Protein–RNA interactions for Protein: Q13562

NEUROD1, Neurogenic differentiation factor 1, humanhuman

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Length 356 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEUROD1Q13562 TRABD2A-203ENST00000409520 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.33■■■□□ 2.61
NEUROD1Q13562 SSBP3-216ENST00000610401 3168 ntTSL 5 BASIC31.33■■■□□ 2.61
NEUROD1Q13562 CIZ1-206ENST00000372954 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.33■■■□□ 2.61
NEUROD1Q13562 RNF180-201ENST00000296615 1727 ntTSL 1 (best) BASIC31.32■■■□□ 2.61
NEUROD1Q13562 SNX21-212ENST00000491381 1607 ntTSL 1 (best) BASIC31.32■■■□□ 2.6
NEUROD1Q13562 TRIB3-201ENST00000217233 2499 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.32■■■□□ 2.6
NEUROD1Q13562 B4GALNT1-202ENST00000418555 1861 ntTSL 2 BASIC31.32■■■□□ 2.6
NEUROD1Q13562 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC31.32■■■□□ 2.6
NEUROD1Q13562 RNF166-202ENST00000537718 1525 ntTSL 2 BASIC31.32■■■□□ 2.6
NEUROD1Q13562 IL15RA-206ENST00000397248 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.32■■■□□ 2.6
NEUROD1Q13562 ESR2-204ENST00000353772 2454 ntTSL 1 (best) BASIC31.32■■■□□ 2.6
NEUROD1Q13562 ZNF48-201ENST00000320159 3234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.32■■■□□ 2.6
NEUROD1Q13562 ZNF37BP-201ENST00000435805 1695 ntTSL 5 BASIC31.32■■■□□ 2.6
NEUROD1Q13562 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.31■■■□□ 2.6
NEUROD1Q13562 AKT1S1-206ENST00000391834 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.31■■■□□ 2.6
NEUROD1Q13562 CCM2-206ENST00000474617 1532 ntTSL 5 BASIC31.31■■■□□ 2.6
NEUROD1Q13562 UBC-201ENST00000339647 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.31■■■□□ 2.6
NEUROD1Q13562 C16orf86-201ENST00000403458 1267 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.31■■■□□ 2.6
NEUROD1Q13562 TUSC3-209ENST00000509380 1266 ntTSL 5 BASIC31.31■■■□□ 2.6
NEUROD1Q13562 AL138963.3-201ENST00000610057 588 ntTSL 4 BASIC31.31■■■□□ 2.6
NEUROD1Q13562 CPNE7-202ENST00000319518 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.3■■■□□ 2.6
NEUROD1Q13562 UQCR11-203ENST00000591899 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.3■■■□□ 2.6
NEUROD1Q13562 LGALS9B-201ENST00000324290 1243 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC31.3■■■□□ 2.6
NEUROD1Q13562 NT5C3AP1-201ENST00000394500 1012 ntBASIC31.3■■■□□ 2.6
NEUROD1Q13562 FAM222B-213ENST00000583522 556 ntTSL 2 BASIC31.3■■■□□ 2.6
NEUROD1Q13562 AP2S1-203ENST00000593442 636 ntTSL 2 BASIC31.3■■■□□ 2.6
NEUROD1Q13562 AC012313.1-203ENST00000597980 570 ntTSL 4 BASIC31.3■■■□□ 2.6
NEUROD1Q13562 AL354811.1-201ENST00000610286 706 ntBASIC31.3■■■□□ 2.6
NEUROD1Q13562 AL358852.1-201ENST00000623174 1268 ntBASIC31.3■■■□□ 2.6
NEUROD1Q13562 AC009126.1-201ENST00000501338 2245 ntTSL 2 BASIC31.3■■■□□ 2.6
NEUROD1Q13562 OXCT2-201ENST00000327582 1826 ntAPPRIS P1 BASIC31.3■■■□□ 2.6
NEUROD1Q13562 DUX4-203ENST00000565211 1710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.29■■■□□ 2.6
NEUROD1Q13562 WEE1-202ENST00000450114 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.29■■■□□ 2.6
NEUROD1Q13562 CAMKK2-208ENST00000412367 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.29■■■□□ 2.6
NEUROD1Q13562 ZSCAN18-217ENST00000601144 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.29■■■□□ 2.6
NEUROD1Q13562 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC31.29■■■□□ 2.6
NEUROD1Q13562 MBNL3-202ENST00000370844 1643 ntTSL 1 (best) BASIC31.29■■■□□ 2.6
NEUROD1Q13562 E4F1-204ENST00000564139 2493 ntTSL 1 (best) BASIC31.29■■■□□ 2.6
NEUROD1Q13562 CYC1-201ENST00000318911 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.29■■■□□ 2.6
NEUROD1Q13562 CEP104-201ENST00000378223 1121 ntTSL 1 (best) BASIC31.29■■■□□ 2.6
NEUROD1Q13562 NMRAL1-202ENST00000404295 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.29■■■□□ 2.6
NEUROD1Q13562 SP2-202ENST00000613139 908 ntTSL 5 BASIC31.29■■■□□ 2.6
NEUROD1Q13562 NKX2-5-201ENST00000329198 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.29■■■□□ 2.6
NEUROD1Q13562 LINC02175-201ENST00000571219 1875 ntTSL 1 (best) BASIC31.29■■■□□ 2.6
NEUROD1Q13562 KCTD13-207ENST00000568000 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.29■■■□□ 2.6
NEUROD1Q13562 TANGO2-202ENST00000398042 2011 ntTSL 2 BASIC31.29■■■□□ 2.6
NEUROD1Q13562 DBX2-201ENST00000332700 2806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.29■■■□□ 2.6
NEUROD1Q13562 PLPP5-203ENST00000424479 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.28■■■□□ 2.6
NEUROD1Q13562 MPST-204ENST00000404393 1329 ntTSL 5 BASIC31.28■■■□□ 2.6
NEUROD1Q13562 CDIPT-210ENST00000570016 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.28■■■□□ 2.6
NEUROD1Q13562 ANKRD44-204ENST00000409919 1622 ntTSL 1 (best) BASIC31.28■■■□□ 2.6
NEUROD1Q13562 SLC41A3-202ENST00000346785 1705 ntTSL 2 BASIC31.28■■■□□ 2.6
NEUROD1Q13562 CCDC28B-201ENST00000373602 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.28■■■□□ 2.6
NEUROD1Q13562 LINC00969-219ENST00000453324 1439 ntTSL 1 (best) BASIC31.28■■■□□ 2.6
NEUROD1Q13562 PRKCQ-AS1-204ENST00000455810 920 ntTSL 2 BASIC31.28■■■□□ 2.6
NEUROD1Q13562 DUSP7-202ENST00000495880 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.28■■■□□ 2.6
NEUROD1Q13562 RAB3A-201ENST00000222256 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.28■■■□□ 2.6
NEUROD1Q13562 BX005040.4-201ENST00000637145 1518 ntBASIC31.28■■■□□ 2.6
NEUROD1Q13562 TMEM165-201ENST00000381334 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.28■■■□□ 2.6
NEUROD1Q13562 SERBP1-202ENST00000370990 1621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.27■■■□□ 2.6
NEUROD1Q13562 EZH2-201ENST00000320356 2639 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC31.27■■■□□ 2.6
NEUROD1Q13562 LBX2-202ENST00000377566 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.27■■■□□ 2.6
NEUROD1Q13562 MFF-208ENST00000409616 1247 ntTSL 5 BASIC31.27■■■□□ 2.6
NEUROD1Q13562 ORAI3-202ENST00000562699 628 ntTSL 2 BASIC31.27■■■□□ 2.6
NEUROD1Q13562 FDFT1-201ENST00000220584 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.27■■■□□ 2.6
NEUROD1Q13562 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.27■■■□□ 2.6
NEUROD1Q13562 ZDHHC7-203ENST00000564466 1488 ntTSL 5 BASIC31.27■■■□□ 2.6
NEUROD1Q13562 GRK3-203ENST00000619906 2873 ntTSL 5 BASIC31.27■■■□□ 2.6
NEUROD1Q13562 RPS6KL1-216ENST00000557413 2425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.26■■■□□ 2.6
NEUROD1Q13562 IRX4-207ENST00000613726 2403 ntTSL 1 (best) BASIC31.26■■■□□ 2.6
NEUROD1Q13562 MFSD6L-201ENST00000329805 2188 ntAPPRIS P1 BASIC31.26■■■□□ 2.6
NEUROD1Q13562 URAD-201ENST00000332715 931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.26■■■□□ 2.59
NEUROD1Q13562 FAM219A-202ENST00000379078 770 ntTSL 3 BASIC31.26■■■□□ 2.59
NEUROD1Q13562 FAM219A-205ENST00000379084 893 ntTSL 5 BASIC31.26■■■□□ 2.59
NEUROD1Q13562 FBXL19-205ENST00000562319 2462 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC31.26■■■□□ 2.59
NEUROD1Q13562 FAM99A-202ENST00000538190 1989 ntBASIC31.26■■■□□ 2.59
NEUROD1Q13562 QPCT-201ENST00000338415 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.26■■■□□ 2.59
NEUROD1Q13562 ADCK2-203ENST00000476491 2092 ntTSL 1 (best) BASIC31.26■■■□□ 2.59
NEUROD1Q13562 AES-207ENST00000586839 942 ntTSL 1 (best) BASIC31.25■■■□□ 2.59
NEUROD1Q13562 AC011446.1-201ENST00000591825 458 ntTSL 2 BASIC31.25■■■□□ 2.59
NEUROD1Q13562 COCH-201ENST00000216361 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.25■■■□□ 2.59
NEUROD1Q13562 TMEM44-204ENST00000392432 2490 ntTSL 1 (best) BASIC31.25■■■□□ 2.59
NEUROD1Q13562 ADORA2A-AS1-203ENST00000427813 2027 ntTSL 1 (best) BASIC31.25■■■□□ 2.59
NEUROD1Q13562 LHFPL3-202ENST00000424859 1852 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC31.25■■■□□ 2.59
NEUROD1Q13562 ZNF511-202ENST00000361518 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.24■■■□□ 2.59
NEUROD1Q13562 AC092667.1-201ENST00000434301 2586 ntBASIC31.24■■■□□ 2.59
NEUROD1Q13562 GGA2-211ENST00000567468 1713 ntTSL 2 BASIC31.24■■■□□ 2.59
NEUROD1Q13562 C11orf96-202ENST00000528572 1834 ntBASIC31.24■■■□□ 2.59
NEUROD1Q13562 ZNF688-201ENST00000223459 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.24■■■□□ 2.59
NEUROD1Q13562 MARK3-206ENST00000440884 2643 ntTSL 1 (best) BASIC31.24■■■□□ 2.59
NEUROD1Q13562 NDUFB2-201ENST00000247866 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.24■■■□□ 2.59
NEUROD1Q13562 GNB2-209ENST00000436220 1479 ntTSL 5 BASIC31.24■■■□□ 2.59
NEUROD1Q13562 CCNG2-204ENST00000502280 1459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.24■■■□□ 2.59
NEUROD1Q13562 KCTD13-202ENST00000561540 1773 ntTSL 1 (best) BASIC31.24■■■□□ 2.59
NEUROD1Q13562 SLC12A5-AS1-202ENST00000535913 1957 ntTSL 2 BASIC31.24■■■□□ 2.59
NEUROD1Q13562 ASRGL1-201ENST00000301776 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.24■■■□□ 2.59
NEUROD1Q13562 CERKL-205ENST00000409440 2425 ntTSL 2 BASIC31.24■■■□□ 2.59
NEUROD1Q13562 RARG-201ENST00000338561 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC31.24■■■□□ 2.59
NEUROD1Q13562 CT47B1-201ENST00000371311 1328 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.24■■■□□ 2.59
NEUROD1Q13562 SUSD1-202ENST00000374263 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC31.23■■■□□ 2.59
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25 ms