Protein–RNA interactions for Protein: Q16540

MRPL23, 39S ribosomal protein L23, mitochondrial, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 153 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MRPL23Q16540 ATP6V0A2-201ENST00000330342 6542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
MRPL23Q16540 WDR86-207ENST00000621812 1542 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
MRPL23Q16540 C22orf34-203ENST00000405854 1593 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
MRPL23Q16540 AC080112.2-201ENST00000578774 2094 ntTSL 4 BASIC15.07■□□□□ 0
MRPL23Q16540 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
MRPL23Q16540 SLC46A3-202ENST00000380814 2121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
MRPL23Q16540 KPTN-201ENST00000338134 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
MRPL23Q16540 CKMT1B-207ENST00000441322 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
MRPL23Q16540 SOX11-201ENST00000322002 8719 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
MRPL23Q16540 HES3-201ENST00000377898 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
MRPL23Q16540 FAM219A-202ENST00000379078 770 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
MRPL23Q16540 MIR572-201ENST00000384983 95 ntBASIC15.07■□□□□ 0
MRPL23Q16540 RBMS1-205ENST00000409972 1815 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
MRPL23Q16540 LINC00454-202ENST00000430978 1327 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
MRPL23Q16540 TBC1D22A-206ENST00000407381 1949 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
MRPL23Q16540 PLK5-202ENST00000454744 1930 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
MRPL23Q16540 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
MRPL23Q16540 LGI2-201ENST00000382114 6428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
MRPL23Q16540 B4GAT1-201ENST00000311181 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
MRPL23Q16540 UPF1-201ENST00000262803 5348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
MRPL23Q16540 NOXO1-201ENST00000354249 1618 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
MRPL23Q16540 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC15.06■□□□□ 0
MRPL23Q16540 NEU4-202ENST00000391969 2526 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
MRPL23Q16540 SH2B1-204ENST00000395532 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
MRPL23Q16540 GPRC5B-210ENST00000569847 1830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
MRPL23Q16540 STK11-201ENST00000326873 2611 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
MRPL23Q16540 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC15.06■□□□□ 0
MRPL23Q16540 MMEL1-206ENST00000502556 1943 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
MRPL23Q16540 AUTS2-201ENST00000342771 6173 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
MRPL23Q16540 POLR3GL-201ENST00000369313 818 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
MRPL23Q16540 CDC37L1-202ENST00000381858 1244 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
MRPL23Q16540 LINC01574-201ENST00000512115 560 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
MRPL23Q16540 SIRT3-215ENST00000532956 1235 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
MRPL23Q16540 AC010203.1-202ENST00000550096 695 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
MRPL23Q16540 CTAG1A-201ENST00000593606 993 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
MRPL23Q16540 AC105233.4-201ENST00000642045 216 ntBASIC15.06■□□□□ 0
MRPL23Q16540 COLEC12-201ENST00000400256 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
MRPL23Q16540 ARPC5L-201ENST00000259477 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
MRPL23Q16540 C11orf96-201ENST00000339446 1308 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
MRPL23Q16540 UQCR11-203ENST00000591899 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
MRPL23Q16540 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
MRPL23Q16540 GAS2L1-206ENST00000610653 2238 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
MRPL23Q16540 BIN1-209ENST00000393040 2293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
MRPL23Q16540 EFHD2-201ENST00000375980 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
MRPL23Q16540 ANAPC4-201ENST00000315368 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
MRPL23Q16540 ADGRG2-210ENST00000379878 4803 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
MRPL23Q16540 SLC25A39-201ENST00000225308 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
MRPL23Q16540 AC092053.2-201ENST00000640557 1818 ntBASIC15.06■□□□□ 0
MRPL23Q16540 PDLIM2-216ENST00000464275 1995 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ 0
MRPL23Q16540 AC080038.3-201ENST00000623346 1952 ntBASIC15.05■□□□□ 0
MRPL23Q16540 IER2-201ENST00000292433 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
MRPL23Q16540 PRMT5-204ENST00000397441 2418 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ 0
MRPL23Q16540 NECTIN1-201ENST00000264025 5840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
MRPL23Q16540 PCSK1N-201ENST00000218230 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
MRPL23Q16540 NGEF-203ENST00000409079 1022 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
MRPL23Q16540 MFF-208ENST00000409616 1247 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
MRPL23Q16540 HSPE1-203ENST00000409729 478 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
MRPL23Q16540 AC105265.2-201ENST00000467189 838 ntBASIC15.05■□□□□ -0
MRPL23Q16540 FEZ1-205ENST00000524435 750 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
MRPL23Q16540 CDKN2A-210ENST00000530628 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
MRPL23Q16540 Z97653.1-201ENST00000567096 446 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
MRPL23Q16540 AC012313.1-203ENST00000597980 570 ntTSL 4 BASIC15.05■□□□□ -0
MRPL23Q16540 SETD9-211ENST00000628593 1306 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
MRPL23Q16540 FPGS-202ENST00000373228 1383 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
MRPL23Q16540 NDUFAF1-201ENST00000260361 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
MRPL23Q16540 HMBS-201ENST00000278715 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
MRPL23Q16540 SNX21-212ENST00000491381 1607 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
MRPL23Q16540 ZNF410-206ENST00000540593 1722 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
MRPL23Q16540 USP21-202ENST00000368001 2095 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
MRPL23Q16540 RUNX3-202ENST00000338888 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
MRPL23Q16540 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
MRPL23Q16540 STRN4-202ENST00000391910 3628 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
MRPL23Q16540 DNAJA4-202ENST00000394852 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
MRPL23Q16540 PEX6-201ENST00000244546 2696 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
MRPL23Q16540 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
MRPL23Q16540 UCHL5-205ENST00000367454 1815 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
MRPL23Q16540 CBWD6-213ENST00000613716 1820 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
MRPL23Q16540 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
MRPL23Q16540 NOX4-209ENST00000527626 1774 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
MRPL23Q16540 BASP1-203ENST00000616743 1711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
MRPL23Q16540 MFSD7-209ENST00000515118 1556 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
MRPL23Q16540 CLN3-207ENST00000395653 1430 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
MRPL23Q16540 RELL2-205ENST00000518856 1419 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
MRPL23Q16540 AQP6-201ENST00000315520 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
MRPL23Q16540 KBTBD13-201ENST00000432196 1377 ntAPPRIS P1 BASIC15.04■□□□□ -0
MRPL23Q16540 EXOG-203ENST00000422077 1317 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
MRPL23Q16540 IRS3P-201ENST00000223076 1006 ntBASIC15.04■□□□□ -0
MRPL23Q16540 CLPSL2-201ENST00000360454 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
MRPL23Q16540 NINJ1-201ENST00000375446 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
MRPL23Q16540 OTUB1-212ENST00000543988 1259 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
MRPL23Q16540 FBXO33-202ENST00000554190 534 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
MRPL23Q16540 TRAF4-217ENST00000618771 543 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
MRPL23Q16540 LARGE2-208ENST00000531526 2528 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
MRPL23Q16540 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
MRPL23Q16540 CRB2-202ENST00000373631 5550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
MRPL23Q16540 TBC1D9-201ENST00000442267 5306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
MRPL23Q16540 WWC2-AS2-201ENST00000578387 2183 ntBASIC15.04■□□□□ -0
MRPL23Q16540 CNEP1R1-202ENST00000427478 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
MRPL23Q16540 CERS5-201ENST00000317551 2051 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
MRPL23Q16540 SPNS2-201ENST00000329078 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
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