Protein–RNA interactions for Protein: Q13751

LAMB3, Laminin subunit beta-3, humanhuman

Predictions only

Length 1,172 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LAMB3Q13751 SMARCD2-203ENST00000448276 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
LAMB3Q13751 PRSS22-201ENST00000161006 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
LAMB3Q13751 CTAG2-202ENST00000369585 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
LAMB3Q13751 AC091305.1-201ENST00000479476 895 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
LAMB3Q13751 AC142381.2-201ENST00000566120 298 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
LAMB3Q13751 SHOX2-203ENST00000441443 3038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
LAMB3Q13751 FBXL22-201ENST00000360587 1526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
LAMB3Q13751 UQCR11-203ENST00000591899 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
LAMB3Q13751 CTU2-202ENST00000453996 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
LAMB3Q13751 SMG7-AS1-201ENST00000421703 2220 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
LAMB3Q13751 FBXW4P1-201ENST00000426721 2239 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
LAMB3Q13751 RPS6KA2-201ENST00000265678 5824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
LAMB3Q13751 WNT10A-201ENST00000258411 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
LAMB3Q13751 STX10-202ENST00000343587 1128 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
LAMB3Q13751 GUK1-205ENST00000366722 850 ntTSL 3 BASIC21.53■■□□□ 1.04
LAMB3Q13751 RNF208-201ENST00000391553 1077 ntAPPRIS P1 BASIC21.53■■□□□ 1.04
LAMB3Q13751 HES6-202ENST00000409002 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
LAMB3Q13751 LRRC75A-AS1-202ENST00000470491 1057 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
LAMB3Q13751 AP001330.3-201ENST00000520123 633 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
LAMB3Q13751 FBXO33-202ENST00000554190 534 ntTSL 3 BASIC21.53■■□□□ 1.04
LAMB3Q13751 ACAP1-206ENST00000571471 320 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
LAMB3Q13751 MYO1C-203ENST00000438665 4898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
LAMB3Q13751 DISC1-205ENST00000366636 2224 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
LAMB3Q13751 BRWD1-202ENST00000341322 2495 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
LAMB3Q13751 ST3GAL4-201ENST00000227495 1790 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
LAMB3Q13751 CYHR1-201ENST00000306145 1409 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
LAMB3Q13751 RBBP7-202ENST00000380084 2036 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
LAMB3Q13751 AC010542.4-201ENST00000563151 1910 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
LAMB3Q13751 PIAS2-203ENST00000545673 1590 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
LAMB3Q13751 MANEAL-203ENST00000397631 2327 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
LAMB3Q13751 ZFP64-206ENST00000371523 2234 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
LAMB3Q13751 LIMS2-201ENST00000324938 2111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
LAMB3Q13751 DMPK-220ENST00000618091 2503 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
LAMB3Q13751 ADORA2A-AS1-203ENST00000427813 2027 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
LAMB3Q13751 CITED2-202ENST00000536159 1797 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.52■■□□□ 1.04
LAMB3Q13751 CITED2-203ENST00000537332 1780 ntTSL 3 BASIC21.52■■□□□ 1.04
LAMB3Q13751 PCSK1N-201ENST00000218230 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
LAMB3Q13751 LHPP-203ENST00000392757 840 ntTSL 3 BASIC21.52■■□□□ 1.04
LAMB3Q13751 SMUG1P1-201ENST00000590640 811 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
LAMB3Q13751 TMEM25-205ENST00000411589 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
LAMB3Q13751 CAPG-201ENST00000263867 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
LAMB3Q13751 SMURF1-202ENST00000361368 5581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
LAMB3Q13751 CCDC102A-201ENST00000258214 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
LAMB3Q13751 CKMT1B-207ENST00000441322 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
LAMB3Q13751 RFLNA-201ENST00000324038 2148 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.03
LAMB3Q13751 PTP4A3-203ENST00000520105 1866 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.03
LAMB3Q13751 MDFI-203ENST00000373051 1622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
LAMB3Q13751 C16orf59-201ENST00000361837 1662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
LAMB3Q13751 CLPSL2-201ENST00000360454 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
LAMB3Q13751 MIR939-201ENST00000401314 82 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
LAMB3Q13751 AC008443.4-201ENST00000503314 456 ntTSL 4 BASIC21.51■■□□□ 1.03
LAMB3Q13751 SYNGR2-203ENST00000588282 1553 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
LAMB3Q13751 QPCT-201ENST00000338415 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
LAMB3Q13751 AC025164.2-201ENST00000501008 1898 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
LAMB3Q13751 AC244015.2-201ENST00000616358 1861 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
LAMB3Q13751 GFRA3-201ENST00000274721 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
LAMB3Q13751 POC1B-209ENST00000549035 2038 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
LAMB3Q13751 PMPCA-201ENST00000371717 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
LAMB3Q13751 KIF12-202ENST00000468460 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
LAMB3Q13751 DOCK5-208ENST00000481100 2166 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
LAMB3Q13751 GRM6-201ENST00000231188 6143 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
LAMB3Q13751 CAPN12-201ENST00000328867 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
LAMB3Q13751 AL391422.3-201ENST00000603791 2761 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
LAMB3Q13751 SETD9-211ENST00000628593 1306 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
LAMB3Q13751 SIRT3-204ENST00000525319 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
LAMB3Q13751 TPM1-204ENST00000334895 1637 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
LAMB3Q13751 PRKACA-201ENST00000308677 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
LAMB3Q13751 AC243965.2-201ENST00000612576 2671 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
LAMB3Q13751 HOMEZ-201ENST00000357460 4971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
LAMB3Q13751 TRABD2A-203ENST00000409520 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
LAMB3Q13751 FPGS-202ENST00000373228 1383 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
LAMB3Q13751 SOX21-201ENST00000376945 2778 ntAPPRIS P1 BASIC21.5■■□□□ 1.03
LAMB3Q13751 SDK1-201ENST00000389531 7606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
LAMB3Q13751 ZDHHC5-204ENST00000527985 2817 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
LAMB3Q13751 PTPRJ-208ENST00000615445 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
LAMB3Q13751 TESC-201ENST00000335209 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
LAMB3Q13751 FGF8-204ENST00000347978 823 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
LAMB3Q13751 MCRIP1-205ENST00000572645 1038 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
LAMB3Q13751 FAM66C-208ENST00000541558 2087 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
LAMB3Q13751 SLC22A31-201ENST00000562855 1909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
LAMB3Q13751 NABP2-203ENST00000380198 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
LAMB3Q13751 TUB-203ENST00000534099 1759 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
LAMB3Q13751 LHPP-202ENST00000368842 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
LAMB3Q13751 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
LAMB3Q13751 FBXW11-203ENST00000393802 2181 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
LAMB3Q13751 WWC2-AS2-201ENST00000578387 2183 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
LAMB3Q13751 LINC01140-202ENST00000467438 2375 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
LAMB3Q13751 PON1-201ENST00000222381 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
LAMB3Q13751 JAKMIP1-201ENST00000282924 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
LAMB3Q13751 ACAA1-202ENST00000333167 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
LAMB3Q13751 NAA35-202ENST00000376040 1797 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
LAMB3Q13751 P2RX2-202ENST00000348800 1222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
LAMB3Q13751 P2RX2-204ENST00000351222 1140 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
LAMB3Q13751 FAM219A-202ENST00000379078 770 ntTSL 3 BASIC21.49■■□□□ 1.03
LAMB3Q13751 C16orf86-201ENST00000403458 1267 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
LAMB3Q13751 P2RX2-207ENST00000449132 1113 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
LAMB3Q13751 AF213884.3-201ENST00000563833 479 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
LAMB3Q13751 SEC22C-207ENST00000423701 1458 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
LAMB3Q13751 TSPY26P-201ENST00000476365 1326 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
LAMB3Q13751 BBC3-202ENST00000341983 1538 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
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