Protein–RNA interactions for Protein: Q15256

PTPRR, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase R, humanhuman

Predictions only

Length 657 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRRQ15256 ACYP2-201ENST00000303536 789 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
PTPRRQ15256 BCKDHB-203ENST00000369760 743 ntTSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
PTPRRQ15256 TMEM54-202ENST00000373463 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
PTPRRQ15256 KRTAP5-2-201ENST00000412090 1118 ntAPPRIS P1 BASIC21.4■■□□□ 1.02
PTPRRQ15256 AC019068.1-201ENST00000415226 552 ntTSL 4 BASIC21.4■■□□□ 1.02
PTPRRQ15256 RORB-AS1-201ENST00000417576 1178 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
PTPRRQ15256 CALM1-202ENST00000447653 1104 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
PTPRRQ15256 AC079140.4-201ENST00000507448 529 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
PTPRRQ15256 TMEM70-203ENST00000517439 617 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
PTPRRQ15256 H2AFB3-201ENST00000615853 591 ntAPPRIS P1 BASIC21.4■■□□□ 1.02
PTPRRQ15256 AC018553.2-201ENST00000637770 1064 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
PTPRRQ15256 PSMD7-201ENST00000219313 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
PTPRRQ15256 NDUFB2-212ENST00000476279 1666 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
PTPRRQ15256 FBXW4P1-201ENST00000426721 2239 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
PTPRRQ15256 MFSD14C-208ENST00000637864 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.02
PTPRRQ15256 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
PTPRRQ15256 CYB561D2-205ENST00000425346 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
PTPRRQ15256 AC135048.1-201ENST00000566056 1318 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
PTPRRQ15256 COX20-201ENST00000366528 568 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
PTPRRQ15256 GLI4-210ENST00000523522 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
PTPRRQ15256 AC012414.4-201ENST00000560839 1074 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
PTPRRQ15256 MIF4GD-211ENST00000580571 952 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
PTPRRQ15256 AL512625.3-202ENST00000591993 1091 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
PTPRRQ15256 AC060814.5-201ENST00000630916 1074 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
PTPRRQ15256 SLC35A3-213ENST00000638988 1286 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
PTPRRQ15256 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
PTPRRQ15256 PEX10-202ENST00000447513 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
PTPRRQ15256 HLA-C-203ENST00000383329 1554 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
PTPRRQ15256 CRHR1-201ENST00000293493 2621 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
PTPRRQ15256 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
PTPRRQ15256 RHBDD2-201ENST00000006777 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
PTPRRQ15256 AC079328.2-202ENST00000560903 1410 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
PTPRRQ15256 UCK2-201ENST00000367879 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
PTPRRQ15256 ZMYND11-210ENST00000403354 1664 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
PTPRRQ15256 TDRKH-205ENST00000368827 2318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
PTPRRQ15256 AC004528.2-201ENST00000610701 440 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
PTPRRQ15256 ADRM1-204ENST00000491935 1530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
PTPRRQ15256 GJB6-203ENST00000400065 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
PTPRRQ15256 SPTBN4-203ENST00000392023 2419 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
PTPRRQ15256 WRNIP1-204ENST00000380773 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
PTPRRQ15256 CTU2-202ENST00000453996 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
PTPRRQ15256 BCS1L-210ENST00000431802 2015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
PTPRRQ15256 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
PTPRRQ15256 SERTAD3-201ENST00000322354 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
PTPRRQ15256 LRP5L-203ENST00000444995 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
PTPRRQ15256 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
PTPRRQ15256 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
PTPRRQ15256 POTEC-204ENST00000620346 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
PTPRRQ15256 ZGPAT-201ENST00000328969 1945 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
PTPRRQ15256 CERKL-204ENST00000374970 1392 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
PTPRRQ15256 CSNK1G3-206ENST00000511130 1356 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
PTPRRQ15256 GUSB-201ENST00000304895 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
PTPRRQ15256 FDX2-202ENST00000393708 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
PTPRRQ15256 NAA35-202ENST00000376040 1797 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
PTPRRQ15256 CCDC38-201ENST00000344280 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
PTPRRQ15256 PDXK-205ENST00000398081 2251 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
PTPRRQ15256 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
PTPRRQ15256 SLC18A3-201ENST00000374115 2420 ntAPPRIS P1 BASIC21.37■■□□□ 1.01
PTPRRQ15256 IFNGR2-203ENST00000405436 1684 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
PTPRRQ15256 RAB28-208ENST00000630951 1679 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
PTPRRQ15256 SPI1-202ENST00000378538 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
PTPRRQ15256 ZNF467-201ENST00000302017 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
PTPRRQ15256 CBLN3-201ENST00000267406 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
PTPRRQ15256 DACT2-203ENST00000607983 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
PTPRRQ15256 SPATA22-214ENST00000575375 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
PTPRRQ15256 HLA-DPB1-211ENST00000418931 1560 ntAPPRIS P2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
PTPRRQ15256 ACVRL1-201ENST00000388922 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
PTPRRQ15256 TMEM121-201ENST00000392519 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
PTPRRQ15256 ATE1-AS1-201ENST00000437593 951 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
PTPRRQ15256 SYNGR2-201ENST00000225777 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
PTPRRQ15256 CDC14A-203ENST00000370124 1883 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
PTPRRQ15256 LAYN-201ENST00000375614 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
PTPRRQ15256 EPHA8-202ENST00000374644 1802 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
PTPRRQ15256 GFRA3-201ENST00000274721 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
PTPRRQ15256 KRT18P55-201ENST00000577198 1950 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
PTPRRQ15256 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
PTPRRQ15256 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
PTPRRQ15256 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
PTPRRQ15256 GTPBP6-201ENST00000326153 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
PTPRRQ15256 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
PTPRRQ15256 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
PTPRRQ15256 CHRAC1-203ENST00000519533 1678 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
PTPRRQ15256 CXCL16-203ENST00000574412 1668 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
PTPRRQ15256 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
PTPRRQ15256 HBM-201ENST00000356815 506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
PTPRRQ15256 AC108002.2-201ENST00000519782 340 ntTSL 4 BASIC21.35■■□□□ 1.01
PTPRRQ15256 MCRIP1-204ENST00000570507 765 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
PTPRRQ15256 MCRIP1-208ENST00000575061 618 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
PTPRRQ15256 AP001005.4-202ENST00000575325 560 ntTSL 4 BASIC21.35■■□□□ 1.01
PTPRRQ15256 PPP2R5E-204ENST00000555899 2164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
PTPRRQ15256 NOC4L-201ENST00000330579 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
PTPRRQ15256 ENTPD5-206ENST00000556242 1437 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
PTPRRQ15256 MFF-207ENST00000409565 1548 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
PTPRRQ15256 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
PTPRRQ15256 TERF1-202ENST00000276603 1677 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
PTPRRQ15256 SPIRE2-202ENST00000393062 2172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
PTPRRQ15256 CDKN1C-204ENST00000440480 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
PTPRRQ15256 FBXL14-201ENST00000339235 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
PTPRRQ15256 ORAI1-202ENST00000617316 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
PTPRRQ15256 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42 ms