Protein–RNA interactions for Protein: Q15080

NCF4, Neutrophil cytosol factor 4, humanhuman

Predictions only

Length 339 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NCF4Q15080 IDNK-204ENST00000454393 1210 ntTSL 3 BASIC20.43■□□□□ 0.86
NCF4Q15080 TMEM218-207ENST00000528724 1117 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
NCF4Q15080 TMEM218-214ENST00000532156 954 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
NCF4Q15080 VPS53-216ENST00000574029 585 ntTSL 4 BASIC20.43■□□□□ 0.86
NCF4Q15080 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.43■□□□□ 0.86
NCF4Q15080 PICK1-202ENST00000404072 2164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
NCF4Q15080 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC20.43■□□□□ 0.86
NCF4Q15080 AC004854.2-201ENST00000608450 1441 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
NCF4Q15080 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
NCF4Q15080 AP004607.4-201ENST00000530158 1459 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
NCF4Q15080 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
NCF4Q15080 ZNF664-207ENST00000539644 5108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
NCF4Q15080 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
NCF4Q15080 PRKACA-201ENST00000308677 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
NCF4Q15080 FOSL1-201ENST00000312562 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
NCF4Q15080 HOXA4-201ENST00000360046 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
NCF4Q15080 BASP1-203ENST00000616743 1711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.42■□□□□ 0.86
NCF4Q15080 ASL-203ENST00000380839 1765 ntTSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
NCF4Q15080 ARID4B-203ENST00000366603 5946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
NCF4Q15080 UCHL1-201ENST00000284440 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
NCF4Q15080 JSRP1-201ENST00000300961 1138 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
NCF4Q15080 LRRC3C-201ENST00000377924 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.42■□□□□ 0.86
NCF4Q15080 AC062017.1-203ENST00000413029 455 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
NCF4Q15080 AL590128.2-201ENST00000442889 415 ntTSL 3 BASIC20.42■□□□□ 0.86
NCF4Q15080 UCHL1-210ENST00000512788 785 ntTSL 3 BASIC20.42■□□□□ 0.86
NCF4Q15080 AL355102.2-201ENST00000553811 600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
NCF4Q15080 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
NCF4Q15080 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
NCF4Q15080 AC138649.1-201ENST00000619611 1449 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
NCF4Q15080 WWC2-AS2-201ENST00000578387 2183 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
NCF4Q15080 NR5A1-204ENST00000620110 2975 ntTSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
NCF4Q15080 TMEM121-201ENST00000392519 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
NCF4Q15080 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
NCF4Q15080 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
NCF4Q15080 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
NCF4Q15080 SOCS1-201ENST00000332029 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
NCF4Q15080 AIDA-202ENST00000355727 1072 ntTSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
NCF4Q15080 LTC4S-202ENST00000401985 486 ntTSL 3 BASIC20.41■□□□□ 0.86
NCF4Q15080 AP002748.1-201ENST00000504911 580 ntTSL 3 BASIC20.41■□□□□ 0.86
NCF4Q15080 AC137761.2-201ENST00000561729 223 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
NCF4Q15080 AC145350.3-201ENST00000569033 163 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
NCF4Q15080 RPS15-210ENST00000592623 873 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
NCF4Q15080 CPT2-209ENST00000636935 803 ntTSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
NCF4Q15080 ADAP2-204ENST00000580525 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
NCF4Q15080 MBNL3-202ENST00000370844 1643 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
NCF4Q15080 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
NCF4Q15080 MGAT5B-209ENST00000569840 4492 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
NCF4Q15080 OLFM1-206ENST00000371799 961 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
NCF4Q15080 CERKL-204ENST00000374970 1392 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
NCF4Q15080 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
NCF4Q15080 AC016769.1-201ENST00000409132 1010 ntBASIC20.4■□□□□ 0.86
NCF4Q15080 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC20.4■□□□□ 0.86
NCF4Q15080 AC006015.1-201ENST00000429970 570 ntBASIC20.4■□□□□ 0.86
NCF4Q15080 HNF4A-205ENST00000443598 1603 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
NCF4Q15080 PITX1-205ENST00000506438 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
NCF4Q15080 ZFAND6-224ENST00000618205 1659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
NCF4Q15080 GUSB-201ENST00000304895 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
NCF4Q15080 NOTUM-201ENST00000409678 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
NCF4Q15080 FARP2-223ENST00000627550 2122 ntTSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.86
NCF4Q15080 ZBTB7A-201ENST00000322357 5422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
NCF4Q15080 SNX18-203ENST00000381410 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
NCF4Q15080 SMIM10L2A-201ENST00000417443 5230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
NCF4Q15080 STAP2-206ENST00000600324 1508 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
NCF4Q15080 FGF12-AS2-201ENST00000443165 580 ntTSL 4 BASIC20.39■□□□□ 0.85
NCF4Q15080 AC079140.4-201ENST00000507448 529 ntBASIC20.39■□□□□ 0.85
NCF4Q15080 FAXDC2-211ENST00000520968 558 ntTSL 4 BASIC20.39■□□□□ 0.85
NCF4Q15080 HSD17B14-204ENST00000599157 991 ntTSL 3 BASIC20.39■□□□□ 0.85
NCF4Q15080 NELFCD-213ENST00000602795 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
NCF4Q15080 SLC35A3-204ENST00000427993 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
NCF4Q15080 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
NCF4Q15080 LINC01960-201ENST00000563759 1884 ntBASIC20.39■□□□□ 0.85
NCF4Q15080 AC242852.2-201ENST00000615738 1807 ntBASIC20.39■□□□□ 0.85
NCF4Q15080 KLC3-204ENST00000585434 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
NCF4Q15080 NOXA1-202ENST00000392815 1464 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
NCF4Q15080 AGAP1-205ENST00000409538 6138 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
NCF4Q15080 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
NCF4Q15080 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
NCF4Q15080 STX7-201ENST00000367937 1090 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
NCF4Q15080 DBI-210ENST00000542275 757 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
NCF4Q15080 AL032819.3-201ENST00000640283 925 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
NCF4Q15080 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
NCF4Q15080 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
NCF4Q15080 SAXO1-201ENST00000380530 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
NCF4Q15080 CACYBP-201ENST00000367679 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
NCF4Q15080 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
NCF4Q15080 LZTS3-201ENST00000329152 5257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
NCF4Q15080 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
NCF4Q15080 UBTF-213ENST00000533177 3011 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
NCF4Q15080 YWHAZ-205ENST00000395956 2974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
NCF4Q15080 GATA1-202ENST00000376670 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
NCF4Q15080 ZDHHC7-203ENST00000564466 1488 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
NCF4Q15080 INPP1-201ENST00000322522 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
NCF4Q15080 SMG7-AS1-201ENST00000421703 2220 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
NCF4Q15080 KRT19P1-201ENST00000405746 1186 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
NCF4Q15080 AC099681.3-201ENST00000421500 939 ntTSL 4 BASIC20.37■□□□□ 0.85
NCF4Q15080 SMIM12-202ENST00000423898 897 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
NCF4Q15080 CHTF8-210ENST00000523421 766 ntTSL 3 BASIC20.37■□□□□ 0.85
NCF4Q15080 COX4I1-216ENST00000568794 794 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
NCF4Q15080 C7orf25-203ENST00000431882 1645 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
NCF4Q15080 HABP4-201ENST00000375249 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
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