Protein–RNA interactions for Protein: Q15113

PCOLCE, Procollagen C-endopeptidase enhancer 1, humanhuman

Predictions only

Length 449 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCOLCEQ15113 XBP1-202ENST00000344347 1131 ntTSL 5 BASIC19.73■□□□□ 0.75
PCOLCEQ15113 KHDC3L-201ENST00000370367 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
PCOLCEQ15113 MIR663A-201ENST00000385250 93 ntBASIC19.73■□□□□ 0.75
PCOLCEQ15113 C19orf73-201ENST00000408991 744 ntAPPRIS P1 BASIC19.73■□□□□ 0.75
PCOLCEQ15113 HLA-L-209ENST00000420110 1011 ntBASIC19.73■□□□□ 0.75
PCOLCEQ15113 AC006970.2-201ENST00000450065 779 ntBASIC19.73■□□□□ 0.75
PCOLCEQ15113 SLC7A5P2-201ENST00000553010 536 ntBASIC19.73■□□□□ 0.75
PCOLCEQ15113 AC005697.1-201ENST00000582441 582 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC19.73■□□□□ 0.75
PCOLCEQ15113 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
PCOLCEQ15113 HLA-C-203ENST00000383329 1554 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.73■□□□□ 0.75
PCOLCEQ15113 MFSD6L-201ENST00000329805 2188 ntAPPRIS P1 BASIC19.73■□□□□ 0.75
PCOLCEQ15113 TUSC3-203ENST00000503731 1498 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
PCOLCEQ15113 KRT7-201ENST00000331817 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
PCOLCEQ15113 IL15RA-206ENST00000397248 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
PCOLCEQ15113 AC003102.1-202ENST00000563394 1796 ntBASIC19.72■□□□□ 0.75
PCOLCEQ15113 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC19.72■□□□□ 0.75
PCOLCEQ15113 CNEP1R1-202ENST00000427478 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
PCOLCEQ15113 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
PCOLCEQ15113 AL645608.9-201ENST00000442292 829 ntTSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
PCOLCEQ15113 AC037459.4-201ENST00000517384 585 ntTSL 4 BASIC19.72■□□□□ 0.75
PCOLCEQ15113 TMEM179B-205ENST00000533861 797 ntTSL 5 BASIC19.72■□□□□ 0.75
PCOLCEQ15113 LOXL1-AS1-208ENST00000565756 885 ntTSL 2 BASIC19.72■□□□□ 0.75
PCOLCEQ15113 AP005205.2-201ENST00000577327 491 ntTSL 2 BASIC19.72■□□□□ 0.75
PCOLCEQ15113 AP000547.3-201ENST00000592918 1576 ntTSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
PCOLCEQ15113 MBD3L1-202ENST00000595891 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.72■□□□□ 0.75
PCOLCEQ15113 F2RL3-202ENST00000599210 613 ntTSL 2 BASIC19.72■□□□□ 0.75
PCOLCEQ15113 MAZ-216ENST00000616501 991 ntTSL 5 BASIC19.72■□□□□ 0.75
PCOLCEQ15113 AC231657.2-201ENST00000624556 255 ntBASIC19.72■□□□□ 0.75
PCOLCEQ15113 FAHD1-202ENST00000382668 1845 ntTSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
PCOLCEQ15113 MRAS-202ENST00000423968 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
PCOLCEQ15113 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
PCOLCEQ15113 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
PCOLCEQ15113 LRP5L-203ENST00000444995 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.71■□□□□ 0.75
PCOLCEQ15113 EEFSEC-201ENST00000254730 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
PCOLCEQ15113 GAS2L1-206ENST00000610653 2238 ntTSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
PCOLCEQ15113 CEACAM4-201ENST00000221954 1205 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
PCOLCEQ15113 KANSL1-AS1-201ENST00000398275 517 ntTSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
PCOLCEQ15113 MAP2K4P1-201ENST00000438453 1195 ntBASIC19.71■□□□□ 0.75
PCOLCEQ15113 BX890604.1-207ENST00000486571 904 ntTSL 5 BASIC19.71■□□□□ 0.75
PCOLCEQ15113 SLC7A5P1-201ENST00000568957 537 ntBASIC19.71■□□□□ 0.75
PCOLCEQ15113 HERC2P5-204ENST00000569697 1214 ntTSL 2 BASIC19.71■□□□□ 0.75
PCOLCEQ15113 NDUFA6-AS1-207ENST00000595777 833 ntTSL 5 BASIC19.71■□□□□ 0.75
PCOLCEQ15113 CEACAM4-203ENST00000600925 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.71■□□□□ 0.75
PCOLCEQ15113 TRAPPC3-208ENST00000616074 1114 ntTSL 5 BASIC19.71■□□□□ 0.75
PCOLCEQ15113 TSPAN3-202ENST00000346495 1647 ntTSL 2 BASIC19.71■□□□□ 0.75
PCOLCEQ15113 ANKRD44-204ENST00000409919 1622 ntTSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
PCOLCEQ15113 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC19.71■□□□□ 0.75
PCOLCEQ15113 CASTOR1-201ENST00000404953 1460 ntTSL 5 BASIC19.71■□□□□ 0.75
PCOLCEQ15113 CREB3L3-202ENST00000595923 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
PCOLCEQ15113 AKT1S1-206ENST00000391834 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.71■□□□□ 0.75
PCOLCEQ15113 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC19.71■□□□□ 0.75
PCOLCEQ15113 TPD52L1-203ENST00000368402 1308 ntTSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
PCOLCEQ15113 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.71■□□□□ 0.75
PCOLCEQ15113 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.7■□□□□ 0.74
PCOLCEQ15113 GPSM1-201ENST00000291775 2114 ntTSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
PCOLCEQ15113 AC133065.2-201ENST00000573379 2147 ntTSL 2 BASIC19.7■□□□□ 0.74
PCOLCEQ15113 CXCL14-201ENST00000337225 1971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
PCOLCEQ15113 GCH1-202ENST00000395514 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
PCOLCEQ15113 POTED-202ENST00000620442 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
PCOLCEQ15113 HRASLS-201ENST00000264735 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
PCOLCEQ15113 CFD-201ENST00000327726 1201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
PCOLCEQ15113 MOB2-201ENST00000329957 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.7■□□□□ 0.74
PCOLCEQ15113 MANBAL-202ENST00000373606 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
PCOLCEQ15113 AC005789.1-201ENST00000585411 297 ntTSL 3 BASIC19.7■□□□□ 0.74
PCOLCEQ15113 ARFRP1-202ENST00000607873 1061 ntTSL 2 BASIC19.7■□□□□ 0.74
PCOLCEQ15113 AC008175.2-201ENST00000612840 297 ntBASIC19.7■□□□□ 0.74
PCOLCEQ15113 AC010536.3-201ENST00000620306 533 ntBASIC19.7■□□□□ 0.74
PCOLCEQ15113 FNDC5-207ENST00000640867 639 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.7■□□□□ 0.74
PCOLCEQ15113 CCM2-206ENST00000474617 1532 ntTSL 5 BASIC19.7■□□□□ 0.74
PCOLCEQ15113 CITED2-202ENST00000536159 1797 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.7■□□□□ 0.74
PCOLCEQ15113 CITED2-203ENST00000537332 1780 ntTSL 3 BASIC19.7■□□□□ 0.74
PCOLCEQ15113 TOR2A-201ENST00000336067 1370 ntTSL 2 BASIC19.7■□□□□ 0.74
PCOLCEQ15113 IER2-201ENST00000292433 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
PCOLCEQ15113 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
PCOLCEQ15113 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.69■□□□□ 0.74
PCOLCEQ15113 AC026471.6-201ENST00000622954 1905 ntBASIC19.69■□□□□ 0.74
PCOLCEQ15113 CCNG2-204ENST00000502280 1459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.69■□□□□ 0.74
PCOLCEQ15113 NXNL2-201ENST00000375854 805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.69■□□□□ 0.74
PCOLCEQ15113 PGPEP1L-201ENST00000378919 995 ntTSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
PCOLCEQ15113 ARL6IP4-205ENST00000412505 818 ntTSL 5 BASIC19.69■□□□□ 0.74
PCOLCEQ15113 AC007322.1-201ENST00000426983 750 ntBASIC19.69■□□□□ 0.74
PCOLCEQ15113 INTS11-205ENST00000429572 1104 ntTSL 2 BASIC19.69■□□□□ 0.74
PCOLCEQ15113 COL19A1-203ENST00000478620 589 ntTSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
PCOLCEQ15113 C12orf75-205ENST00000549893 719 ntTSL 3 BASIC19.69■□□□□ 0.74
PCOLCEQ15113 TMEM191B-201ENST00000612978 1220 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.69■□□□□ 0.74
PCOLCEQ15113 AL161421.1-201ENST00000619666 1101 ntTSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
PCOLCEQ15113 CD99-212ENST00000624481 1089 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.69■□□□□ 0.74
PCOLCEQ15113 PDLIM2-216ENST00000464275 1995 ntTSL 2 BASIC19.69■□□□□ 0.74
PCOLCEQ15113 TTYH1-203ENST00000376531 1763 ntTSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
PCOLCEQ15113 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.69■□□□□ 0.74
PCOLCEQ15113 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
PCOLCEQ15113 PLAGL1-207ENST00000417959 1645 ntTSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
PCOLCEQ15113 SPINT2-202ENST00000454580 1367 ntTSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
PCOLCEQ15113 CXCL16-203ENST00000574412 1668 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
PCOLCEQ15113 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
PCOLCEQ15113 GPR137-201ENST00000313074 1485 ntTSL 5 BASIC19.68■□□□□ 0.74
PCOLCEQ15113 GPR137-203ENST00000411458 1495 ntTSL 2 BASIC19.68■□□□□ 0.74
PCOLCEQ15113 PLPP7-202ENST00000372264 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
PCOLCEQ15113 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
PCOLCEQ15113 UQCRFS1P1-201ENST00000435169 820 ntBASIC19.68■□□□□ 0.74
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53.8 ms