Protein–RNA interactions for Protein: Q16531

DDB1, DNA damage-binding protein 1, humanhuman

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Length 1,140 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DDB1Q16531 TMEM5-201ENST00000261234 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
DDB1Q16531 KCNH6-203ENST00000580652 1703 ntTSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
DDB1Q16531 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
DDB1Q16531 MME-217ENST00000616757 1315 ntTSL 5 BASIC28.04■■■□□ 2.08
DDB1Q16531 RHOC-203ENST00000369632 1026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.04■■■□□ 2.08
DDB1Q16531 TMEM35B-201ENST00000373337 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
DDB1Q16531 PUSL1-201ENST00000379031 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
DDB1Q16531 CXADR-204ENST00000400166 1080 ntTSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
DDB1Q16531 PET117-201ENST00000432901 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
DDB1Q16531 NT5C3B-203ENST00000435506 975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.04■■■□□ 2.08
DDB1Q16531 SPI1-204ENST00000533968 1290 ntTSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
DDB1Q16531 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
DDB1Q16531 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
DDB1Q16531 C22orf34-203ENST00000405854 1593 ntTSL 5 BASIC28.03■■■□□ 2.08
DDB1Q16531 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.03■■■□□ 2.08
DDB1Q16531 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
DDB1Q16531 DHRS4-204ENST00000543741 1340 ntTSL 2 BASIC28.03■■■□□ 2.08
DDB1Q16531 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
DDB1Q16531 NENF-201ENST00000366988 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
DDB1Q16531 NCBP2-207ENST00000452404 1133 ntTSL 2 BASIC28.03■■■□□ 2.08
DDB1Q16531 AC092143.2-201ENST00000554623 985 ntTSL 3 BASIC28.03■■■□□ 2.08
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DDB1Q16531 YIF1B-213ENST00000591755 1077 ntTSL 2 BASIC28.03■■■□□ 2.08
DDB1Q16531 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
DDB1Q16531 PRR16-202ENST00000407149 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
DDB1Q16531 NOXO1-201ENST00000354249 1618 ntTSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
DDB1Q16531 TPPP3-204ENST00000562206 1410 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.02■■■□□ 2.08
DDB1Q16531 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
DDB1Q16531 UMAD1-202ENST00000463725 559 ntTSL 4 BASIC28.02■■■□□ 2.08
DDB1Q16531 ABHD1-207ENST00000621324 1078 ntTSL 5 BASIC28.02■■■□□ 2.08
DDB1Q16531 AL359736.2-201ENST00000621992 437 ntBASIC28.02■■■□□ 2.08
DDB1Q16531 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.02■■■□□ 2.08
DDB1Q16531 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
DDB1Q16531 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
DDB1Q16531 PTX4-203ENST00000447419 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.02■■■□□ 2.08
DDB1Q16531 RBM17P2-201ENST00000616397 1405 ntBASIC28.01■■■□□ 2.08
DDB1Q16531 DUSP9-202ENST00000370167 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
DDB1Q16531 HAUS4-205ENST00000541587 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
DDB1Q16531 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.01■■■□□ 2.07
DDB1Q16531 OLFM1-202ENST00000277415 1014 ntTSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
DDB1Q16531 NMRK1-201ENST00000361092 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
DDB1Q16531 F8A2-201ENST00000369505 1116 ntAPPRIS P1 BASIC28.01■■■□□ 2.07
DDB1Q16531 HTT-AS-201ENST00000503893 515 ntTSL 4 BASIC28.01■■■□□ 2.07
DDB1Q16531 RPS23-206ENST00000510210 1058 ntTSL 2 BASIC28.01■■■□□ 2.07
DDB1Q16531 ZNF264-205ENST00000599653 705 ntTSL 2 BASIC28.01■■■□□ 2.07
DDB1Q16531 FGF8-207ENST00000618991 856 ntTSL 3 BASIC28.01■■■□□ 2.07
DDB1Q16531 DBP-201ENST00000222122 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
DDB1Q16531 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC28.01■■■□□ 2.07
DDB1Q16531 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
DDB1Q16531 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
DDB1Q16531 CCS-208ENST00000533244 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
DDB1Q16531 KLF1-201ENST00000264834 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
DDB1Q16531 MRPL15-201ENST00000260102 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
DDB1Q16531 GGTLC1-201ENST00000278765 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
DDB1Q16531 CDC42EP5-201ENST00000301200 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
DDB1Q16531 BOLA1-203ENST00000369153 1096 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28■■■□□ 2.07
DDB1Q16531 GPR35-203ENST00000407714 1258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
DDB1Q16531 DLEU7-203ENST00000504404 1122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
DDB1Q16531 LINC01301-204ENST00000530725 577 ntTSL 4 BASIC28■■■□□ 2.07
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DDB1Q16531 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
DDB1Q16531 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
DDB1Q16531 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
DDB1Q16531 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
DDB1Q16531 AKR7A2-201ENST00000235835 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
DDB1Q16531 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
DDB1Q16531 QPCT-201ENST00000338415 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
DDB1Q16531 ART5-202ENST00000397067 1154 ntTSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
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DDB1Q16531 SSUH2-217ENST00000544814 1636 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.99■■■□□ 2.07
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DDB1Q16531 C15orf48-201ENST00000344300 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
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DDB1Q16531 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
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DDB1Q16531 RGCC-201ENST00000379359 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
DDB1Q16531 OTUB1-203ENST00000428192 1296 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.97■■■□□ 2.07
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DDB1Q16531 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
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DDB1Q16531 MIF4GD-202ENST00000325102 1306 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.96■■■□□ 2.07
DDB1Q16531 AC079328.2-202ENST00000560903 1410 ntTSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
DDB1Q16531 PHLDB3-207ENST00000599242 2286 ntTSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
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DDB1Q16531 LSM12P1-201ENST00000411836 588 ntBASIC27.96■■■□□ 2.07
DDB1Q16531 RNF146-206ENST00000480444 843 ntTSL 2 BASIC27.96■■■□□ 2.07
DDB1Q16531 PBX1-209ENST00000485769 834 ntTSL 2 BASIC27.96■■■□□ 2.07
DDB1Q16531 ATP6V0E2-211ENST00000606024 893 ntTSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
DDB1Q16531 FMR1-AS1_2.1-201ENST00000613724 127 ntBASIC27.96■■■□□ 2.07
DDB1Q16531 DHRS2-202ENST00000344777 1678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
DDB1Q16531 TMEM175-212ENST00000508204 1399 ntTSL 3 BASIC27.96■■■□□ 2.07
DDB1Q16531 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC27.96■■■□□ 2.07
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