Protein–RNA interactions for Protein: Q15046

KARS, Lysine--tRNA ligase, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 597 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KARSQ15046 LRRC75A-203ENST00000470794 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
KARSQ15046 ZFAND2B-202ENST00000409097 1765 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
KARSQ15046 ASAP2-201ENST00000281419 5712 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
KARSQ15046 PSIP1-201ENST00000380715 1966 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
KARSQ15046 ZDHHC5-204ENST00000527985 2817 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
KARSQ15046 ZNF784-201ENST00000325351 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
KARSQ15046 COL8A2-203ENST00000481785 2036 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
KARSQ15046 JUNB-201ENST00000302754 1820 ntAPPRIS P1 BASIC24.03■■□□□ 1.44
KARSQ15046 OXCT2-201ENST00000327582 1826 ntAPPRIS P1 BASIC24.03■■□□□ 1.44
KARSQ15046 INAFM2-202ENST00000638170 3052 ntAPPRIS P1 BASIC24.03■■□□□ 1.44
KARSQ15046 AC244015.2-201ENST00000616358 1861 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
KARSQ15046 HYI-206ENST00000372434 1025 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
KARSQ15046 SIRT3-215ENST00000532956 1235 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
KARSQ15046 SLC26A5-209ENST00000393735 1947 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
KARSQ15046 TBL1Y-202ENST00000355162 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
KARSQ15046 GCH1-202ENST00000395514 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
KARSQ15046 TRIP13-201ENST00000166345 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
KARSQ15046 LCK-214ENST00000619559 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
KARSQ15046 AC003102.1-202ENST00000563394 1796 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
KARSQ15046 PFKFB3-216ENST00000625260 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
KARSQ15046 AP006587.3-201ENST00000525742 1516 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
KARSQ15046 MRPL46-201ENST00000312475 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
KARSQ15046 ORMDL1-202ENST00000392349 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
KARSQ15046 HES6-202ENST00000409002 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
KARSQ15046 MED14OS-201ENST00000456333 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
KARSQ15046 TGFBR1-202ENST00000374994 6516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
KARSQ15046 SERBP1-202ENST00000370990 1621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
KARSQ15046 ILDR2-204ENST00000525740 2242 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
KARSQ15046 CCNL1-203ENST00000461804 1998 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.43
KARSQ15046 MAGI2-202ENST00000419488 6800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
KARSQ15046 FXYD7-201ENST00000270310 712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
KARSQ15046 GLTPD2-201ENST00000331264 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
KARSQ15046 PRKCZ-AS1-201ENST00000333854 1253 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
KARSQ15046 CDKN2D-201ENST00000335766 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
KARSQ15046 STIM2-204ENST00000467087 5154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
KARSQ15046 B4GALNT1-203ENST00000449184 1633 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
KARSQ15046 HERC2P8-204ENST00000567073 1988 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
KARSQ15046 CHRNA7-203ENST00000454250 2093 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
KARSQ15046 DACT1-204ENST00000541264 2610 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
KARSQ15046 MXRA8-201ENST00000309212 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
KARSQ15046 CCDC106-207ENST00000591578 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
KARSQ15046 AC026310.3-201ENST00000625186 2373 ntBASIC24■■□□□ 1.43
KARSQ15046 RUNDC3B-207ENST00000493037 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
KARSQ15046 TTYH1-201ENST00000301194 2088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
KARSQ15046 WDR86-203ENST00000469830 1691 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
KARSQ15046 FAIM-203ENST00000393034 927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
KARSQ15046 PAFAH1B2-205ENST00000529887 1056 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
KARSQ15046 TRAF4-217ENST00000618771 543 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
KARSQ15046 MTX2-201ENST00000249442 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
KARSQ15046 ONECUT3-201ENST00000382349 8318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
KARSQ15046 NFS1-204ENST00000397425 1956 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
KARSQ15046 LRP5L-203ENST00000444995 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
KARSQ15046 FGFR2-211ENST00000369059 3003 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
KARSQ15046 PTPN18-202ENST00000347849 2472 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
KARSQ15046 CACNA1H-202ENST00000358590 8069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
KARSQ15046 PRDX4-202ENST00000379341 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
KARSQ15046 NGEF-203ENST00000409079 1022 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
KARSQ15046 AC105265.2-201ENST00000467189 838 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
KARSQ15046 SLC39A3-203ENST00000545664 1219 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
KARSQ15046 OSBPL10-204ENST00000438237 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
KARSQ15046 LINC00454-202ENST00000430978 1327 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
KARSQ15046 PRICKLE3-206ENST00000599218 2062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
KARSQ15046 TBR1-202ENST00000410035 1454 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
KARSQ15046 ZNF467-201ENST00000302017 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
KARSQ15046 VRK2-201ENST00000340157 1888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
KARSQ15046 CCDC189-206ENST00000543610 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
KARSQ15046 TANGO2-212ENST00000434570 2180 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
KARSQ15046 SAP30L-201ENST00000297109 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
KARSQ15046 URAD-201ENST00000332715 931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
KARSQ15046 FDX2-202ENST00000393708 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
KARSQ15046 RHOF-204ENST00000537265 699 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
KARSQ15046 TRAPPC6A-205ENST00000592647 514 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
KARSQ15046 AC012313.1-203ENST00000597980 570 ntTSL 4 BASIC23.98■■□□□ 1.43
KARSQ15046 ARHGEF25-201ENST00000286494 2552 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
KARSQ15046 ARPC5L-201ENST00000259477 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
KARSQ15046 MAPK8IP1P2-201ENST00000580257 1472 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
KARSQ15046 ZNF511-202ENST00000361518 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
KARSQ15046 DNAJA4-202ENST00000394852 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
KARSQ15046 MBNL3-202ENST00000370844 1643 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
KARSQ15046 FBXO27-202ENST00000509137 2130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
KARSQ15046 FMR1-201ENST00000218200 4333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
KARSQ15046 STOML2-201ENST00000356493 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
KARSQ15046 FRMD3-204ENST00000376438 2198 ntTSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
KARSQ15046 FAH-202ENST00000407106 2152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
KARSQ15046 POLR2H-204ENST00000438240 994 ntTSL 3 BASIC23.97■■□□□ 1.43
KARSQ15046 FEZ1-205ENST00000524435 750 ntTSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
KARSQ15046 SEC61A2-205ENST00000379033 2462 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
KARSQ15046 LPCAT4-201ENST00000314891 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
KARSQ15046 CDC14A-203ENST00000370124 1883 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
KARSQ15046 CBWD6-201ENST00000377391 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
KARSQ15046 TUB-203ENST00000534099 1759 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
KARSQ15046 SCRN2-212ENST00000584123 1745 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
KARSQ15046 SPRTN-201ENST00000008440 1667 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
KARSQ15046 BX005040.4-201ENST00000637145 1518 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
KARSQ15046 ZDHHC7-203ENST00000564466 1488 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
KARSQ15046 TFAP2A-202ENST00000379608 2576 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
KARSQ15046 MFF-208ENST00000409616 1247 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
KARSQ15046 ANKRD63-201ENST00000434396 1143 ntAPPRIS P1 BASIC23.96■■□□□ 1.43
KARSQ15046 C12orf43-208ENST00000539736 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
KARSQ15046 PTGDR-202ENST00000553372 1216 ntTSL 3 BASIC23.96■■□□□ 1.43
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