Protein–RNA interactions for Protein: Q15042

RAB3GAP1, Rab3 GTPase-activating protein catalytic subunit, humanhuman

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Length 981 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB3GAP1Q15042 ATP8A1-207ENST00000510289 2238 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
RAB3GAP1Q15042 RELA-201ENST00000308639 2681 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
RAB3GAP1Q15042 LINC01123-202ENST00000419296 2436 ntTSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
RAB3GAP1Q15042 EIF2B4-211ENST00000616081 1754 ntTSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
RAB3GAP1Q15042 TRIB3-201ENST00000217233 2499 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
RAB3GAP1Q15042 B4GAT1-201ENST00000311181 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
RAB3GAP1Q15042 RNF208-201ENST00000391553 1077 ntAPPRIS P1 BASIC25.85■■□□□ 1.73
RAB3GAP1Q15042 RNF208-202ENST00000392827 1135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
RAB3GAP1Q15042 ATE1-AS1-201ENST00000437593 951 ntTSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
RAB3GAP1Q15042 AC104986.2-201ENST00000521696 380 ntTSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
RAB3GAP1Q15042 NTF6G-201ENST00000591094 616 ntBASIC25.85■■□□□ 1.73
RAB3GAP1Q15042 XPA-201ENST00000375128 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
RAB3GAP1Q15042 DISC1-212ENST00000535983 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
RAB3GAP1Q15042 GSR-204ENST00000537535 1323 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
RAB3GAP1Q15042 AC005229.4-201ENST00000610085 2198 ntBASIC25.85■■□□□ 1.73
RAB3GAP1Q15042 DYRK3-202ENST00000367108 2218 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
RAB3GAP1Q15042 TCF7L1-201ENST00000282111 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
RAB3GAP1Q15042 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
RAB3GAP1Q15042 C5orf38-201ENST00000334000 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
RAB3GAP1Q15042 GXYLT1P2-201ENST00000433312 1230 ntBASIC25.84■■□□□ 1.73
RAB3GAP1Q15042 ZFPL1-203ENST00000525509 478 ntTSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
RAB3GAP1Q15042 CKMT1B-207ENST00000441322 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
RAB3GAP1Q15042 GATA3-AS1-204ENST00000438755 675 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
RAB3GAP1Q15042 BRD2-214ENST00000496118 735 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
RAB3GAP1Q15042 PDCD5-204ENST00000586035 601 ntTSL 3 BASIC25.83■■□□□ 1.73
RAB3GAP1Q15042 AL137784.2-201ENST00000607332 1000 ntBASIC25.83■■□□□ 1.73
RAB3GAP1Q15042 AVPR2-201ENST00000337474 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
RAB3GAP1Q15042 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
RAB3GAP1Q15042 GLI4-201ENST00000340042 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
RAB3GAP1Q15042 RFLNA-201ENST00000324038 2148 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
RAB3GAP1Q15042 P4HTM-202ENST00000383729 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
RAB3GAP1Q15042 EIF3J-202ENST00000424492 1550 ntTSL 4 BASIC25.82■■□□□ 1.72
RAB3GAP1Q15042 DUSP5-201ENST00000369583 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
RAB3GAP1Q15042 BCL2L12-201ENST00000246784 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
RAB3GAP1Q15042 NDUFS3-201ENST00000263774 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
RAB3GAP1Q15042 MFF-208ENST00000409616 1247 ntTSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
RAB3GAP1Q15042 AC145207.2-202ENST00000576554 565 ntTSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
RAB3GAP1Q15042 AC092437.1-201ENST00000624794 1048 ntBASIC25.82■■□□□ 1.72
RAB3GAP1Q15042 IMPA2-212ENST00000625802 500 ntTSL 2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
RAB3GAP1Q15042 KREMEN2-203ENST00000571007 1877 ntTSL 2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
RAB3GAP1Q15042 EML2-201ENST00000245925 2264 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
RAB3GAP1Q15042 AC096677.1-201ENST00000454651 1516 ntTSL 2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
RAB3GAP1Q15042 MIS18A-201ENST00000290130 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
RAB3GAP1Q15042 SPTBN4-203ENST00000392023 2419 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
RAB3GAP1Q15042 ARFGAP3-201ENST00000263245 2857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
RAB3GAP1Q15042 RBM42-203ENST00000588161 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
RAB3GAP1Q15042 LINC00969-219ENST00000453324 1439 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
RAB3GAP1Q15042 TOX2-201ENST00000341197 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
RAB3GAP1Q15042 POLR2F-205ENST00000442738 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
RAB3GAP1Q15042 TRIM3-202ENST00000359518 3042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
RAB3GAP1Q15042 SPN-202ENST00000395389 1935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
RAB3GAP1Q15042 CPNE7-202ENST00000319518 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
RAB3GAP1Q15042 HIST2H2AC-201ENST00000331380 390 ntAPPRIS P1 BASIC25.81■■□□□ 1.72
RAB3GAP1Q15042 RASGRP2-203ENST00000377486 667 ntTSL 3 BASIC25.81■■□□□ 1.72
RAB3GAP1Q15042 AC080013.1-202ENST00000465477 674 ntTSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
RAB3GAP1Q15042 SUZ12P1-202ENST00000578070 929 ntTSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
RAB3GAP1Q15042 LGI4-206ENST00000591633 1113 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
RAB3GAP1Q15042 TNFRSF11A-207ENST00000639222 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
RAB3GAP1Q15042 TBC1D22A-206ENST00000407381 1949 ntTSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
RAB3GAP1Q15042 ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 1409 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
RAB3GAP1Q15042 HTATIP2-204ENST00000451739 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
RAB3GAP1Q15042 DCAF4-202ENST00000358377 2024 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
RAB3GAP1Q15042 FAM120B-204ENST00000625626 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
RAB3GAP1Q15042 GRK3-203ENST00000619906 2873 ntTSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
RAB3GAP1Q15042 EPN1-201ENST00000085079 2355 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
RAB3GAP1Q15042 TPSG1-201ENST00000234798 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
RAB3GAP1Q15042 ZNF302-209ENST00000507959 854 ntTSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
RAB3GAP1Q15042 SLC35A3-213ENST00000638988 1286 ntTSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
RAB3GAP1Q15042 AC068587.7-201ENST00000641602 218 ntBASIC25.8■■□□□ 1.72
RAB3GAP1Q15042 ANKRD11-217ENST00000613312 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
RAB3GAP1Q15042 ZNF707-201ENST00000358656 2183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
RAB3GAP1Q15042 CCDC189-206ENST00000543610 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
RAB3GAP1Q15042 MAP2K5-204ENST00000395476 1689 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
RAB3GAP1Q15042 TMEFF1-201ENST00000374879 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
RAB3GAP1Q15042 UBA5-211ENST00000493720 2058 ntTSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
RAB3GAP1Q15042 PALM-202ENST00000338448 2725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
RAB3GAP1Q15042 NUTF2-201ENST00000219169 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
RAB3GAP1Q15042 UCN-201ENST00000296099 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
RAB3GAP1Q15042 TCTEX1D4-201ENST00000339355 763 ntAPPRIS P1 BASIC25.79■■□□□ 1.72
RAB3GAP1Q15042 AC092675.2-201ENST00000413274 541 ntTSL 4 BASIC25.79■■□□□ 1.72
RAB3GAP1Q15042 AC024267.6-201ENST00000580603 583 ntTSL 3 BASIC25.79■■□□□ 1.72
RAB3GAP1Q15042 AC004528.2-201ENST00000610701 440 ntTSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
RAB3GAP1Q15042 RARRES2P11-201ENST00000635158 484 ntBASIC25.79■■□□□ 1.72
RAB3GAP1Q15042 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
RAB3GAP1Q15042 PLEKHO1-201ENST00000369124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
RAB3GAP1Q15042 TALDO1-201ENST00000319006 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
RAB3GAP1Q15042 PBX4-201ENST00000251203 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
RAB3GAP1Q15042 LRRC34-201ENST00000446859 1718 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
RAB3GAP1Q15042 RASD1-202ENST00000579152 1404 ntTSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
RAB3GAP1Q15042 C1QL4-201ENST00000334221 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
RAB3GAP1Q15042 SGMS1-210ENST00000619438 1680 ntTSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
RAB3GAP1Q15042 TNFRSF18-202ENST00000379265 705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
RAB3GAP1Q15042 ASMT-202ENST00000381233 989 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
RAB3GAP1Q15042 ORMDL1-202ENST00000392349 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
RAB3GAP1Q15042 TRADD-202ENST00000486556 1833 ntTSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
RAB3GAP1Q15042 ITGBL1-206ENST00000618057 2368 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
RAB3GAP1Q15042 ZNF668-209ENST00000539836 2469 ntTSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
RAB3GAP1Q15042 AZIN2-204ENST00000373443 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
RAB3GAP1Q15042 PIKFYVE-203ENST00000392202 2039 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
RAB3GAP1Q15042 AC073130.3-201ENST00000624389 2278 ntBASIC25.77■■□□□ 1.72
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