Protein–RNA interactions for Protein: Q16720

ATP2B3, Plasma membrane calcium-transporting ATPase 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,220 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP2B3Q16720 OLIG2-202ENST00000382357 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
ATP2B3Q16720 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.15■■□□□ 1.78
ATP2B3Q16720 SLC41A3-201ENST00000315891 1797 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
ATP2B3Q16720 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.15■■□□□ 1.78
ATP2B3Q16720 LRRC45-201ENST00000306688 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
ATP2B3Q16720 ANKHD1-221ENST00000616482 2064 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
ATP2B3Q16720 RUSC1-AS1-203ENST00000450199 1636 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
ATP2B3Q16720 RNF180-201ENST00000296615 1727 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
ATP2B3Q16720 RITA1-202ENST00000549621 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.78
ATP2B3Q16720 CDCA4P2-201ENST00000441182 718 ntBASIC26.14■■□□□ 1.78
ATP2B3Q16720 ABHD14A-204ENST00000491470 674 ntTSL 3 BASIC26.14■■□□□ 1.78
ATP2B3Q16720 AL731577.2-201ENST00000508096 555 ntTSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.78
ATP2B3Q16720 AC011767.1-201ENST00000617410 1153 ntBASIC26.14■■□□□ 1.78
ATP2B3Q16720 ORAI3-204ENST00000566237 1393 ntTSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.78
ATP2B3Q16720 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
ATP2B3Q16720 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
ATP2B3Q16720 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
ATP2B3Q16720 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
ATP2B3Q16720 DHRS2-202ENST00000344777 1678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
ATP2B3Q16720 HRASLS5-201ENST00000301790 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
ATP2B3Q16720 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
ATP2B3Q16720 CNEP1R1-202ENST00000427478 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
ATP2B3Q16720 ABHD14A-202ENST00000458031 1113 ntTSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
ATP2B3Q16720 AC044860.1-203ENST00000560811 844 ntTSL 3 BASIC26.13■■□□□ 1.77
ATP2B3Q16720 AC110285.4-201ENST00000572590 424 ntTSL 3 BASIC26.13■■□□□ 1.77
ATP2B3Q16720 AC053503.5-201ENST00000601508 636 ntBASIC26.13■■□□□ 1.77
ATP2B3Q16720 AC018553.2-201ENST00000637770 1064 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
ATP2B3Q16720 CERS5-201ENST00000317551 2051 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.13■■□□□ 1.77
ATP2B3Q16720 LHFPL3-202ENST00000424859 1852 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
ATP2B3Q16720 PGF-201ENST00000238607 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.12■■□□□ 1.77
ATP2B3Q16720 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
ATP2B3Q16720 DCPS-201ENST00000263579 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
ATP2B3Q16720 ZNF410-206ENST00000540593 1722 ntTSL 2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
ATP2B3Q16720 RAMP2-201ENST00000253796 780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
ATP2B3Q16720 EFCAB6-202ENST00000356087 1129 ntTSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
ATP2B3Q16720 SNRNP25-202ENST00000383018 1085 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
ATP2B3Q16720 AL021707.1-201ENST00000416406 500 ntTSL 3 BASIC26.12■■□□□ 1.77
ATP2B3Q16720 AC092143.4-201ENST00000570217 559 ntTSL 4 BASIC26.12■■□□□ 1.77
ATP2B3Q16720 MFSD11-216ENST00000590393 1141 ntBASIC26.12■■□□□ 1.77
ATP2B3Q16720 GAS2L1-206ENST00000610653 2238 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
ATP2B3Q16720 LINC02175-201ENST00000571219 1875 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
ATP2B3Q16720 HSF4-215ENST00000521374 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
ATP2B3Q16720 C19orf67-203ENST00000548523 1427 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
ATP2B3Q16720 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
ATP2B3Q16720 CXCL14-201ENST00000337225 1971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
ATP2B3Q16720 EEFSEC-201ENST00000254730 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
ATP2B3Q16720 LOXL1-201ENST00000261921 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
ATP2B3Q16720 PARP1-202ENST00000366792 553 ntTSL 3 BASIC26.11■■□□□ 1.77
ATP2B3Q16720 ZPBP-201ENST00000046087 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
ATP2B3Q16720 SCN1B-203ENST00000595652 814 ntTSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
ATP2B3Q16720 C1orf174-201ENST00000361605 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
ATP2B3Q16720 HLA-DPB1-211ENST00000418931 1560 ntAPPRIS P2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
ATP2B3Q16720 MRPL37-206ENST00000605337 1582 ntTSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
ATP2B3Q16720 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
ATP2B3Q16720 IER2-201ENST00000292433 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
ATP2B3Q16720 LYRM9-201ENST00000379102 501 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
ATP2B3Q16720 ZNF717-203ENST00000477374 1169 ntTSL 2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
ATP2B3Q16720 LYRM9-206ENST00000508862 807 ntTSL 3 BASIC26.1■■□□□ 1.77
ATP2B3Q16720 AC133065.2-201ENST00000573379 2147 ntTSL 2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
ATP2B3Q16720 ADAD2-201ENST00000268624 2283 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
ATP2B3Q16720 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
ATP2B3Q16720 SYNGR2-203ENST00000588282 1553 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
ATP2B3Q16720 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
ATP2B3Q16720 IL15RA-206ENST00000397248 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
ATP2B3Q16720 MOGS-202ENST00000409065 2668 ntTSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
ATP2B3Q16720 EFCAB1-202ENST00000433756 2286 ntTSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
ATP2B3Q16720 MFSD6L-201ENST00000329805 2188 ntAPPRIS P1 BASIC26.09■■□□□ 1.77
ATP2B3Q16720 ZNF784-201ENST00000325351 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
ATP2B3Q16720 TAF9-201ENST00000217893 1283 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
ATP2B3Q16720 TRIQK-221ENST00000524107 737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.09■■□□□ 1.77
ATP2B3Q16720 AC016888.1-201ENST00000585285 565 ntTSL 3 BASIC26.09■■□□□ 1.77
ATP2B3Q16720 DM1-AS-203ENST00000590076 730 ntTSL 4 BASIC26.09■■□□□ 1.77
ATP2B3Q16720 TFG-210ENST00000620299 1289 ntTSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
ATP2B3Q16720 MYCNOS-205ENST00000641950 531 ntBASIC26.09■■□□□ 1.77
ATP2B3Q16720 MEIS3-202ENST00000441740 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
ATP2B3Q16720 C10orf95-201ENST00000625129 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
ATP2B3Q16720 SMOX-212ENST00000621355 2322 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
ATP2B3Q16720 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
ATP2B3Q16720 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
ATP2B3Q16720 ACSL1-205ENST00000504900 1583 ntTSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.77
ATP2B3Q16720 ODC1-201ENST00000234111 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
ATP2B3Q16720 POTED-202ENST00000620442 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
ATP2B3Q16720 COX5B-201ENST00000258424 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
ATP2B3Q16720 TSPAN11-202ENST00000535215 988 ntTSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.77
ATP2B3Q16720 HAS1-203ENST00000594621 760 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
ATP2B3Q16720 ASCL2-201ENST00000331289 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
ATP2B3Q16720 LINC01184-201ENST00000499346 1380 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
ATP2B3Q16720 AC003102.1-202ENST00000563394 1796 ntBASIC26.07■■□□□ 1.76
ATP2B3Q16720 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
ATP2B3Q16720 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
ATP2B3Q16720 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
ATP2B3Q16720 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
ATP2B3Q16720 DTYMK-201ENST00000305784 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
ATP2B3Q16720 RHOD-201ENST00000308831 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
ATP2B3Q16720 ZNF561-AS1-205ENST00000588765 579 ntTSL 4 BASIC26.07■■□□□ 1.76
ATP2B3Q16720 MFSD3-201ENST00000301327 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
ATP2B3Q16720 RAB28-203ENST00000338176 1787 ntTSL 3 BASIC26.07■■□□□ 1.76
ATP2B3Q16720 P4HTM-201ENST00000343546 2268 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
ATP2B3Q16720 PLPP7-202ENST00000372264 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
ATP2B3Q16720 ANKRD44-204ENST00000409919 1622 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.4 ms