Protein–RNA interactions for Protein: Q16799

RTN1, Reticulon-1, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RTN1Q16799 PEX11G-203ENST00000593942 1345 ntTSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
RTN1Q16799 SOS2-201ENST00000216373 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
RTN1Q16799 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC24.81■■□□□ 1.56
RTN1Q16799 RPS6-203ENST00000380384 1355 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
RTN1Q16799 WWC2-AS2-201ENST00000578387 2183 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
RTN1Q16799 NDUFS3-201ENST00000263774 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
RTN1Q16799 FXN-202ENST00000396364 980 ntTSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
RTN1Q16799 AP003071.3-201ENST00000562506 366 ntTSL 3 BASIC24.8■■□□□ 1.56
RTN1Q16799 AC104564.3-201ENST00000582367 638 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
RTN1Q16799 TERF1P2-201ENST00000583350 1212 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
RTN1Q16799 PRMT1-221ENST00000610806 1192 ntTSL 3 BASIC24.8■■□□□ 1.56
RTN1Q16799 DTNB-207ENST00000405222 2273 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
RTN1Q16799 CBLN3-201ENST00000267406 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
RTN1Q16799 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
RTN1Q16799 SCRN2-212ENST00000584123 1745 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
RTN1Q16799 TMEM200B-201ENST00000420504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
RTN1Q16799 VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 1753 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
RTN1Q16799 ELOA-201ENST00000418390 5154 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
RTN1Q16799 GRK3-203ENST00000619906 2873 ntTSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
RTN1Q16799 VGLL3-201ENST00000383698 2475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
RTN1Q16799 HIRA-201ENST00000263208 4053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
RTN1Q16799 CENPS-CORT-201ENST00000400900 1469 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
RTN1Q16799 RTCA-202ENST00000370126 538 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
RTN1Q16799 GDNF-203ENST00000381826 778 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
RTN1Q16799 GDNF-204ENST00000427982 856 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
RTN1Q16799 GLI4-210ENST00000523522 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
RTN1Q16799 AIPL1-206ENST00000571740 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
RTN1Q16799 CCDC92B-201ENST00000575506 885 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
RTN1Q16799 KCNT1-201ENST00000263604 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
RTN1Q16799 ADORA2A-AS1-203ENST00000427813 2027 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
RTN1Q16799 POC1B-209ENST00000549035 2038 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
RTN1Q16799 RUSC1-AS1-203ENST00000450199 1636 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
RTN1Q16799 CDCP1-202ENST00000425231 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
RTN1Q16799 AP004608.1-201ENST00000531319 1402 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
RTN1Q16799 ECHDC2-221ENST00000536120 1446 ntTSL 3 BASIC24.78■■□□□ 1.56
RTN1Q16799 KRT18P55-201ENST00000577198 1950 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
RTN1Q16799 CENPB-201ENST00000379751 2840 ntAPPRIS P1 BASIC24.78■■□□□ 1.56
RTN1Q16799 ADRM1-204ENST00000491935 1530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
RTN1Q16799 MGAT4D-208ENST00000515354 1806 ntTSL 3 BASIC24.78■■□□□ 1.56
RTN1Q16799 MFSD14C-201ENST00000375223 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
RTN1Q16799 ASMT-202ENST00000381233 989 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
RTN1Q16799 RNF208-202ENST00000392827 1135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
RTN1Q16799 TPT1-AS1-211ENST00000520622 604 ntTSL 4 BASIC24.78■■□□□ 1.56
RTN1Q16799 AL137779.2-201ENST00000554859 448 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
RTN1Q16799 ATG4D-201ENST00000309469 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
RTN1Q16799 KCNH6-203ENST00000580652 1703 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
RTN1Q16799 TTYH1-203ENST00000376531 1763 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
RTN1Q16799 SLC2A11-202ENST00000316185 1555 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
RTN1Q16799 PIAS2-203ENST00000545673 1590 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
RTN1Q16799 SMPD2-201ENST00000258052 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
RTN1Q16799 ATP5C1-202ENST00000356708 1163 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
RTN1Q16799 FNDC3B-204ENST00000421757 946 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
RTN1Q16799 AC079140.4-201ENST00000507448 529 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
RTN1Q16799 SH2B2-202ENST00000536178 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
RTN1Q16799 PACRGL-227ENST00000513459 1773 ntTSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
RTN1Q16799 FBXW11-203ENST00000393802 2181 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
RTN1Q16799 ZNF784-201ENST00000325351 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
RTN1Q16799 PARD3-209ENST00000374790 5825 ntTSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
RTN1Q16799 AL831711.1-201ENST00000636824 569 ntTSL 4 BASIC24.76■■□□□ 1.55
RTN1Q16799 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
RTN1Q16799 GLI4-201ENST00000340042 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
RTN1Q16799 PPP2R5E-204ENST00000555899 2164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
RTN1Q16799 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
RTN1Q16799 DHRS2-202ENST00000344777 1678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
RTN1Q16799 FAHD1-202ENST00000382668 1845 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
RTN1Q16799 WRNIP1-203ENST00000380771 2595 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
RTN1Q16799 FMNL2-201ENST00000288670 5575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
RTN1Q16799 METTL23-201ENST00000341249 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
RTN1Q16799 TMEM61-201ENST00000371268 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
RTN1Q16799 EIF6-201ENST00000374436 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
RTN1Q16799 AC097381.1-201ENST00000429019 1296 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
RTN1Q16799 KRT18P14-201ENST00000534205 1250 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
RTN1Q16799 AC011511.3-201ENST00000587088 355 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
RTN1Q16799 MFF-207ENST00000409565 1548 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
RTN1Q16799 VRK2-201ENST00000340157 1888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
RTN1Q16799 AC244015.2-201ENST00000616358 1861 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
RTN1Q16799 AC084757.3-201ENST00000558061 1943 ntTSL 3 BASIC24.74■■□□□ 1.55
RTN1Q16799 ASRGL1-201ENST00000301776 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
RTN1Q16799 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
RTN1Q16799 CCDC38-201ENST00000344280 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
RTN1Q16799 SARDH-203ENST00000371868 2266 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
RTN1Q16799 RNPEP-201ENST00000295640 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
RTN1Q16799 YY1AP1-214ENST00000407221 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
RTN1Q16799 AC073343.2-201ENST00000413182 548 ntTSL 4 BASIC24.74■■□□□ 1.55
RTN1Q16799 MIR6821-201ENST00000617625 74 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
RTN1Q16799 COMMD5-207ENST00000543949 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.74■■□□□ 1.55
RTN1Q16799 RBPJL-202ENST00000372741 1636 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
RTN1Q16799 CCNL1-203ENST00000461804 1998 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
RTN1Q16799 LAYN-201ENST00000375614 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
RTN1Q16799 TANGO2-212ENST00000434570 2180 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
RTN1Q16799 CDC14A-203ENST00000370124 1883 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
RTN1Q16799 DACT2-203ENST00000607983 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
RTN1Q16799 AP2S1-201ENST00000263270 935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
RTN1Q16799 AC008105.3-201ENST00000586376 844 ntTSL 3 BASIC24.73■■□□□ 1.55
RTN1Q16799 SLC35F5-203ENST00000409342 2284 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
RTN1Q16799 HSF2BP-201ENST00000291560 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
RTN1Q16799 TERF1-202ENST00000276603 1677 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
RTN1Q16799 AKT2-210ENST00000424901 5170 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
RTN1Q16799 PDXK-205ENST00000398081 2251 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
RTN1Q16799 TALDO1-201ENST00000319006 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
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