUSC3-209ENST00000509380 1266 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
RTL8BQ17RB0 NRIP3-203ENST00000531090 980 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
RTL8BQ17RB0 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
RTL8BQ17RB0 EHBP1-209ENST00000431489 5076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
RTL8BQ17RB0 SNX7-201ENST00000306121 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
RTL8BQ17RB0 MRPL37-202ENST00000360840 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
RTL8BQ17RB0 SPTBN4-203ENST00000392023 2419 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
RTL8BQ17RB0 IRX4-207ENST00000613726 2403 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
RTL8BQ17RB0 AL137060.1-201ENST00000618151 2648 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
RTL8BQ17RB0 AC025164.2-201ENST00000501008 1898 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
RTL8BQ17RB0 AL024507.2-201ENST00000606070 2574 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
RTL8BQ17RB0 B4GALNT1-203ENST00000449184 1633 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
RTL8BQ17RB0 MFSD14C-208ENST00000637864 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
RTL8BQ17RB0 SLC35A3-210ENST00000638371 2298 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
RTL8BQ17RB0 LRRC45-201ENST00000306688 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
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