Protein–RNA interactions for Protein: Q16827

PTPRO, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase O, humanhuman

Predictions only

Length 1,216 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPROQ16827 RASGRP2-210ENST00000394430 2174 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
PTPROQ16827 CITED1-201ENST00000246139 1231 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
PTPROQ16827 FAM66D-201ENST00000434078 918 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
PTPROQ16827 TSPY20P-201ENST00000450910 630 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
PTPROQ16827 ACYP1-205ENST00000555463 789 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
PTPROQ16827 AC142086.2-201ENST00000569753 217 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
PTPROQ16827 TRAPPC5-203ENST00000595985 411 ntTSL 3 BASIC23.5■■□□□ 1.35
PTPROQ16827 LINC01184-201ENST00000499346 1380 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
PTPROQ16827 SCAND1-202ENST00000373991 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
PTPROQ16827 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
PTPROQ16827 MANEAL-203ENST00000397631 2327 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
PTPROQ16827 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
PTPROQ16827 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
PTPROQ16827 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
PTPROQ16827 REXO1-201ENST00000170168 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
PTPROQ16827 AP002761.3-201ENST00000546324 1695 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
PTPROQ16827 PHPT1-201ENST00000247665 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
PTPROQ16827 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
PTPROQ16827 C19orf12-205ENST00000392278 895 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
PTPROQ16827 AC093627.4-202ENST00000479592 591 ntTSL 4 BASIC23.49■■□□□ 1.35
PTPROQ16827 AL121832.2-201ENST00000610979 668 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
PTPROQ16827 AC068587.7-201ENST00000641602 218 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
PTPROQ16827 CRHR1-201ENST00000293493 2621 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
PTPROQ16827 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
PTPROQ16827 YY1AP1-214ENST00000407221 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
PTPROQ16827 P4HTM-201ENST00000343546 2268 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
PTPROQ16827 ILDR2-205ENST00000526687 2299 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
PTPROQ16827 ZGPAT-201ENST00000328969 1945 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
PTPROQ16827 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
PTPROQ16827 GMPPA-201ENST00000313597 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
PTPROQ16827 UCHL5-201ENST00000367448 1534 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
PTPROQ16827 RASL12-202ENST00000421977 1523 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
PTPROQ16827 FAM167A-204ENST00000528897 1620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
PTPROQ16827 PTPRJ-201ENST00000418331 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
PTPROQ16827 INPPL1-201ENST00000298229 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
PTPROQ16827 PTPRM-211ENST00000580170 5941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
PTPROQ16827 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
PTPROQ16827 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
PTPROQ16827 SH2B1-204ENST00000395532 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
PTPROQ16827 FAM160B1-201ENST00000369246 666 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
PTPROQ16827 LRRC3C-201ENST00000377924 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.48■■□□□ 1.35
PTPROQ16827 IL15RA-208ENST00000397251 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
PTPROQ16827 TRIQK-221ENST00000524107 737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.48■■□□□ 1.35
PTPROQ16827 IL15RA-221ENST00000620865 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
PTPROQ16827 IL15RA-222ENST00000622442 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
PTPROQ16827 PARP1-210ENST00000629232 477 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
PTPROQ16827 PARD3-209ENST00000374790 5825 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
PTPROQ16827 ILKAP-211ENST00000612675 1335 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
PTPROQ16827 SOAT2-201ENST00000301466 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
PTPROQ16827 AC138649.1-201ENST00000619611 1449 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
PTPROQ16827 GAS2L1-206ENST00000610653 2238 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
PTPROQ16827 IMPA2-201ENST00000269159 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
PTPROQ16827 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
PTPROQ16827 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
PTPROQ16827 PLK5-202ENST00000454744 1930 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
PTPROQ16827 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
PTPROQ16827 BCS1L-210ENST00000431802 2015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
PTPROQ16827 AC007375.3-201ENST00000600936 2314 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
PTPROQ16827 KRTAP17-1-201ENST00000334202 779 ntAPPRIS P1 BASIC23.47■■□□□ 1.35
PTPROQ16827 PRR7-201ENST00000323249 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
PTPROQ16827 INAFM2-202ENST00000638170 3052 ntAPPRIS P1 BASIC23.47■■□□□ 1.35
PTPROQ16827 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
PTPROQ16827 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
PTPROQ16827 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
PTPROQ16827 CCNE1-201ENST00000262643 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
PTPROQ16827 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
PTPROQ16827 ADA-201ENST00000372874 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
PTPROQ16827 CNEP1R1-202ENST00000427478 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
PTPROQ16827 SLC35A3-204ENST00000427993 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
PTPROQ16827 AGAP1-IT1-201ENST00000440498 664 ntTSL 3 BASIC23.46■■□□□ 1.35
PTPROQ16827 AC079140.4-201ENST00000507448 529 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
PTPROQ16827 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
PTPROQ16827 PLPP5-209ENST00000529359 2185 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
PTPROQ16827 RHOT1-205ENST00000545287 2516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
PTPROQ16827 AC127029.2-201ENST00000577329 502 ntTSL 3 BASIC23.46■■□□□ 1.35
PTPROQ16827 PLEKHF1-204ENST00000592810 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
PTPROQ16827 AL161421.1-201ENST00000619666 1101 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
PTPROQ16827 AC080038.3-201ENST00000623346 1952 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
PTPROQ16827 FAM19A5-202ENST00000358295 2638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
PTPROQ16827 NRL-203ENST00000397002 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
PTPROQ16827 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
PTPROQ16827 CTCF-202ENST00000401394 2978 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
PTPROQ16827 AC084116.4-201ENST00000524320 484 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
PTPROQ16827 TP53I11-215ENST00000531928 1078 ntTSL 3 BASIC23.45■■□□□ 1.34
PTPROQ16827 KRT18P6-201ENST00000555540 1265 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
PTPROQ16827 AC087239.1-201ENST00000622671 572 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
PTPROQ16827 AC093762.3-201ENST00000641918 318 ntAPPRIS P1 BASIC23.45■■□□□ 1.34
PTPROQ16827 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
PTPROQ16827 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
PTPROQ16827 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
PTPROQ16827 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
PTPROQ16827 CXCL14-201ENST00000337225 1971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
PTPROQ16827 EFS-203ENST00000429593 2610 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
PTPROQ16827 EPO-201ENST00000252723 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
PTPROQ16827 CD58-203ENST00000457047 1328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
PTPROQ16827 MT3-201ENST00000200691 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
PTPROQ16827 MLLT10-204ENST00000377091 905 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
PTPROQ16827 CPT2-209ENST00000636935 803 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
PTPROQ16827 LSM14B-201ENST00000279068 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
PTPROQ16827 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.4 ms