Protein–RNA interactions for Protein: Q13618

CUL3, Cullin-3, humanhuman

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Length 768 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CUL3Q13618 PRELID3B-201ENST00000355937 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
CUL3Q13618 AL391650.1-201ENST00000448923 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
CUL3Q13618 KLC3-204ENST00000585434 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
CUL3Q13618 TMEM161A-202ENST00000450333 1930 ntTSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
CUL3Q13618 FAM110D-201ENST00000374268 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
CUL3Q13618 TOP1MT-201ENST00000329245 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
CUL3Q13618 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
CUL3Q13618 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
CUL3Q13618 EPCAM-202ENST00000405271 1530 ntTSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
CUL3Q13618 ST8SIA2-201ENST00000268164 5708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
CUL3Q13618 MAPT-203ENST00000340799 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
CUL3Q13618 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
CUL3Q13618 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC20.99■□□□□ 0.95
CUL3Q13618 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC20.99■□□□□ 0.95
CUL3Q13618 DIAPH1-203ENST00000389057 5762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
CUL3Q13618 RHBDD2-201ENST00000006777 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
CUL3Q13618 MANEAL-202ENST00000373045 2685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
CUL3Q13618 RAP1B-204ENST00000393436 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
CUL3Q13618 CD7-207ENST00000584284 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
CUL3Q13618 HHIPL1-202ENST00000357223 2241 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
CUL3Q13618 GUCY1A3-210ENST00000513574 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
CUL3Q13618 DNAAF4-201ENST00000321149 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
CUL3Q13618 ARID4B-203ENST00000366603 5946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
CUL3Q13618 FAHD1-201ENST00000382666 1964 ntTSL 2 BASIC20.98■□□□□ 0.95
CUL3Q13618 IPO9-AS1-201ENST00000413035 839 ntTSL 3 BASIC20.98■□□□□ 0.95
CUL3Q13618 AC091982.4-201ENST00000623943 726 ntTSL 2 BASIC20.98■□□□□ 0.95
CUL3Q13618 IGFBP1-201ENST00000275525 1653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
CUL3Q13618 NXN-201ENST00000336868 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
CUL3Q13618 DLX2-201ENST00000234198 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
CUL3Q13618 KMT2B-201ENST00000420124 8469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
CUL3Q13618 NOX4-209ENST00000527626 1774 ntTSL 2 BASIC20.97■□□□□ 0.95
CUL3Q13618 ACADVL-202ENST00000350303 2191 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
CUL3Q13618 CRTC1-203ENST00000594658 2384 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
CUL3Q13618 KPTN-201ENST00000338134 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
CUL3Q13618 SOX4-201ENST00000244745 5852 ntAPPRIS P1 BASIC20.97■□□□□ 0.95
CUL3Q13618 ABHD16B-201ENST00000369916 1491 ntAPPRIS P1 BASIC20.97■□□□□ 0.95
CUL3Q13618 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
CUL3Q13618 TBL1Y-201ENST00000346432 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
CUL3Q13618 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
CUL3Q13618 TPTEP1-205ENST00000558085 1738 ntTSL 2 BASIC20.97■□□□□ 0.95
CUL3Q13618 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
CUL3Q13618 HEY2-201ENST00000368364 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
CUL3Q13618 KLHL11-201ENST00000319121 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
CUL3Q13618 OSR1-201ENST00000272223 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
CUL3Q13618 ATG4D-201ENST00000309469 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
CUL3Q13618 HCN2-201ENST00000251287 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
CUL3Q13618 AL157384.1-201ENST00000445995 2473 ntBASIC20.96■□□□□ 0.95
CUL3Q13618 Z98882.1-201ENST00000622160 2253 ntBASIC20.96■□□□□ 0.95
CUL3Q13618 ME2-206ENST00000638410 2289 ntTSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
CUL3Q13618 ME2-210ENST00000639255 2262 ntTSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
CUL3Q13618 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC20.96■□□□□ 0.95
CUL3Q13618 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC20.96■□□□□ 0.95
CUL3Q13618 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
CUL3Q13618 AL138724.1-201ENST00000606771 1088 ntBASIC20.96■□□□□ 0.95
CUL3Q13618 FGF2-202ENST00000608478 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
CUL3Q13618 CEBPA-201ENST00000498907 2631 ntAPPRIS P1 BASIC20.96■□□□□ 0.95
CUL3Q13618 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
CUL3Q13618 TCP11-202ENST00000311875 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
CUL3Q13618 NPY4R-201ENST00000374312 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
CUL3Q13618 NPY4R2-201ENST00000576178 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
CUL3Q13618 SERTAD3-201ENST00000322354 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
CUL3Q13618 GOLGA2P6-201ENST00000340929 2049 ntBASIC20.95■□□□□ 0.94
CUL3Q13618 AC090377.1-201ENST00000585691 1762 ntTSL 3 BASIC20.95■□□□□ 0.94
CUL3Q13618 USP21-202ENST00000368001 2095 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
CUL3Q13618 ALG9-215ENST00000616540 2069 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
CUL3Q13618 CDC14B-203ENST00000375242 2965 ntTSL 2 BASIC20.95■□□□□ 0.94
CUL3Q13618 NEK3-208ENST00000618534 2414 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
CUL3Q13618 PWWP2A-205ENST00000523662 1819 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
CUL3Q13618 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
CUL3Q13618 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
CUL3Q13618 UBE2J2-203ENST00000360466 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.95■□□□□ 0.94
CUL3Q13618 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
CUL3Q13618 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
CUL3Q13618 TIMM50-201ENST00000314349 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
CUL3Q13618 COL13A1-202ENST00000357811 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
CUL3Q13618 HAUS7-202ENST00000370211 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
CUL3Q13618 SPAST-204ENST00000621856 1715 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
CUL3Q13618 SHISA7-201ENST00000376325 6033 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.95■□□□□ 0.94
CUL3Q13618 CHN1-203ENST00000409156 1761 ntTSL 2 BASIC20.95■□□□□ 0.94
CUL3Q13618 CNTD2-202ENST00000430325 1817 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
CUL3Q13618 MAFF-204ENST00000426621 2216 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.94■□□□□ 0.94
CUL3Q13618 ZNF446-208ENST00000622313 1884 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
CUL3Q13618 SH2D5-202ENST00000444387 1934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
CUL3Q13618 PHACTR2-203ENST00000367584 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
CUL3Q13618 ME2-202ENST00000382927 2492 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
CUL3Q13618 NRXN2-201ENST00000265459 6621 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
CUL3Q13618 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
CUL3Q13618 MYD88-205ENST00000424893 1279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
CUL3Q13618 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
CUL3Q13618 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
CUL3Q13618 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
CUL3Q13618 A1BG-201ENST00000263100 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
CUL3Q13618 SETD6-202ENST00000310682 2042 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
CUL3Q13618 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC20.93■□□□□ 0.94
CUL3Q13618 WISP2-203ENST00000372868 1600 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.93■□□□□ 0.94
CUL3Q13618 MDFI-203ENST00000373051 1622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
CUL3Q13618 KCNQ1-202ENST00000335475 2159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
CUL3Q13618 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
CUL3Q13618 ZDHHC14-203ENST00000359775 7380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
CUL3Q13618 NEU4-205ENST00000407683 2273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.93■□□□□ 0.94
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