Protein–RNA interactions for Protein: Q16385

SSX2, Protein SSX2, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SSX2Q16385 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
SSX2Q16385 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
SSX2Q16385 TBC1D9-201ENST00000442267 5306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
SSX2Q16385 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
SSX2Q16385 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
SSX2Q16385 PRMT2-204ENST00000397628 954 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
SSX2Q16385 CKLF-205ENST00000417030 628 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC17.67■□□□□ 0.42
SSX2Q16385 ZFYVE28-207ENST00000509171 1135 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
SSX2Q16385 PRSS22-203ENST00000571228 1037 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
SSX2Q16385 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
SSX2Q16385 AC009506.1-201ENST00000418474 1494 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
SSX2Q16385 UBE2B-201ENST00000265339 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
SSX2Q16385 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
SSX2Q16385 FYN-204ENST00000368678 2573 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
SSX2Q16385 TEX22-201ENST00000451127 2571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
SSX2Q16385 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
SSX2Q16385 DUSP9-201ENST00000342782 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
SSX2Q16385 CCDC102A-201ENST00000258214 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
SSX2Q16385 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
SSX2Q16385 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
SSX2Q16385 KDELR1-203ENST00000597017 1594 ntTSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
SSX2Q16385 LYSMD4-210ENST00000545021 2431 ntTSL 4 BASIC17.66■□□□□ 0.42
SSX2Q16385 YIF1B-202ENST00000337679 1257 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
SSX2Q16385 P2RX2-202ENST00000348800 1222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
SSX2Q16385 P2RX2-204ENST00000351222 1140 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
SSX2Q16385 INS-202ENST00000381330 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
SSX2Q16385 P2RX2-207ENST00000449132 1113 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
SSX2Q16385 AC010141.3-201ENST00000456659 717 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
SSX2Q16385 SLC39A3-203ENST00000545664 1219 ntTSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
SSX2Q16385 ANAPC4-201ENST00000315368 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
SSX2Q16385 EXOG-203ENST00000422077 1317 ntTSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
SSX2Q16385 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
SSX2Q16385 KCNQ5-202ENST00000355194 6566 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
SSX2Q16385 KCNQ5-206ENST00000402622 6596 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
SSX2Q16385 PGAM5-203ENST00000498926 2834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
SSX2Q16385 RIMKLB-202ENST00000357529 5830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
SSX2Q16385 P4HA3-202ENST00000427714 2248 ntTSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
SSX2Q16385 ZNF517-207ENST00000531720 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
SSX2Q16385 PAXIP1-202ENST00000404141 3827 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
SSX2Q16385 XPA-201ENST00000375128 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
SSX2Q16385 ANKRD9-201ENST00000286918 6727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
SSX2Q16385 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
SSX2Q16385 WT1-210ENST00000639563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
SSX2Q16385 MOSPD3-203ENST00000393950 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
SSX2Q16385 LINC00472-204ENST00000436803 667 ntTSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
SSX2Q16385 SPNS2-201ENST00000329078 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
SSX2Q16385 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
SSX2Q16385 WNT10B-201ENST00000301061 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
SSX2Q16385 HR-202ENST00000381418 6336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
SSX2Q16385 RBPJL-202ENST00000372741 1636 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
SSX2Q16385 FPGS-202ENST00000373228 1383 ntTSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
SSX2Q16385 IL17RC-202ENST00000383812 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
SSX2Q16385 IL17RC-203ENST00000403601 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
SSX2Q16385 PROB1-201ENST00000434752 5122 ntAPPRIS P1 BASIC17.65■□□□□ 0.42
SSX2Q16385 UBC-201ENST00000339647 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
SSX2Q16385 EDEM1-201ENST00000256497 6146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.42
SSX2Q16385 USP48-201ENST00000308271 4595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.42
SSX2Q16385 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
SSX2Q16385 POMZP3-202ENST00000310842 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
SSX2Q16385 B4GAT1-201ENST00000311181 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
SSX2Q16385 RELA-201ENST00000308639 2681 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
SSX2Q16385 MIR935-201ENST00000401179 91 ntBASIC17.64■□□□□ 0.41
SSX2Q16385 HES6-202ENST00000409002 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
SSX2Q16385 TBC1D4-201ENST00000377625 6182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
SSX2Q16385 SETD9-211ENST00000628593 1306 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
SSX2Q16385 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
SSX2Q16385 E2F1-201ENST00000343380 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
SSX2Q16385 GNA12-201ENST00000275364 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
SSX2Q16385 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
SSX2Q16385 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
SSX2Q16385 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
SSX2Q16385 DOCK9-206ENST00000427887 4176 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
SSX2Q16385 STAP2-206ENST00000600324 1508 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
SSX2Q16385 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
SSX2Q16385 RIMBP3-201ENST00000619918 6105 ntAPPRIS P1 BASIC17.63■□□□□ 0.41
SSX2Q16385 FAHD1-201ENST00000382666 1964 ntTSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
SSX2Q16385 NME4-201ENST00000219479 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
SSX2Q16385 NME4-202ENST00000382940 766 ntTSL 3 BASIC17.63■□□□□ 0.41
SSX2Q16385 MIR572-201ENST00000384983 95 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
SSX2Q16385 LHPP-203ENST00000392757 840 ntTSL 3 BASIC17.63■□□□□ 0.41
SSX2Q16385 SLC26A1-203ENST00000398520 1111 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
SSX2Q16385 AC061979.1-201ENST00000532061 434 ntTSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
SSX2Q16385 OTUB1-212ENST00000543988 1259 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
SSX2Q16385 NME4-211ENST00000620944 1193 ntTSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
SSX2Q16385 TANGO2-210ENST00000432883 2084 ntTSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
SSX2Q16385 GTPBP3-222ENST00000600625 2493 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
SSX2Q16385 PHLDA3-202ENST00000367311 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
SSX2Q16385 RHOBTB2-201ENST00000251822 5451 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
SSX2Q16385 TRAF4-205ENST00000444415 1456 ntTSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
SSX2Q16385 APAF1-210ENST00000551964 5444 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
SSX2Q16385 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
SSX2Q16385 ADGRL1-202ENST00000361434 5610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
SSX2Q16385 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
SSX2Q16385 KLHDC10-201ENST00000335420 6437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
SSX2Q16385 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
SSX2Q16385 PDLIM3-203ENST00000284771 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
SSX2Q16385 SMUG1-215ENST00000508394 1697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
SSX2Q16385 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
SSX2Q16385 RBM26-207ENST00000622611 5230 ntTSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
SSX2Q16385 PHLDB3-207ENST00000599242 2286 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
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