Protein–RNA interactions for Protein: Q13796

SHROOM2, Protein Shroom2, humanhuman

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Length 1,616 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SHROOM2Q13796 NAPSA-201ENST00000253719 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.39■■■■□ 3.1
SHROOM2Q13796 KRT16P2-201ENST00000414673 1423 ntBASIC34.39■■■■□ 3.1
SHROOM2Q13796 TMEM191C-214ENST00000621561 1337 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC34.38■■■■□ 3.09
SHROOM2Q13796 RGCC-201ENST00000379359 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.38■■■■□ 3.09
SHROOM2Q13796 AL121761.1-202ENST00000412571 415 ntTSL 2 BASIC34.38■■■■□ 3.09
SHROOM2Q13796 CD44-222ENST00000526025 1052 ntTSL 2 BASIC34.38■■■■□ 3.09
SHROOM2Q13796 C1QBPP2-201ENST00000528754 825 ntBASIC34.38■■■■□ 3.09
SHROOM2Q13796 Z97653.1-201ENST00000567096 446 ntTSL 3 BASIC34.38■■■■□ 3.09
SHROOM2Q13796 AC097641.1-201ENST00000580671 588 ntTSL 4 BASIC34.38■■■■□ 3.09
SHROOM2Q13796 AC069544.1-201ENST00000609399 999 ntBASIC34.38■■■■□ 3.09
SHROOM2Q13796 AC244517.4-202ENST00000624089 484 ntTSL 3 BASIC34.38■■■■□ 3.09
SHROOM2Q13796 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.38■■■■□ 3.09
SHROOM2Q13796 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC34.38■■■■□ 3.09
SHROOM2Q13796 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.38■■■■□ 3.09
SHROOM2Q13796 SAC3D1-205ENST00000531072 1362 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.38■■■■□ 3.09
SHROOM2Q13796 LACTBL1-201ENST00000426928 1641 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC34.38■■■■□ 3.09
SHROOM2Q13796 EEF1D-225ENST00000529272 1311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC34.38■■■■□ 3.09
SHROOM2Q13796 SEPT5-210ENST00000455784 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.37■■■■□ 3.09
SHROOM2Q13796 EGFL7-202ENST00000371698 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.37■■■■□ 3.09
SHROOM2Q13796 ZDHHC20-204ENST00000415724 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.37■■■■□ 3.09
SHROOM2Q13796 Z99916.2-201ENST00000604037 246 ntBASIC34.37■■■■□ 3.09
SHROOM2Q13796 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC34.37■■■■□ 3.09
SHROOM2Q13796 ALG1-202ENST00000544428 1419 ntTSL 2 BASIC34.37■■■■□ 3.09
SHROOM2Q13796 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.37■■■■□ 3.09
SHROOM2Q13796 SMARCB1-202ENST00000344921 1728 ntTSL 2 BASIC34.37■■■■□ 3.09
SHROOM2Q13796 ST20-202ENST00000485386 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.37■■■■□ 3.09
SHROOM2Q13796 AC021087.1-201ENST00000512642 522 ntTSL 2 BASIC34.37■■■■□ 3.09
SHROOM2Q13796 AC073912.1-201ENST00000546264 587 ntTSL 3 BASIC34.37■■■■□ 3.09
SHROOM2Q13796 CLDN5-204ENST00000618236 1374 ntAPPRIS P1 BASIC34.36■■■■□ 3.09
SHROOM2Q13796 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC34.36■■■■□ 3.09
SHROOM2Q13796 AC068473.1-201ENST00000317008 1111 ntTSL 2 BASIC34.36■■■■□ 3.09
SHROOM2Q13796 PTPMT1-202ENST00000326674 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.36■■■■□ 3.09
SHROOM2Q13796 TCEAL6-202ENST00000372774 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.36■■■■□ 3.09
SHROOM2Q13796 YWHAZ-209ENST00000419477 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC34.36■■■■□ 3.09
SHROOM2Q13796 A3GALT2-201ENST00000442999 1023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.36■■■■□ 3.09
SHROOM2Q13796 PACRGL-227ENST00000513459 1773 ntTSL 5 BASIC34.36■■■■□ 3.09
SHROOM2Q13796 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.35■■■■□ 3.09
SHROOM2Q13796 AC012618.2-201ENST00000428058 849 ntBASIC34.35■■■■□ 3.09
SHROOM2Q13796 BX088651.1-201ENST00000540551 451 ntBASIC34.35■■■■□ 3.09
SHROOM2Q13796 CYP2T3P-201ENST00000601990 817 ntBASIC34.35■■■■□ 3.09
SHROOM2Q13796 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.35■■■■□ 3.09
SHROOM2Q13796 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.35■■■■□ 3.09
SHROOM2Q13796 KLF1-201ENST00000264834 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.34■■■■□ 3.09
SHROOM2Q13796 ASB18-201ENST00000409749 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.34■■■■□ 3.09
SHROOM2Q13796 OGG1-209ENST00000383826 1069 ntTSL 5 BASIC34.34■■■■□ 3.09
SHROOM2Q13796 PLEKHB2-203ENST00000404460 1167 ntTSL 2 BASIC34.34■■■■□ 3.09
SHROOM2Q13796 AL591742.1-201ENST00000604433 565 ntBASIC34.34■■■■□ 3.09
SHROOM2Q13796 FP565260.3-201ENST00000612610 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC34.34■■■■□ 3.09
SHROOM2Q13796 PHOSPHO2-206ENST00000616481 1252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC34.34■■■■□ 3.09
SHROOM2Q13796 PHOSPHO2-208ENST00000617738 1053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.34■■■■□ 3.09
SHROOM2Q13796 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC34.34■■■■□ 3.09
SHROOM2Q13796 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.34■■■■□ 3.09
SHROOM2Q13796 SCARB1-211ENST00000546215 1597 ntTSL 1 (best) BASIC34.34■■■■□ 3.09
SHROOM2Q13796 SMIM1-201ENST00000444870 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.33■■■■□ 3.09
SHROOM2Q13796 MRPL2-207ENST00000487429 905 ntTSL 1 (best) BASIC34.33■■■■□ 3.09
SHROOM2Q13796 HLA-B-256ENST00000639848 1089 ntBASIC34.33■■■■□ 3.09
SHROOM2Q13796 PTX4-203ENST00000447419 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.33■■■■□ 3.09
SHROOM2Q13796 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.33■■■■□ 3.09
SHROOM2Q13796 C10orf76-201ENST00000311122 724 ntTSL 1 (best) BASIC34.33■■■■□ 3.09
SHROOM2Q13796 LRRC26-201ENST00000371542 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.33■■■■□ 3.09
SHROOM2Q13796 ZFYVE1-202ENST00000394207 1183 ntTSL 2 BASIC34.33■■■■□ 3.09
SHROOM2Q13796 SFXN1-203ENST00000502393 637 ntTSL 2 BASIC34.33■■■■□ 3.09
SHROOM2Q13796 KCNH6-203ENST00000580652 1703 ntTSL 1 (best) BASIC34.33■■■■□ 3.09
SHROOM2Q13796 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.32■■■■□ 3.09
SHROOM2Q13796 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC34.32■■■■□ 3.08
SHROOM2Q13796 CALM1-202ENST00000447653 1104 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC34.32■■■■□ 3.08
SHROOM2Q13796 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC34.31■■■■□ 3.08
SHROOM2Q13796 AL161908.1-201ENST00000451449 449 ntTSL 2 BASIC34.31■■■■□ 3.08
SHROOM2Q13796 TNIK-208ENST00000465393 750 ntTSL 1 (best) BASIC34.31■■■■□ 3.08
SHROOM2Q13796 THAP6-213ENST00000514480 1161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.31■■■■□ 3.08
SHROOM2Q13796 PNMA6B-201ENST00000538162 1200 ntBASIC34.31■■■■□ 3.08
SHROOM2Q13796 MFSD7-203ENST00000404286 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.31■■■■□ 3.08
SHROOM2Q13796 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC34.31■■■■□ 3.08
SHROOM2Q13796 PLPP2-201ENST00000269812 1228 ntTSL 3 BASIC34.3■■■■□ 3.08
SHROOM2Q13796 AC093620.1-201ENST00000342963 583 ntTSL 3 BASIC34.3■■■■□ 3.08
SHROOM2Q13796 AL807752.2-201ENST00000435463 301 ntTSL 3 BASIC34.3■■■■□ 3.08
SHROOM2Q13796 NME6-213ENST00000451657 871 ntTSL 2 BASIC34.3■■■■□ 3.08
SHROOM2Q13796 KLF2-202ENST00000592003 564 ntTSL 3 BASIC34.3■■■■□ 3.08
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SHROOM2Q13796 NABP2-203ENST00000380198 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.3■■■■□ 3.08
SHROOM2Q13796 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC34.3■■■■□ 3.08
SHROOM2Q13796 C22orf34-203ENST00000405854 1593 ntTSL 5 BASIC34.3■■■■□ 3.08
SHROOM2Q13796 C20orf196-202ENST00000378979 585 ntTSL 2 BASIC34.3■■■■□ 3.08
SHROOM2Q13796 AL162258.1-201ENST00000497086 753 ntTSL 2 BASIC34.3■■■■□ 3.08
SHROOM2Q13796 CBLN1-202ENST00000536749 718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.3■■■■□ 3.08
SHROOM2Q13796 MAPK9-206ENST00000425491 2266 ntTSL 5 BASIC34.29■■■■□ 3.08
SHROOM2Q13796 IFNGR2-203ENST00000405436 1684 ntTSL 5 BASIC34.29■■■■□ 3.08
SHROOM2Q13796 SLX1A-201ENST00000251303 1091 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC34.29■■■■□ 3.08
SHROOM2Q13796 SLX1B-201ENST00000330181 1165 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC34.29■■■■□ 3.08
SHROOM2Q13796 LCN8-201ENST00000371688 867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.29■■■■□ 3.08
SHROOM2Q13796 TSPAN14-205ENST00000372158 1095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.29■■■■□ 3.08
SHROOM2Q13796 HLA-C-203ENST00000383329 1554 ntAPPRIS ALT2 BASIC34.29■■■■□ 3.08
SHROOM2Q13796 ALDH6A1-201ENST00000350259 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC34.29■■■■□ 3.08
SHROOM2Q13796 WDR37-206ENST00000620998 1303 ntTSL 5 BASIC34.28■■■■□ 3.08
SHROOM2Q13796 ACAT1-201ENST00000265838 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.28■■■■□ 3.08
SHROOM2Q13796 CLTA-202ENST00000345519 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC34.28■■■■□ 3.08
SHROOM2Q13796 FAM72A-203ENST00000367129 676 ntTSL 3 BASIC34.28■■■■□ 3.08
SHROOM2Q13796 CYYR1-202ENST00000400043 735 ntTSL 1 (best) BASIC34.28■■■■□ 3.08
SHROOM2Q13796 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC34.28■■■■□ 3.08
SHROOM2Q13796 CCDC74B-204ENST00000409234 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.28■■■■□ 3.08
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