Protein–RNA interactions for Protein: Q16288

NTRK3, NT-3 growth factor receptor, humanhuman

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Length 839 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NTRK3Q16288 AC123595.1-201ENST00000440769 1046 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
NTRK3Q16288 LGR4-203ENST00000480977 492 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
NTRK3Q16288 AC104564.3-201ENST00000582367 638 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
NTRK3Q16288 LINC01089-202ENST00000429892 1521 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
NTRK3Q16288 TTYH1-201ENST00000301194 2088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
NTRK3Q16288 MPST-205ENST00000404802 1453 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.69■■□□□ 1.54
NTRK3Q16288 SPOP-206ENST00000504102 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
NTRK3Q16288 SERPINB5-201ENST00000382771 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
NTRK3Q16288 GRK4-201ENST00000345167 2013 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
NTRK3Q16288 C2orf72-201ENST00000373640 3657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
NTRK3Q16288 ILDR2-204ENST00000525740 2242 ntTSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
NTRK3Q16288 TFG-201ENST00000240851 1978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
NTRK3Q16288 DCTD-202ENST00000438320 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
NTRK3Q16288 LTC4S-202ENST00000401985 486 ntTSL 3 BASIC24.68■■□□□ 1.54
NTRK3Q16288 AC092675.2-201ENST00000413274 541 ntTSL 4 BASIC24.68■■□□□ 1.54
NTRK3Q16288 YBX1P1-201ENST00000445822 960 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
NTRK3Q16288 AL390816.2-201ENST00000554252 737 ntTSL 3 BASIC24.68■■□□□ 1.54
NTRK3Q16288 ORAI3-202ENST00000562699 628 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
NTRK3Q16288 CDKN2C-203ENST00000396148 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
NTRK3Q16288 RPS6-203ENST00000380384 1355 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
NTRK3Q16288 SLC2A11-202ENST00000316185 1555 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
NTRK3Q16288 EIF3J-202ENST00000424492 1550 ntTSL 4 BASIC24.67■■□□□ 1.54
NTRK3Q16288 LINC01140-202ENST00000467438 2375 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
NTRK3Q16288 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
NTRK3Q16288 PEX5-204ENST00000412720 2105 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
NTRK3Q16288 DTWD2-203ENST00000510708 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
NTRK3Q16288 Z98882.1-201ENST00000622160 2253 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
NTRK3Q16288 DHRS2-202ENST00000344777 1678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
NTRK3Q16288 AC073343.2-201ENST00000413182 548 ntTSL 4 BASIC24.67■■□□□ 1.54
NTRK3Q16288 AC093817.1-201ENST00000507296 812 ntTSL 3 BASIC24.67■■□□□ 1.54
NTRK3Q16288 TERF1P2-201ENST00000583350 1212 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
NTRK3Q16288 PRMT1-221ENST00000610806 1192 ntTSL 3 BASIC24.67■■□□□ 1.54
NTRK3Q16288 PRR20B-201ENST00000377930 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
NTRK3Q16288 PRR20A-201ENST00000377931 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
NTRK3Q16288 PRR20E-201ENST00000434815 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
NTRK3Q16288 PRR20D-201ENST00000452123 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
NTRK3Q16288 PRR20C-201ENST00000544357 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
NTRK3Q16288 PRR20C-202ENST00000614894 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
NTRK3Q16288 AC138649.1-201ENST00000619611 1449 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
NTRK3Q16288 CCDC189-206ENST00000543610 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
NTRK3Q16288 COMMD5-207ENST00000543949 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.67■■□□□ 1.54
NTRK3Q16288 FBXO27-202ENST00000509137 2130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
NTRK3Q16288 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
NTRK3Q16288 PDCD2-203ENST00000443345 1897 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
NTRK3Q16288 PPP1R3F-203ENST00000466508 1885 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
NTRK3Q16288 ARHGEF25-201ENST00000286494 2552 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
NTRK3Q16288 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
NTRK3Q16288 GDNF-203ENST00000381826 778 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
NTRK3Q16288 GDNF-204ENST00000427982 856 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
NTRK3Q16288 CHTF8-210ENST00000523421 766 ntTSL 3 BASIC24.66■■□□□ 1.54
NTRK3Q16288 GLI4-210ENST00000523522 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
NTRK3Q16288 ADRM1-204ENST00000491935 1530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
NTRK3Q16288 SGMS1-210ENST00000619438 1680 ntTSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
NTRK3Q16288 RAB1A-202ENST00000409751 1333 ntTSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
NTRK3Q16288 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
NTRK3Q16288 NDUFS3-201ENST00000263774 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
NTRK3Q16288 NEBL-AS1-202ENST00000439097 661 ntTSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
NTRK3Q16288 ARHGAP24-206ENST00000503995 1273 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
NTRK3Q16288 AL137779.2-201ENST00000554859 448 ntTSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
NTRK3Q16288 AC011511.3-201ENST00000587088 355 ntTSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
NTRK3Q16288 ELANE-202ENST00000590230 1028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
NTRK3Q16288 RAB43-208ENST00000615093 783 ntTSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
NTRK3Q16288 LINC02228-203ENST00000641970 1355 ntBASIC24.65■■□□□ 1.54
NTRK3Q16288 SEPT5-210ENST00000455784 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
NTRK3Q16288 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
NTRK3Q16288 CDCP1-202ENST00000425231 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
NTRK3Q16288 LRRC3C-201ENST00000377924 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.64■■□□□ 1.54
NTRK3Q16288 ASPDH-202ENST00000389208 1040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
NTRK3Q16288 PPM1N-207ENST00000451287 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
NTRK3Q16288 AP003071.3-201ENST00000562506 366 ntTSL 3 BASIC24.64■■□□□ 1.54
NTRK3Q16288 GNB1L-202ENST00000403325 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
NTRK3Q16288 CXCL16-203ENST00000574412 1668 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
NTRK3Q16288 PACRGL-227ENST00000513459 1773 ntTSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.53
NTRK3Q16288 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
NTRK3Q16288 CLN8-213ENST00000637156 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.53
NTRK3Q16288 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
NTRK3Q16288 NR2F2-204ENST00000453270 1712 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
NTRK3Q16288 ST3GAL3-207ENST00000353126 1969 ntTSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
NTRK3Q16288 CT47B1-201ENST00000371311 1328 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
NTRK3Q16288 AC135048.1-201ENST00000566056 1318 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
NTRK3Q16288 PUF60-203ENST00000453551 1842 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
NTRK3Q16288 AC133555.3-201ENST00000549950 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
NTRK3Q16288 AC106782.1-201ENST00000550538 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
NTRK3Q16288 HPCAL1-201ENST00000307845 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
NTRK3Q16288 POFUT1-201ENST00000375730 1507 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
NTRK3Q16288 MRPL14-201ENST00000372014 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
NTRK3Q16288 SDHAP3-201ENST00000436493 736 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
NTRK3Q16288 TPT1-AS1-211ENST00000520622 604 ntTSL 4 BASIC24.63■■□□□ 1.53
NTRK3Q16288 PTPN18-202ENST00000347849 2472 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
NTRK3Q16288 NOC4L-201ENST00000330579 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
NTRK3Q16288 AC009126.1-201ENST00000501338 2245 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
NTRK3Q16288 GPR27-201ENST00000304411 2447 ntAPPRIS P1 BASIC24.63■■□□□ 1.53
NTRK3Q16288 LPCAT4-201ENST00000314891 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
NTRK3Q16288 DACT1-204ENST00000541264 2610 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
NTRK3Q16288 RUNDC3B-207ENST00000493037 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
NTRK3Q16288 HBM-201ENST00000356815 506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
NTRK3Q16288 CCDC92B-201ENST00000575506 885 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
NTRK3Q16288 AC011446.1-201ENST00000591825 458 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
NTRK3Q16288 FARSA-201ENST00000314606 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
NTRK3Q16288 PPP1R12B-212ENST00000480184 1808 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
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