Protein–RNA interactions for Protein: Q14139

UBE4A, Ubiquitin conjugation factor E4 A, humanhuman

Predictions only

Length 1,066 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBE4AQ14139 ELAC1-204ENST00000591429 975 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
UBE4AQ14139 SPINT2-202ENST00000454580 1367 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
UBE4AQ14139 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
UBE4AQ14139 STX5-201ENST00000294179 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
UBE4AQ14139 NFKBIL1-203ENST00000376148 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
UBE4AQ14139 PDK3-201ENST00000379162 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
UBE4AQ14139 GUSBP6-202ENST00000438529 1198 ntBASIC26.01■■□□□ 1.75
UBE4AQ14139 VIL1-204ENST00000440053 1454 ntTSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
UBE4AQ14139 MIR210HG-201ENST00000500447 1965 ntTSL 2 BASIC26.01■■□□□ 1.75
UBE4AQ14139 AC008175.2-201ENST00000612840 297 ntBASIC26.01■■□□□ 1.75
UBE4AQ14139 AC092053.2-201ENST00000640557 1818 ntBASIC26.01■■□□□ 1.75
UBE4AQ14139 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
UBE4AQ14139 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
UBE4AQ14139 SH2D5-202ENST00000444387 1934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
UBE4AQ14139 B4GALNT1-202ENST00000418555 1861 ntTSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
UBE4AQ14139 TRADD-202ENST00000486556 1833 ntTSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
UBE4AQ14139 TMPO-201ENST00000261210 820 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
UBE4AQ14139 APTR-203ENST00000430801 583 ntTSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
UBE4AQ14139 AC009086.2-201ENST00000449759 610 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26■■□□□ 1.75
UBE4AQ14139 AC021660.2-201ENST00000502999 388 ntTSL 3 BASIC26■■□□□ 1.75
UBE4AQ14139 CAMTA1-216ENST00000557126 486 ntTSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
UBE4AQ14139 AC005410.1-201ENST00000579522 462 ntTSL 3 BASIC26■■□□□ 1.75
UBE4AQ14139 AC013268.1-206ENST00000638368 961 ntBASIC26■■□□□ 1.75
UBE4AQ14139 AC112229.1-201ENST00000639295 961 ntBASIC26■■□□□ 1.75
UBE4AQ14139 LOXL1-201ENST00000261921 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
UBE4AQ14139 PLPP5-209ENST00000529359 2185 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
UBE4AQ14139 HEXB-201ENST00000261416 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
UBE4AQ14139 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
UBE4AQ14139 PGF-201ENST00000238607 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.99■■□□□ 1.75
UBE4AQ14139 POU5F1P4-201ENST00000413175 1085 ntBASIC25.99■■□□□ 1.75
UBE4AQ14139 PET100-202ENST00000594797 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
UBE4AQ14139 GGTLC3-201ENST00000619998 968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
UBE4AQ14139 MRAS-202ENST00000423968 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
UBE4AQ14139 NAA10-208ENST00000464845 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
UBE4AQ14139 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC25.99■■□□□ 1.75
UBE4AQ14139 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
UBE4AQ14139 MDK-204ENST00000395569 686 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
UBE4AQ14139 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
UBE4AQ14139 C19orf81-201ENST00000425202 765 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
UBE4AQ14139 AC007322.4-201ENST00000509611 723 ntBASIC25.98■■□□□ 1.75
UBE4AQ14139 AC133552.2-202ENST00000575694 574 ntBASIC25.98■■□□□ 1.75
UBE4AQ14139 HLA-C-203ENST00000383329 1554 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
UBE4AQ14139 SMAGP-205ENST00000603864 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
UBE4AQ14139 ST7L-201ENST00000343210 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
UBE4AQ14139 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
UBE4AQ14139 RHCE-204ENST00000349320 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
UBE4AQ14139 FAHD1-202ENST00000382668 1845 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
UBE4AQ14139 AKT1S1-206ENST00000391834 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
UBE4AQ14139 ZNF37BP-201ENST00000435805 1695 ntTSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
UBE4AQ14139 AC080038.3-201ENST00000623346 1952 ntBASIC25.97■■□□□ 1.75
UBE4AQ14139 CD8B-205ENST00000393761 932 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
UBE4AQ14139 CD8B-206ENST00000431506 692 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
UBE4AQ14139 SYNGR2-203ENST00000588282 1553 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
UBE4AQ14139 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
UBE4AQ14139 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
UBE4AQ14139 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
UBE4AQ14139 CCDC74A-201ENST00000295171 1543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
UBE4AQ14139 CCDC74B-201ENST00000310463 1549 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
UBE4AQ14139 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
UBE4AQ14139 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
UBE4AQ14139 AC003102.1-202ENST00000563394 1796 ntBASIC25.97■■□□□ 1.75
UBE4AQ14139 DUX4-203ENST00000565211 1710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
UBE4AQ14139 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
UBE4AQ14139 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
UBE4AQ14139 NFS1-201ENST00000306750 738 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
UBE4AQ14139 DHRS4-202ENST00000397074 785 ntTSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
UBE4AQ14139 MAGI2-AS3-209ENST00000448195 774 ntTSL 3 BASIC25.96■■□□□ 1.75
UBE4AQ14139 SEC23A-213ENST00000557280 561 ntTSL 4 BASIC25.96■■□□□ 1.75
UBE4AQ14139 AC120498.10-201ENST00000621827 505 ntBASIC25.96■■□□□ 1.75
UBE4AQ14139 RNF180-201ENST00000296615 1727 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
UBE4AQ14139 UNC119-202ENST00000335765 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
UBE4AQ14139 AC068338.2-201ENST00000563278 1430 ntBASIC25.96■■□□□ 1.75
UBE4AQ14139 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC25.96■■□□□ 1.75
UBE4AQ14139 H2AFX-202ENST00000530167 1614 ntAPPRIS P1 BASIC25.96■■□□□ 1.75
UBE4AQ14139 RARRES2-201ENST00000223271 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
UBE4AQ14139 AF201337.1-201ENST00000520239 748 ntBASIC25.95■■□□□ 1.74
UBE4AQ14139 ASPSCR1-211ENST00000581647 720 ntTSL 2 BASIC25.95■■□□□ 1.74
UBE4AQ14139 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.74
UBE4AQ14139 LINC00682-201ENST00000498940 1625 ntTSL 3 BASIC25.95■■□□□ 1.74
UBE4AQ14139 MEIS3-202ENST00000441740 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
UBE4AQ14139 RARG-204ENST00000543726 1779 ntTSL 2 BASIC25.95■■□□□ 1.74
UBE4AQ14139 LHFPL3-202ENST00000424859 1852 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
UBE4AQ14139 SMCO4-201ENST00000298966 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
UBE4AQ14139 BMP1-204ENST00000397814 836 ntTSL 4 BASIC25.94■■□□□ 1.74
UBE4AQ14139 JDP2-202ENST00000419727 972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.94■■□□□ 1.74
UBE4AQ14139 AGAP1-IT1-201ENST00000440498 664 ntTSL 3 BASIC25.94■■□□□ 1.74
UBE4AQ14139 DHRS4-207ENST00000559632 1003 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
UBE4AQ14139 AC018730.2-201ENST00000598623 443 ntTSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
UBE4AQ14139 LSM14B-201ENST00000279068 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
UBE4AQ14139 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
UBE4AQ14139 RAPSN-205ENST00000529341 1408 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
UBE4AQ14139 PML-217ENST00000567543 1404 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
UBE4AQ14139 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
UBE4AQ14139 LRP5L-203ENST00000444995 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
UBE4AQ14139 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
UBE4AQ14139 BST1-202ENST00000382346 1993 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
UBE4AQ14139 HAUS4-205ENST00000541587 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
UBE4AQ14139 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
UBE4AQ14139 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC25.93■■□□□ 1.74
UBE4AQ14139 SCO2-203ENST00000535425 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.93■■□□□ 1.74
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