Protein–RNA interactions for Protein: Q15811

ITSN1, Intersectin-1, humanhuman

Predictions only

Length 1,721 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITSN1Q15811 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC29.31■■■□□ 2.28
ITSN1Q15811 LGALS9B-201ENST00000324290 1243 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC29.31■■■□□ 2.28
ITSN1Q15811 CUEDC2-201ENST00000369937 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
ITSN1Q15811 DUSP5P2-201ENST00000426873 1033 ntBASIC29.31■■■□□ 2.28
ITSN1Q15811 KHDRBS1-204ENST00000492989 1215 ntTSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
ITSN1Q15811 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
ITSN1Q15811 RASGRP2-207ENST00000377497 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
ITSN1Q15811 AL121761.1-202ENST00000412571 415 ntTSL 2 BASIC29.3■■■□□ 2.28
ITSN1Q15811 FAM229A-204ENST00000432622 699 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC29.3■■■□□ 2.28
ITSN1Q15811 TMEM9-209ENST00000485839 938 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC29.3■■■□□ 2.28
ITSN1Q15811 C19orf25-213ENST00000592872 1287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.3■■■□□ 2.28
ITSN1Q15811 RBMS1-205ENST00000409972 1815 ntTSL 5 BASIC29.29■■■□□ 2.28
ITSN1Q15811 ACOT8-201ENST00000217455 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
ITSN1Q15811 IPO13-201ENST00000372339 1201 ntTSL 2 BASIC29.29■■■□□ 2.28
ITSN1Q15811 RNF146-206ENST00000480444 843 ntTSL 2 BASIC29.29■■■□□ 2.28
ITSN1Q15811 C17orf107-202ENST00000521575 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
ITSN1Q15811 PLEKHJ1-205ENST00000587394 937 ntTSL 2 BASIC29.29■■■□□ 2.28
ITSN1Q15811 AC120498.10-201ENST00000621827 505 ntBASIC29.29■■■□□ 2.28
ITSN1Q15811 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
ITSN1Q15811 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
ITSN1Q15811 NEU4-204ENST00000405370 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
ITSN1Q15811 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC29.29■■■□□ 2.28
ITSN1Q15811 SDHC-201ENST00000342751 1127 ntTSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
ITSN1Q15811 TPT1-AS1-210ENST00000520590 873 ntTSL 5 BASIC29.28■■■□□ 2.28
ITSN1Q15811 AC138028.5-201ENST00000566114 558 ntTSL 5 BASIC29.28■■■□□ 2.28
ITSN1Q15811 JADE2-211ENST00000612830 1251 ntTSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
ITSN1Q15811 SPR-201ENST00000234454 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
ITSN1Q15811 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
ITSN1Q15811 POU5F1P4-201ENST00000413175 1085 ntBASIC29.28■■■□□ 2.28
ITSN1Q15811 CD44-222ENST00000526025 1052 ntTSL 2 BASIC29.28■■■□□ 2.28
ITSN1Q15811 DET1-205ENST00000558413 583 ntTSL 4 BASIC29.28■■■□□ 2.28
ITSN1Q15811 H2AFX-202ENST00000530167 1614 ntAPPRIS P1 BASIC29.28■■■□□ 2.28
ITSN1Q15811 KCNA2-206ENST00000638477 1524 ntTSL 5 BASIC29.27■■■□□ 2.28
ITSN1Q15811 KLF1-201ENST00000264834 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
ITSN1Q15811 RARRES2-201ENST00000223271 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
ITSN1Q15811 LINC00471-201ENST00000313064 1282 ntTSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
ITSN1Q15811 NAT16-202ENST00000443096 1286 ntTSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
ITSN1Q15811 AC011611.3-201ENST00000552367 569 ntTSL 4 BASIC29.27■■■□□ 2.28
ITSN1Q15811 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
ITSN1Q15811 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC29.27■■■□□ 2.28
ITSN1Q15811 FAHD1-202ENST00000382668 1845 ntTSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
ITSN1Q15811 DHRS2-202ENST00000344777 1678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
ITSN1Q15811 MMP23B-202ENST00000378675 1309 ntTSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
ITSN1Q15811 SOX18-201ENST00000340356 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
ITSN1Q15811 AC080112.2-201ENST00000578774 2094 ntTSL 4 BASIC29.27■■■□□ 2.28
ITSN1Q15811 ALG1-202ENST00000544428 1419 ntTSL 2 BASIC29.26■■■□□ 2.28
ITSN1Q15811 TM4SF5-201ENST00000270560 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
ITSN1Q15811 AL391244.2-201ENST00000428932 543 ntTSL 2 BASIC29.26■■■□□ 2.27
ITSN1Q15811 AKAIN1-201ENST00000434239 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.26■■■□□ 2.27
ITSN1Q15811 ANKRD65-202ENST00000442470 876 ntTSL 2 BASIC29.26■■■□□ 2.27
ITSN1Q15811 AC034102.6-201ENST00000550947 559 ntTSL 4 BASIC29.26■■■□□ 2.27
ITSN1Q15811 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
ITSN1Q15811 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC29.26■■■□□ 2.27
ITSN1Q15811 AQP6-201ENST00000315520 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
ITSN1Q15811 NFKBIL1-203ENST00000376148 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
ITSN1Q15811 MAL-201ENST00000309988 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
ITSN1Q15811 HSD17B10-202ENST00000375298 823 ntTSL 3 BASIC29.25■■■□□ 2.27
ITSN1Q15811 RPS2P52-201ENST00000469610 820 ntBASIC29.25■■■□□ 2.27
ITSN1Q15811 ZNF263-205ENST00000574253 1139 ntTSL 2 BASIC29.25■■■□□ 2.27
ITSN1Q15811 AC243732.1-201ENST00000612648 864 ntBASIC29.25■■■□□ 2.27
ITSN1Q15811 DUSP26-201ENST00000256261 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
ITSN1Q15811 TUB-201ENST00000299506 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
ITSN1Q15811 MEA1-201ENST00000244711 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
ITSN1Q15811 PSPN-201ENST00000245810 471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
ITSN1Q15811 POLR2J-202ENST00000393794 784 ntTSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
ITSN1Q15811 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
ITSN1Q15811 IGFBP1-203ENST00000468955 1369 ntTSL 5 BASIC29.25■■■□□ 2.27
ITSN1Q15811 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC29.24■■■□□ 2.27
ITSN1Q15811 AC010980.2-201ENST00000587099 1412 ntBASIC29.24■■■□□ 2.27
ITSN1Q15811 DUX4-204ENST00000569241 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
ITSN1Q15811 CAPN10-202ENST00000270364 1267 ntTSL 2 BASIC29.24■■■□□ 2.27
ITSN1Q15811 GAS7-202ENST00000396115 929 ntTSL 5 BASIC29.24■■■□□ 2.27
ITSN1Q15811 NREP-209ENST00000455559 698 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC29.24■■■□□ 2.27
ITSN1Q15811 DNAJA4-210ENST00000489435 947 ntTSL 3 BASIC29.24■■■□□ 2.27
ITSN1Q15811 TNIP2-203ENST00000503235 1653 ntTSL 3 BASIC29.24■■■□□ 2.27
ITSN1Q15811 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
ITSN1Q15811 BCAT2-208ENST00000598162 1329 ntTSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
ITSN1Q15811 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
ITSN1Q15811 PLEKHO1-201ENST00000369124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
ITSN1Q15811 GPR143-203ENST00000467482 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
ITSN1Q15811 SERF1A-201ENST00000317633 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
ITSN1Q15811 MAGI2-AS3-211ENST00000451809 707 ntTSL 3 BASIC29.23■■■□□ 2.27
ITSN1Q15811 AC091874.3-201ENST00000512672 1195 ntBASIC29.23■■■□□ 2.27
ITSN1Q15811 YIF1B-213ENST00000591755 1077 ntTSL 2 BASIC29.23■■■□□ 2.27
ITSN1Q15811 PTGIR-205ENST00000597185 775 ntTSL 3 BASIC29.23■■■□□ 2.27
ITSN1Q15811 C17orf50-201ENST00000603305 569 ntTSL 3 BASIC29.23■■■□□ 2.27
ITSN1Q15811 C17orf50-203ENST00000605587 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
ITSN1Q15811 SMARCB1-202ENST00000344921 1728 ntTSL 2 BASIC29.22■■■□□ 2.27
ITSN1Q15811 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.22■■■□□ 2.27
ITSN1Q15811 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
ITSN1Q15811 ART5-202ENST00000397067 1154 ntTSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
ITSN1Q15811 AC105001.1-201ENST00000506149 821 ntTSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
ITSN1Q15811 FAM32A-205ENST00000589852 1168 ntTSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
ITSN1Q15811 FGF13-208ENST00000626909 1039 ntTSL 2 BASIC29.22■■■□□ 2.27
ITSN1Q15811 AC018553.2-201ENST00000637770 1064 ntTSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
ITSN1Q15811 GSEC-202ENST00000629441 1572 ntTSL 2 BASIC29.22■■■□□ 2.27
ITSN1Q15811 GPR6-202ENST00000414000 1945 ntTSL 2 BASIC29.22■■■□□ 2.27
ITSN1Q15811 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC29.22■■■□□ 2.27
ITSN1Q15811 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
ITSN1Q15811 TANGO2-202ENST00000398042 2011 ntTSL 2 BASIC29.21■■■□□ 2.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.1 ms