Protein–RNA interactions for Protein: Q13886

KLF9, Krueppel-like factor 9, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 244 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLF9Q13886 LGR4-202ENST00000389858 5163 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
KLF9Q13886 DISC1-204ENST00000366633 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
KLF9Q13886 DISC1-214ENST00000539444 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
KLF9Q13886 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
KLF9Q13886 TRPV6-209ENST00000638686 2298 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
KLF9Q13886 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
KLF9Q13886 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
KLF9Q13886 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
KLF9Q13886 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
KLF9Q13886 MRFAP1-201ENST00000320912 2049 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
KLF9Q13886 MGEA5-205ENST00000439817 5043 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
KLF9Q13886 LAYN-202ENST00000375615 1836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
KLF9Q13886 FA2H-201ENST00000219368 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
KLF9Q13886 TMEM189-201ENST00000371650 2222 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
KLF9Q13886 LGI3-202ENST00000424267 3114 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
KLF9Q13886 CERS1-202ENST00000542296 1947 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
KLF9Q13886 AP1S1-201ENST00000337619 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
KLF9Q13886 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
KLF9Q13886 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
KLF9Q13886 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
KLF9Q13886 HTATIP2-204ENST00000451739 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
KLF9Q13886 OGG1-202ENST00000302008 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
KLF9Q13886 AC006128.1-201ENST00000624704 1661 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
KLF9Q13886 RASL12-201ENST00000220062 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
KLF9Q13886 CCDC151-201ENST00000356392 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
KLF9Q13886 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
KLF9Q13886 RGMB-207ENST00000513185 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
KLF9Q13886 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
KLF9Q13886 RNF38-205ENST00000377877 1974 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
KLF9Q13886 HNRNPLL-204ENST00000409328 1908 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
KLF9Q13886 MAIP1-201ENST00000295079 1495 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
KLF9Q13886 STX4-201ENST00000313843 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
KLF9Q13886 SMIM19-203ENST00000417410 1466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
KLF9Q13886 CYP2A7-202ENST00000301146 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
KLF9Q13886 GPR62-201ENST00000322241 2191 ntAPPRIS P1 BASIC18.07■□□□□ 0.48
KLF9Q13886 DTX2-212ENST00000446820 1770 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
KLF9Q13886 AC138696.1-201ENST00000522452 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
KLF9Q13886 LYSMD4-210ENST00000545021 2431 ntTSL 4 BASIC18.07■□□□□ 0.48
KLF9Q13886 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
KLF9Q13886 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
KLF9Q13886 AC018553.2-201ENST00000637770 1064 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
KLF9Q13886 FUT5-202ENST00000588525 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
KLF9Q13886 AL020996.1-203ENST00000536896 2307 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
KLF9Q13886 SYT5-202ENST00000537500 2612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
KLF9Q13886 PNMA2-204ENST00000522362 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
KLF9Q13886 CAMK2B-207ENST00000358707 1895 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
KLF9Q13886 SCOC-207ENST00000506597 1838 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
KLF9Q13886 SLC35E4-202ENST00000406566 2081 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
KLF9Q13886 KLHL11-201ENST00000319121 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
KLF9Q13886 RGS11-204ENST00000397770 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
KLF9Q13886 TANGO2-202ENST00000398042 2011 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
KLF9Q13886 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
KLF9Q13886 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
KLF9Q13886 BIN2-210ENST00000615107 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
KLF9Q13886 ARRDC2-201ENST00000222250 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
KLF9Q13886 NHLRC1-201ENST00000340650 2248 ntAPPRIS P1 BASIC18.06■□□□□ 0.48
KLF9Q13886 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
KLF9Q13886 ZGPAT-206ENST00000448100 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
KLF9Q13886 HLA-C-203ENST00000383329 1554 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
KLF9Q13886 LMLN-204ENST00000420910 2423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
KLF9Q13886 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC18.06■□□□□ 0.48
KLF9Q13886 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
KLF9Q13886 FAM189B-201ENST00000350210 2379 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
KLF9Q13886 MFSD3-201ENST00000301327 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
KLF9Q13886 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
KLF9Q13886 MAF1-205ENST00000534585 1754 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
KLF9Q13886 GATA6-AS1-202ENST00000583490 1788 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
KLF9Q13886 SDK1-201ENST00000389531 7606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
KLF9Q13886 HS3ST3A1-201ENST00000284110 2527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
KLF9Q13886 SCAND1-202ENST00000373991 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
KLF9Q13886 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
KLF9Q13886 AC087289.5-201ENST00000586076 3175 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
KLF9Q13886 C22orf34-203ENST00000405854 1593 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
KLF9Q13886 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
KLF9Q13886 HPCAL1-201ENST00000307845 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
KLF9Q13886 RBM45-207ENST00000616198 1788 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
KLF9Q13886 REV1-201ENST00000258428 4751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
KLF9Q13886 HERC2P8-204ENST00000567073 1988 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
KLF9Q13886 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
KLF9Q13886 AC079089.2-201ENST00000531211 1277 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
KLF9Q13886 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
KLF9Q13886 NR2F2-204ENST00000453270 1712 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
KLF9Q13886 HMOX2-218ENST00000619913 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
KLF9Q13886 GRB14-201ENST00000263915 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
KLF9Q13886 DIO3-201ENST00000510508 2102 ntAPPRIS P1 BASIC18.05■□□□□ 0.48
KLF9Q13886 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
KLF9Q13886 SQLE-206ENST00000523430 1879 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
KLF9Q13886 MRGPRF-201ENST00000309099 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
KLF9Q13886 STMN3-201ENST00000370053 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
KLF9Q13886 CRMP1-201ENST00000324989 3146 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
KLF9Q13886 CSNK1D-203ENST00000392334 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
KLF9Q13886 NEIL3-201ENST00000264596 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
KLF9Q13886 SYNGR2-203ENST00000588282 1553 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
KLF9Q13886 CNTNAP3B-212ENST00000617422 2170 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
KLF9Q13886 KANK4-202ENST00000354381 2103 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
KLF9Q13886 CYB561-213ENST00000581573 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
KLF9Q13886 FAM91A1-207ENST00000521166 2706 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
KLF9Q13886 MAP3K14-AS1-203ENST00000585780 2475 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
KLF9Q13886 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
KLF9Q13886 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
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