Protein–RNA interactions for Protein: Q16586

SGCA, Alpha-sarcoglycan, humanhuman

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Length 387 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SGCAQ16586 AL031432.3-201ENST00000607698 485 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
SGCAQ16586 ARID1B-220ENST00000636930 8246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
SGCAQ16586 SLCO3A1-202ENST00000424469 2705 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
SGCAQ16586 PTGER3-204ENST00000356595 1943 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
SGCAQ16586 PTGER3-207ENST00000370931 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
SGCAQ16586 AC010542.4-201ENST00000563151 1910 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
SGCAQ16586 MAPT-210ENST00000535772 5718 ntTSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
SGCAQ16586 RBBP7-202ENST00000380084 2036 ntTSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
SGCAQ16586 AC007375.3-201ENST00000600936 2314 ntBASIC18.91■□□□□ 0.62
SGCAQ16586 CITED2-202ENST00000536159 1797 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.91■□□□□ 0.62
SGCAQ16586 CITED2-203ENST00000537332 1780 ntTSL 3 BASIC18.91■□□□□ 0.62
SGCAQ16586 ITGB1BP1-203ENST00000359712 2126 ntTSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
SGCAQ16586 LAMTOR1-201ENST00000278671 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
SGCAQ16586 AC006538.2-201ENST00000586572 543 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.91■□□□□ 0.62
SGCAQ16586 ME2-206ENST00000638410 2289 ntTSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
SGCAQ16586 ME2-210ENST00000639255 2262 ntTSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
SGCAQ16586 PGF-201ENST00000238607 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.91■□□□□ 0.62
SGCAQ16586 CHRAC1-203ENST00000519533 1678 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
SGCAQ16586 INPP4A-201ENST00000074304 6752 ntTSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
SGCAQ16586 ST3GAL5-222ENST00000638572 4431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
SGCAQ16586 SLC18A3-201ENST00000374115 2420 ntAPPRIS P1 BASIC18.91■□□□□ 0.62
SGCAQ16586 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
SGCAQ16586 COL15A1-205ENST00000610452 5422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
SGCAQ16586 LIMS2-201ENST00000324938 2111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
SGCAQ16586 SUDS3P1-201ENST00000505831 966 ntBASIC18.9■□□□□ 0.62
SGCAQ16586 AC104564.5-201ENST00000584986 278 ntTSL 3 BASIC18.9■□□□□ 0.62
SGCAQ16586 SMUG1P1-201ENST00000590640 811 ntBASIC18.9■□□□□ 0.62
SGCAQ16586 DTNB-207ENST00000405222 2273 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
SGCAQ16586 SLC35F5-203ENST00000409342 2284 ntTSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
SGCAQ16586 KBTBD13-201ENST00000432196 1377 ntAPPRIS P1 BASIC18.9■□□□□ 0.62
SGCAQ16586 B4GALT5-201ENST00000371711 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
SGCAQ16586 GNB2-209ENST00000436220 1479 ntTSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
SGCAQ16586 SIRT3-204ENST00000525319 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
SGCAQ16586 SPTBN4-201ENST00000338932 8686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
SGCAQ16586 CRHR1-201ENST00000293493 2621 ntTSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.62
SGCAQ16586 AFDN-202ENST00000351017 5823 ntTSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.62
SGCAQ16586 ZSCAN18-217ENST00000601144 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
SGCAQ16586 CCDC38-201ENST00000344280 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
SGCAQ16586 ZDHHC17-201ENST00000426126 5259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
SGCAQ16586 ACAA1-202ENST00000333167 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
SGCAQ16586 VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 1753 ntTSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
SGCAQ16586 KDM2A-202ENST00000398645 6511 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
SGCAQ16586 SORCS2-203ENST00000507866 6152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
SGCAQ16586 LHPP-203ENST00000392757 840 ntTSL 3 BASIC18.89■□□□□ 0.61
SGCAQ16586 ZFYVE28-207ENST00000509171 1135 ntTSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
SGCAQ16586 AP003419.1-201ENST00000535922 470 ntTSL 3 BASIC18.89■□□□□ 0.61
SGCAQ16586 AC005837.3-201ENST00000612163 286 ntBASIC18.89■□□□□ 0.61
SGCAQ16586 AC105233.4-201ENST00000642045 216 ntBASIC18.89■□□□□ 0.61
SGCAQ16586 AC026471.6-201ENST00000622954 1905 ntBASIC18.89■□□□□ 0.61
SGCAQ16586 TRABD2A-203ENST00000409520 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
SGCAQ16586 RCN2-202ENST00000394883 1366 ntTSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
SGCAQ16586 PGRMC2-201ENST00000296425 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
SGCAQ16586 GPSM1-201ENST00000291775 2114 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
SGCAQ16586 CYHR1-201ENST00000306145 1409 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
SGCAQ16586 ANKRD11-217ENST00000613312 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
SGCAQ16586 RBPJL-202ENST00000372741 1636 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
SGCAQ16586 QPCT-201ENST00000338415 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
SGCAQ16586 POC1B-209ENST00000549035 2038 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
SGCAQ16586 EBPL-204ENST00000378272 766 ntTSL 3 BASIC18.88■□□□□ 0.61
SGCAQ16586 OTUB1-212ENST00000543988 1259 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
SGCAQ16586 CTAG1A-201ENST00000593606 993 ntTSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
SGCAQ16586 C11orf96-201ENST00000339446 1308 ntTSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
SGCAQ16586 CCDC107-205ENST00000421582 1324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
SGCAQ16586 AKR7A2-201ENST00000235835 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
SGCAQ16586 ICAM5-201ENST00000221980 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
SGCAQ16586 TPM1-204ENST00000334895 1637 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
SGCAQ16586 LHPP-202ENST00000368842 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
SGCAQ16586 SCN1B-206ENST00000638536 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
SGCAQ16586 CTU2-202ENST00000453996 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
SGCAQ16586 KCTD13-202ENST00000561540 1773 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
SGCAQ16586 DTNBP1-201ENST00000338950 1880 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
SGCAQ16586 ADORA2A-AS1-203ENST00000427813 2027 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
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SGCAQ16586 FXYD7-201ENST00000270310 712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
SGCAQ16586 TMEM9B-201ENST00000309134 1659 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
SGCAQ16586 FOSL1-201ENST00000312562 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
SGCAQ16586 GTPBP6-201ENST00000326153 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
SGCAQ16586 SPAG16-202ENST00000331683 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
SGCAQ16586 AVPR2-203ENST00000370049 1307 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
SGCAQ16586 HES3-201ENST00000377898 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
SGCAQ16586 SPHK1-202ENST00000392496 1779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
SGCAQ16586 HES6-202ENST00000409002 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
SGCAQ16586 HSPE1-203ENST00000409729 478 ntTSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
SGCAQ16586 SEC22C-207ENST00000423701 1458 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
SGCAQ16586 LAMP5-AS1-201ENST00000443469 1928 ntTSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
SGCAQ16586 RANBP10-202ENST00000448631 2232 ntTSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
SGCAQ16586 SLC22A31-201ENST00000562855 1909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
SGCAQ16586 CTGF-201ENST00000367976 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
SGCAQ16586 P2RY2-203ENST00000393597 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
SGCAQ16586 ARID4B-203ENST00000366603 5946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
SGCAQ16586 PHLDB2-210ENST00000478922 1861 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
SGCAQ16586 ASL-203ENST00000380839 1765 ntTSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
SGCAQ16586 POMZP3-202ENST00000310842 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
SGCAQ16586 UQCR11-203ENST00000591899 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
SGCAQ16586 HYI-206ENST00000372434 1025 ntTSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
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