Protein–RNA interactions for Protein: Q13536

C1orf61, Protein CROC-4, humanhuman

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Length 156 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C1orf61Q13536 MRPL39-202ENST00000352957 1110 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
C1orf61Q13536 CYB5R4-201ENST00000369679 768 ntTSL 3 BASIC20.81■□□□□ 0.92
C1orf61Q13536 MDK-204ENST00000395569 686 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
C1orf61Q13536 METTL15-202ENST00000403099 795 ntTSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
C1orf61Q13536 ARL5A-202ENST00000428992 747 ntTSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
C1orf61Q13536 TUB-201ENST00000299506 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
C1orf61Q13536 RUSC1-AS1-203ENST00000450199 1636 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
C1orf61Q13536 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
C1orf61Q13536 UCHL5-205ENST00000367454 1815 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
C1orf61Q13536 AP000547.3-201ENST00000592918 1576 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
C1orf61Q13536 ALDH5A1-204ENST00000491546 1699 ntTSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
C1orf61Q13536 CAMKK2-208ENST00000412367 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
C1orf61Q13536 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
C1orf61Q13536 ASCL2-201ENST00000331289 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
C1orf61Q13536 AP004608.1-202ENST00000533390 1863 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
C1orf61Q13536 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
C1orf61Q13536 PLAGL1-207ENST00000417959 1645 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
C1orf61Q13536 HAGH-201ENST00000397353 1257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
C1orf61Q13536 YBEY-204ENST00000397692 433 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
C1orf61Q13536 TSPY6P-201ENST00000448518 926 ntBASIC20.8■□□□□ 0.92
C1orf61Q13536 DHRS4-207ENST00000559632 1003 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
C1orf61Q13536 AP005205.2-201ENST00000577327 491 ntTSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
C1orf61Q13536 CD99-212ENST00000624481 1089 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
C1orf61Q13536 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
C1orf61Q13536 MRAS-202ENST00000423968 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
C1orf61Q13536 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC20.8■□□□□ 0.92
C1orf61Q13536 MMEL1-206ENST00000502556 1943 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
C1orf61Q13536 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
C1orf61Q13536 TMEM198B-205ENST00000487582 1581 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
C1orf61Q13536 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
C1orf61Q13536 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
C1orf61Q13536 AC092490.1-203ENST00000514568 1972 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
C1orf61Q13536 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
C1orf61Q13536 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
C1orf61Q13536 PDK3-201ENST00000379162 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
C1orf61Q13536 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
C1orf61Q13536 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
C1orf61Q13536 TBC1D22A-206ENST00000407381 1949 ntTSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
C1orf61Q13536 JDP2-202ENST00000419727 972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
C1orf61Q13536 SMPD5-201ENST00000528912 1390 ntTSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
C1orf61Q13536 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
C1orf61Q13536 NAA10-208ENST00000464845 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
C1orf61Q13536 FHL3-201ENST00000373016 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
C1orf61Q13536 MIR210HG-201ENST00000500447 1965 ntTSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
C1orf61Q13536 TUSC3-203ENST00000503731 1498 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
C1orf61Q13536 NFS1-201ENST00000306750 738 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
C1orf61Q13536 LY6E-202ENST00000429120 1173 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
C1orf61Q13536 UQCRFS1P1-201ENST00000435169 820 ntBASIC20.78■□□□□ 0.92
C1orf61Q13536 APTR-205ENST00000447009 902 ntTSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
C1orf61Q13536 NCAPD3-204ENST00000526422 1060 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
C1orf61Q13536 BEX2-204ENST00000536889 1077 ntTSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
C1orf61Q13536 NDUFV2-AS1-201ENST00000582375 770 ntTSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
C1orf61Q13536 MFSD3-201ENST00000301327 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
C1orf61Q13536 AC074212.1-201ENST00000559756 1402 ntTSL 3 BASIC20.78■□□□□ 0.92
C1orf61Q13536 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
C1orf61Q13536 SIMC1-202ENST00000341199 2056 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.92
C1orf61Q13536 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
C1orf61Q13536 CFAP99-206ENST00000616117 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
C1orf61Q13536 C19orf81-201ENST00000425202 765 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
C1orf61Q13536 GUSBP6-202ENST00000438529 1198 ntBASIC20.77■□□□□ 0.92
C1orf61Q13536 TERF1P5-201ENST00000477545 1207 ntBASIC20.77■□□□□ 0.92
C1orf61Q13536 OAS3-207ENST00000551007 998 ntTSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.92
C1orf61Q13536 CAMTA1-216ENST00000557126 486 ntTSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.92
C1orf61Q13536 SNAP23-210ENST00000564153 775 ntTSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.92
C1orf61Q13536 AL138781.1-201ENST00000566567 1274 ntBASIC20.77■□□□□ 0.92
C1orf61Q13536 LIMD2-202ENST00000578061 756 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.92
C1orf61Q13536 ELAC1-204ENST00000591429 975 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
C1orf61Q13536 NEURL3-201ENST00000310865 1710 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
C1orf61Q13536 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
C1orf61Q13536 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
C1orf61Q13536 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
C1orf61Q13536 YBX1-201ENST00000321358 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
C1orf61Q13536 WDR86-207ENST00000621812 1542 ntTSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
C1orf61Q13536 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.91
C1orf61Q13536 UHRF1BP1L-202ENST00000356828 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.91
C1orf61Q13536 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC20.77■□□□□ 0.91
C1orf61Q13536 HLA-DPB1-211ENST00000418931 1560 ntAPPRIS P2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
C1orf61Q13536 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
C1orf61Q13536 PNLIPRP2-204ENST00000591655 1456 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
C1orf61Q13536 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
C1orf61Q13536 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
C1orf61Q13536 MANBAL-202ENST00000373606 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
C1orf61Q13536 RNF146-206ENST00000480444 843 ntTSL 2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
C1orf61Q13536 AC105036.2-201ENST00000569468 176 ntBASIC20.76■□□□□ 0.91
C1orf61Q13536 AL136982.7-201ENST00000609363 465 ntTSL 4 BASIC20.76■□□□□ 0.91
C1orf61Q13536 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
C1orf61Q13536 UNC119-202ENST00000335765 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
C1orf61Q13536 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC20.76■□□□□ 0.91
C1orf61Q13536 TPD52L1-203ENST00000368402 1308 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
C1orf61Q13536 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
C1orf61Q13536 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
C1orf61Q13536 CASTOR1-201ENST00000404953 1460 ntTSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
C1orf61Q13536 ZNF784-201ENST00000325351 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
C1orf61Q13536 SLC29A4P1-201ENST00000398760 971 ntBASIC20.75■□□□□ 0.91
C1orf61Q13536 APTR-203ENST00000430801 583 ntTSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
C1orf61Q13536 PACRGL-206ENST00000502374 1034 ntTSL 2 BASIC20.75■□□□□ 0.91
C1orf61Q13536 AL691442.1-201ENST00000505139 1042 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.75■□□□□ 0.91
C1orf61Q13536 AF201337.1-201ENST00000520239 748 ntBASIC20.75■□□□□ 0.91
C1orf61Q13536 IL34-204ENST00000566361 1001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
C1orf61Q13536 AC142086.2-201ENST00000569753 217 ntBASIC20.75■□□□□ 0.91
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.1 ms