Protein–RNA interactions for Protein: Q15361

TTF1, Transcription termination factor 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 905 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TTF1Q15361 CPED1-202ENST00000340646 1056 ntTSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
TTF1Q15361 KRT18P11-201ENST00000435214 1283 ntBASIC25.71■■□□□ 1.71
TTF1Q15361 RNF146-206ENST00000480444 843 ntTSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
TTF1Q15361 TMEM179B-205ENST00000533861 797 ntTSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
TTF1Q15361 COX4I1-216ENST00000568794 794 ntTSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
TTF1Q15361 HCFC1R1-207ENST00000574980 845 ntTSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
TTF1Q15361 SCN1B-203ENST00000595652 814 ntTSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
TTF1Q15361 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
TTF1Q15361 ASCL2-201ENST00000331289 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
TTF1Q15361 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
TTF1Q15361 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.7
TTF1Q15361 EFNA2-201ENST00000215368 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
TTF1Q15361 EFCAB6-202ENST00000356087 1129 ntTSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.7
TTF1Q15361 CCDC74B-205ENST00000409943 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
TTF1Q15361 ATP6V0B-205ENST00000472174 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
TTF1Q15361 AL731577.2-201ENST00000508096 555 ntTSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.7
TTF1Q15361 ZFPL1-203ENST00000525509 478 ntTSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.7
TTF1Q15361 C19orf84-201ENST00000570516 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
TTF1Q15361 MEIS3-212ENST00000561293 1918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
TTF1Q15361 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.7
TTF1Q15361 RBBP7-202ENST00000380084 2036 ntTSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.7
TTF1Q15361 SLC41A3-201ENST00000315891 1797 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
TTF1Q15361 GCH1-202ENST00000395514 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
TTF1Q15361 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
TTF1Q15361 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
TTF1Q15361 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
TTF1Q15361 MRPL37-206ENST00000605337 1582 ntTSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
TTF1Q15361 CNIH2-201ENST00000311445 1356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
TTF1Q15361 SPN-202ENST00000395389 1935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
TTF1Q15361 SEPT5-210ENST00000455784 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
TTF1Q15361 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
TTF1Q15361 FAHD1-202ENST00000382668 1845 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
TTF1Q15361 C10orf95-201ENST00000625129 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
TTF1Q15361 KRT18P20-201ENST00000548986 1279 ntBASIC25.68■■□□□ 1.7
TTF1Q15361 AC106820.5-201ENST00000566085 789 ntTSL 3 BASIC25.68■■□□□ 1.7
TTF1Q15361 FP565260.3-201ENST00000612610 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
TTF1Q15361 WWOX-218ENST00000627394 894 ntTSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
TTF1Q15361 LAMP5-AS1-201ENST00000443469 1928 ntTSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
TTF1Q15361 PACRGL-208ENST00000503585 1582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
TTF1Q15361 CCDC106-207ENST00000591578 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
TTF1Q15361 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
TTF1Q15361 CTU2-202ENST00000453996 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
TTF1Q15361 AC004911.1-201ENST00000416316 871 ntBASIC25.67■■□□□ 1.7
TTF1Q15361 GRPEL2-202ENST00000416916 1006 ntTSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
TTF1Q15361 SMIM12-202ENST00000423898 897 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
TTF1Q15361 ASRGL1-210ENST00000534571 639 ntTSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
TTF1Q15361 TRIM2-212ENST00000632856 656 ntTSL 3 BASIC25.67■■□□□ 1.7
TTF1Q15361 AL032819.3-201ENST00000640283 925 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
TTF1Q15361 MGAT4D-208ENST00000515354 1806 ntTSL 3 BASIC25.67■■□□□ 1.7
TTF1Q15361 GAS2L1P2-201ENST00000436355 1356 ntBASIC25.67■■□□□ 1.7
TTF1Q15361 AC010542.4-201ENST00000563151 1910 ntBASIC25.67■■□□□ 1.7
TTF1Q15361 COMMD5-207ENST00000543949 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.66■■□□□ 1.7
TTF1Q15361 LIN7B-201ENST00000221459 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
TTF1Q15361 OLFM1-206ENST00000371799 961 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
TTF1Q15361 MLLT10-204ENST00000377091 905 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
TTF1Q15361 LINC01816-201ENST00000414141 662 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
TTF1Q15361 LTB-211ENST00000446745 853 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
TTF1Q15361 SNAP23-214ENST00000567094 834 ntTSL 3 BASIC25.66■■□□□ 1.7
TTF1Q15361 IMPA2-212ENST00000625802 500 ntTSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
TTF1Q15361 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
TTF1Q15361 ACAA1-202ENST00000333167 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
TTF1Q15361 GCH1-206ENST00000543643 1897 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
TTF1Q15361 TTYH1-203ENST00000376531 1763 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
TTF1Q15361 POFUT1-201ENST00000375730 1507 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
TTF1Q15361 MRPL37-201ENST00000336230 1179 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
TTF1Q15361 RASGRP2-209ENST00000394429 453 ntTSL 3 BASIC25.65■■□□□ 1.7
TTF1Q15361 YBEY-204ENST00000397692 433 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
TTF1Q15361 BEX2-204ENST00000536889 1077 ntTSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
TTF1Q15361 SEC11A-208ENST00000559729 1256 ntTSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
TTF1Q15361 AC243773.2-201ENST00000616341 490 ntTSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
TTF1Q15361 OIP5-AS1-202ENST00000501665 1384 ntTSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
TTF1Q15361 SPRED3-202ENST00000586301 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
TTF1Q15361 B4GALNT1-203ENST00000449184 1633 ntTSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.7
TTF1Q15361 CYB5R4-201ENST00000369679 768 ntTSL 3 BASIC25.64■■□□□ 1.7
TTF1Q15361 C19orf24-201ENST00000409293 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.7
TTF1Q15361 ABCC6P2-202ENST00000542005 706 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
TTF1Q15361 ABCC6-204ENST00000575728 714 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
TTF1Q15361 SEPT4-215ENST00000580809 952 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
TTF1Q15361 RNASEH2B-206ENST00000611510 1257 ntTSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.7
TTF1Q15361 MRAS-202ENST00000423968 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
TTF1Q15361 C11orf96-202ENST00000528572 1834 ntBASIC25.64■■□□□ 1.7
TTF1Q15361 C16orf58-209ENST00000567994 1845 ntTSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.7
TTF1Q15361 C3orf18-205ENST00000441239 1490 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
TTF1Q15361 PSMD7-201ENST00000219313 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
TTF1Q15361 RARG-204ENST00000543726 1779 ntTSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.69
TTF1Q15361 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
TTF1Q15361 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
TTF1Q15361 LINC00682-201ENST00000498940 1625 ntTSL 3 BASIC25.63■■□□□ 1.69
TTF1Q15361 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
TTF1Q15361 DTYMK-201ENST00000305784 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
TTF1Q15361 TNFRSF18-203ENST00000379268 1179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
TTF1Q15361 IZUMO4-203ENST00000395307 944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
TTF1Q15361 ABHD14A-204ENST00000491470 674 ntTSL 3 BASIC25.63■■□□□ 1.69
TTF1Q15361 SPI1-203ENST00000533030 661 ntTSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
TTF1Q15361 LINC01976-201ENST00000565120 434 ntTSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
TTF1Q15361 HAS1-203ENST00000594621 760 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
TTF1Q15361 AC008175.2-201ENST00000612840 297 ntBASIC25.63■■□□□ 1.69
TTF1Q15361 TFG-210ENST00000620299 1289 ntTSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
TTF1Q15361 CXCL16-203ENST00000574412 1668 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
TTF1Q15361 RNF39-202ENST00000376751 1970 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
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