Protein–RNA interactions for Protein: Q15223

NECTIN1, Nectin-1, humanhuman

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Length 517 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NECTIN1Q15223 MATK-203ENST00000395045 2073 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
NECTIN1Q15223 NFS1-204ENST00000397425 1956 ntTSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
NECTIN1Q15223 PDCD2-203ENST00000443345 1897 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
NECTIN1Q15223 CRHR1-201ENST00000293493 2621 ntTSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
NECTIN1Q15223 FARSA-201ENST00000314606 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
NECTIN1Q15223 TPTEP1-205ENST00000558085 1738 ntTSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
NECTIN1Q15223 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
NECTIN1Q15223 MTURN-203ENST00000409688 843 ntTSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
NECTIN1Q15223 TPRG1LP1-201ENST00000598702 760 ntBASIC25.35■■□□□ 1.65
NECTIN1Q15223 AL354811.1-201ENST00000610286 706 ntBASIC25.35■■□□□ 1.65
NECTIN1Q15223 FBXO17-201ENST00000292852 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
NECTIN1Q15223 HLA-C-201ENST00000376228 1536 ntAPPRIS P2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
NECTIN1Q15223 CCDC185-201ENST00000366875 2054 ntAPPRIS P1 BASIC25.35■■□□□ 1.65
NECTIN1Q15223 PRR20B-201ENST00000377930 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
NECTIN1Q15223 PRR20A-201ENST00000377931 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
NECTIN1Q15223 PRR20E-201ENST00000434815 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
NECTIN1Q15223 PRR20D-201ENST00000452123 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
NECTIN1Q15223 PRR20C-201ENST00000544357 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
NECTIN1Q15223 PRR20C-202ENST00000614894 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
NECTIN1Q15223 COMMD5-207ENST00000543949 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.35■■□□□ 1.65
NECTIN1Q15223 CDIPT-210ENST00000570016 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
NECTIN1Q15223 FEM1AP4-201ENST00000443167 1987 ntBASIC25.35■■□□□ 1.65
NECTIN1Q15223 ADCK2-201ENST00000072869 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
NECTIN1Q15223 RUSC1-AS1-203ENST00000450199 1636 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
NECTIN1Q15223 ZNF784-201ENST00000325351 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
NECTIN1Q15223 HPCAL1-201ENST00000307845 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
NECTIN1Q15223 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
NECTIN1Q15223 PPP3CC-203ENST00000397775 2094 ntTSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
NECTIN1Q15223 IFNGR2-203ENST00000405436 1684 ntTSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
NECTIN1Q15223 AC133555.3-201ENST00000549950 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
NECTIN1Q15223 AC106782.1-201ENST00000550538 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
NECTIN1Q15223 AP2S1-203ENST00000593442 636 ntTSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
NECTIN1Q15223 PBX4-201ENST00000251203 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
NECTIN1Q15223 NOXA1-202ENST00000392815 1464 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
NECTIN1Q15223 ALDH16A1-202ENST00000455361 2470 ntTSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
NECTIN1Q15223 MCAT-201ENST00000290429 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
NECTIN1Q15223 LTK-201ENST00000263800 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
NECTIN1Q15223 IRS3P-201ENST00000223076 1006 ntBASIC25.33■■□□□ 1.65
NECTIN1Q15223 C1QL1-201ENST00000253407 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
NECTIN1Q15223 PARD6B-202ENST00000396039 522 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
NECTIN1Q15223 PRKCQ-AS1-204ENST00000455810 920 ntTSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
NECTIN1Q15223 FEZ1-205ENST00000524435 750 ntTSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
NECTIN1Q15223 ECHDC2-221ENST00000536120 1446 ntTSL 3 BASIC25.33■■□□□ 1.65
NECTIN1Q15223 AC005229.4-201ENST00000610085 2198 ntBASIC25.33■■□□□ 1.65
NECTIN1Q15223 AL358852.1-201ENST00000623174 1268 ntBASIC25.33■■□□□ 1.65
NECTIN1Q15223 TMEM9B-205ENST00000534025 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
NECTIN1Q15223 DUSP2-201ENST00000288943 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
NECTIN1Q15223 GNB1L-202ENST00000403325 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
NECTIN1Q15223 ZFAND6-224ENST00000618205 1659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
NECTIN1Q15223 DOCK5-208ENST00000481100 2166 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
NECTIN1Q15223 RAB24-202ENST00000303270 1385 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
NECTIN1Q15223 SMPD5-201ENST00000528912 1390 ntTSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
NECTIN1Q15223 CLN8-213ENST00000637156 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
NECTIN1Q15223 PML-217ENST00000567543 1404 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
NECTIN1Q15223 TUNAR-203ENST00000554321 767 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC25.32■■□□□ 1.64
NECTIN1Q15223 HMCES-203ENST00000417226 1490 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
NECTIN1Q15223 MALT1-201ENST00000345724 2866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
NECTIN1Q15223 UNC119-201ENST00000301032 1653 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
NECTIN1Q15223 AC009014.1-201ENST00000607574 1667 ntAPPRIS P1 BASIC25.32■■□□□ 1.64
NECTIN1Q15223 SLC1A6-203ENST00000544886 2420 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
NECTIN1Q15223 DOK3-202ENST00000357198 1729 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
NECTIN1Q15223 KCNH6-203ENST00000580652 1703 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
NECTIN1Q15223 CPEB1-AS1-201ENST00000560650 2138 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
NECTIN1Q15223 SLC2A11-202ENST00000316185 1555 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
NECTIN1Q15223 LINC00969-219ENST00000453324 1439 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
NECTIN1Q15223 CLPSL2-201ENST00000360454 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
NECTIN1Q15223 FAM66D-201ENST00000434078 918 ntTSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
NECTIN1Q15223 DYM-203ENST00000442713 2147 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
NECTIN1Q15223 OSR1-201ENST00000272223 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
NECTIN1Q15223 ALKAL2-204ENST00000403610 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
NECTIN1Q15223 GRINA-202ENST00000395068 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
NECTIN1Q15223 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
NECTIN1Q15223 NABP2-202ENST00000341463 1411 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.3■■□□□ 1.64
NECTIN1Q15223 RORB-AS1-201ENST00000417576 1178 ntTSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
NECTIN1Q15223 PPP1R14A-205ENST00000591585 949 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
NECTIN1Q15223 AC010999.2-201ENST00000621974 596 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
NECTIN1Q15223 LRRC75A-201ENST00000409083 2656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
NECTIN1Q15223 POFUT1-201ENST00000375730 1507 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
NECTIN1Q15223 OLIG3-201ENST00000367734 2049 ntAPPRIS P1 BASIC25.3■■□□□ 1.64
NECTIN1Q15223 STK11-205ENST00000586243 2777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
NECTIN1Q15223 AF106564.1-201ENST00000607058 2553 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
NECTIN1Q15223 TEAD2-201ENST00000311227 2164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
NECTIN1Q15223 RASSF1-203ENST00000359365 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
NECTIN1Q15223 CD55-205ENST00000367067 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
NECTIN1Q15223 TSPY4-201ENST00000383008 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
NECTIN1Q15223 AL390816.2-201ENST00000554252 737 ntTSL 3 BASIC25.29■■□□□ 1.64
NECTIN1Q15223 MIR6084-201ENST00000622012 110 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
NECTIN1Q15223 C18orf8-214ENST00000615148 1958 ntTSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
NECTIN1Q15223 DHRS2-202ENST00000344777 1678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
NECTIN1Q15223 DDIT4-201ENST00000307365 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
NECTIN1Q15223 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
NECTIN1Q15223 MFSD3-201ENST00000301327 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
NECTIN1Q15223 NT5C3AP1-201ENST00000394500 1012 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
NECTIN1Q15223 AL355877.1-204ENST00000451482 1078 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
NECTIN1Q15223 SETD6-202ENST00000310682 2042 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
NECTIN1Q15223 HSD11B1L-218ENST00000581773 1687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
NECTIN1Q15223 CPNE9-203ENST00000383832 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
NECTIN1Q15223 APLP1-203ENST00000586861 2052 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
NECTIN1Q15223 AL024507.2-201ENST00000606070 2574 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
NECTIN1Q15223 OTOP1-201ENST00000296358 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
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