Protein–RNA interactions for Protein: Q13936

CACNA1C, Voltage-dependent L-type calcium channel subunit alpha-1C, humanhuman

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Length 2,221 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CACNA1CQ13936 GAS2L1-207ENST00000611648 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.4■□□□□ 0.7
CACNA1CQ13936 EEFSEC-201ENST00000254730 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
CACNA1CQ13936 TESC-201ENST00000335209 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
CACNA1CQ13936 NXNL2-201ENST00000375854 805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.4■□□□□ 0.7
CACNA1CQ13936 PDXDC2P-202ENST00000527016 543 ntTSL 3 BASIC19.4■□□□□ 0.7
CACNA1CQ13936 TMEM98-206ENST00000579849 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
CACNA1CQ13936 WDR86-203ENST00000469830 1691 ntTSL 2 BASIC19.4■□□□□ 0.7
CACNA1CQ13936 CNNM4-201ENST00000377075 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
CACNA1CQ13936 SOAT2-201ENST00000301466 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
CACNA1CQ13936 NRL-203ENST00000397002 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
CACNA1CQ13936 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC19.4■□□□□ 0.7
CACNA1CQ13936 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
CACNA1CQ13936 PRRT4-207ENST00000535159 2897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.4■□□□□ 0.7
CACNA1CQ13936 HSCB-202ENST00000398941 955 ntTSL 2 BASIC19.4■□□□□ 0.7
CACNA1CQ13936 ITGA9-AS1-210ENST00000457661 738 ntTSL 4 BASIC19.4■□□□□ 0.7
CACNA1CQ13936 BID-214ENST00000617586 542 ntTSL 5 BASIC19.4■□□□□ 0.7
CACNA1CQ13936 DPH7-201ENST00000277540 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
CACNA1CQ13936 AC004687.1-201ENST00000579003 1625 ntBASIC19.4■□□□□ 0.7
CACNA1CQ13936 DOCK9-206ENST00000427887 4176 ntTSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
CACNA1CQ13936 HEXB-201ENST00000261416 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.7
CACNA1CQ13936 IMPA2-201ENST00000269159 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.7
CACNA1CQ13936 DENND2D-202ENST00000369752 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.39■□□□□ 0.7
CACNA1CQ13936 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.7
CACNA1CQ13936 GATA1-202ENST00000376670 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
CACNA1CQ13936 FAHD1-201ENST00000382666 1964 ntTSL 2 BASIC19.39■□□□□ 0.69
CACNA1CQ13936 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.39■□□□□ 0.69
CACNA1CQ13936 POLR3GL-201ENST00000369313 818 ntTSL 2 BASIC19.39■□□□□ 0.69
CACNA1CQ13936 RELL2-205ENST00000518856 1419 ntTSL 5 BASIC19.39■□□□□ 0.69
CACNA1CQ13936 AC080112.2-201ENST00000578774 2094 ntTSL 4 BASIC19.39■□□□□ 0.69
CACNA1CQ13936 NPY4R-201ENST00000374312 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
CACNA1CQ13936 NPY4R2-201ENST00000576178 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
CACNA1CQ13936 GAS2L1-206ENST00000610653 2238 ntTSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
CACNA1CQ13936 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
CACNA1CQ13936 AC127029.2-201ENST00000577329 502 ntTSL 3 BASIC19.39■□□□□ 0.69
CACNA1CQ13936 RBM42-203ENST00000588161 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
CACNA1CQ13936 STX4-202ENST00000394998 1498 ntTSL 2 BASIC19.38■□□□□ 0.69
CACNA1CQ13936 PPP3CC-202ENST00000289963 2135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
CACNA1CQ13936 ANKRD11-217ENST00000613312 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.38■□□□□ 0.69
CACNA1CQ13936 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC19.38■□□□□ 0.69
CACNA1CQ13936 RBM38-203ENST00000356208 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
CACNA1CQ13936 PCSK1N-201ENST00000218230 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
CACNA1CQ13936 FAM66D-201ENST00000434078 918 ntTSL 5 BASIC19.38■□□□□ 0.69
CACNA1CQ13936 TMEM41B-205ENST00000533723 723 ntTSL 2 BASIC19.38■□□□□ 0.69
CACNA1CQ13936 SELENOO-201ENST00000380903 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
CACNA1CQ13936 SELENOO-203ENST00000611222 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.38■□□□□ 0.69
CACNA1CQ13936 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
CACNA1CQ13936 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
CACNA1CQ13936 SPTBN4-203ENST00000392023 2419 ntTSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
CACNA1CQ13936 EMC7-201ENST00000256545 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
CACNA1CQ13936 AC006970.2-201ENST00000450065 779 ntBASIC19.37■□□□□ 0.69
CACNA1CQ13936 NDUFV2-AS1-201ENST00000582375 770 ntTSL 2 BASIC19.37■□□□□ 0.69
CACNA1CQ13936 SAV1-201ENST00000324679 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
CACNA1CQ13936 ZNF282-204ENST00000610704 3722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
CACNA1CQ13936 KIAA0895-204ENST00000415803 2865 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
CACNA1CQ13936 CHST7-201ENST00000276055 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
CACNA1CQ13936 RAPH1-210ENST00000453034 2394 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
CACNA1CQ13936 ICAM5-201ENST00000221980 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
CACNA1CQ13936 BX005040.4-201ENST00000637145 1518 ntBASIC19.37■□□□□ 0.69
CACNA1CQ13936 SPAG16-202ENST00000331683 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
CACNA1CQ13936 MLLT10-204ENST00000377091 905 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
CACNA1CQ13936 HAGH-201ENST00000397353 1257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
CACNA1CQ13936 AC061979.1-201ENST00000532061 434 ntTSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
CACNA1CQ13936 LINC02091-201ENST00000576171 1185 ntTSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
CACNA1CQ13936 SEPT4-215ENST00000580809 952 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
CACNA1CQ13936 AC092053.2-201ENST00000640557 1818 ntBASIC19.37■□□□□ 0.69
CACNA1CQ13936 FAM20C-201ENST00000313766 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
CACNA1CQ13936 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
CACNA1CQ13936 RNPEP-201ENST00000295640 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
CACNA1CQ13936 CCNYL1-202ENST00000339882 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
CACNA1CQ13936 XBP1-202ENST00000344347 1131 ntTSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
CACNA1CQ13936 KRT18P11-201ENST00000435214 1283 ntBASIC19.36■□□□□ 0.69
CACNA1CQ13936 ZNF696-204ENST00000520333 605 ntTSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
CACNA1CQ13936 UTS2R-201ENST00000313135 1357 ntAPPRIS P1 BASIC19.36■□□□□ 0.69
CACNA1CQ13936 POTED-202ENST00000620442 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
CACNA1CQ13936 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC19.36■□□□□ 0.69
CACNA1CQ13936 H1FX-201ENST00000333762 1507 ntAPPRIS P1 BASIC19.36■□□□□ 0.69
CACNA1CQ13936 PPT2-244ENST00000324816 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
CACNA1CQ13936 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
CACNA1CQ13936 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
CACNA1CQ13936 ATP8A1-207ENST00000510289 2238 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
CACNA1CQ13936 ZNF451-202ENST00000370702 458 ntTSL 2 BASIC19.36■□□□□ 0.69
CACNA1CQ13936 MT1M-201ENST00000379818 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
CACNA1CQ13936 NCF1B-203ENST00000435988 1254 ntBASIC19.36■□□□□ 0.69
CACNA1CQ13936 AP006621.1-202ENST00000528982 464 ntTSL 2 BASIC19.36■□□□□ 0.69
CACNA1CQ13936 AP003071.3-201ENST00000562506 366 ntTSL 3 BASIC19.36■□□□□ 0.69
CACNA1CQ13936 IGFALS-203ENST00000568221 730 ntTSL 4 BASIC19.36■□□□□ 0.69
CACNA1CQ13936 MYCN-201ENST00000281043 2602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
CACNA1CQ13936 CACNB3-205ENST00000547392 2237 ntTSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
CACNA1CQ13936 RITA1-202ENST00000549621 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
CACNA1CQ13936 ZNF584-203ENST00000593920 2187 ntTSL 2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
CACNA1CQ13936 MPPED1-203ENST00000443721 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
CACNA1CQ13936 CKMT1B-207ENST00000441322 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
CACNA1CQ13936 AC073343.2-201ENST00000413182 548 ntTSL 4 BASIC19.35■□□□□ 0.69
CACNA1CQ13936 LTB-211ENST00000446745 853 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
CACNA1CQ13936 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC19.35■□□□□ 0.69
CACNA1CQ13936 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.35■□□□□ 0.69
CACNA1CQ13936 MFSD11-216ENST00000590393 1141 ntBASIC19.35■□□□□ 0.69
CACNA1CQ13936 AC087239.1-201ENST00000622671 572 ntBASIC19.35■□□□□ 0.69
CACNA1CQ13936 PHOX2B-201ENST00000226382 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
CACNA1CQ13936 SLC19A1-209ENST00000485649 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
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