Protein–RNA interactions for Protein: Q14549

GBX1, Homeobox protein GBX-1, humanhuman

Predictions only

Length 363 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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GBX1Q14549 HBM-201ENST00000356815 506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
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GBX1Q14549 AL390816.2-201ENST00000554252 737 ntTSL 3 BASIC20.82■□□□□ 0.92
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GBX1Q14549 SPAG16-202ENST00000331683 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
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GBX1Q14549 SH2B1-204ENST00000395532 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
GBX1Q14549 KCNH6-203ENST00000580652 1703 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
GBX1Q14549 BRSK2-212ENST00000531197 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
GBX1Q14549 KLHL17-205ENST00000622660 1950 ntTSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
GBX1Q14549 GALK1-201ENST00000225614 1445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
GBX1Q14549 RNPEP-201ENST00000295640 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
GBX1Q14549 TPT1-AS1-211ENST00000520622 604 ntTSL 4 BASIC20.81■□□□□ 0.92
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GBX1Q14549 GLI4-210ENST00000523522 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
GBX1Q14549 SP2-202ENST00000613139 908 ntTSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
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