Protein–RNA interactions for Protein: Q13509

TUBB3, Tubulin beta-3 chain, humanhuman

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Length 450 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TUBB3Q13509 MDFI-203ENST00000373051 1622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
TUBB3Q13509 ENTPD6-203ENST00000376652 2750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
TUBB3Q13509 LINC01011-201ENST00000445000 2811 ntTSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
TUBB3Q13509 CHN1-203ENST00000409156 1761 ntTSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
TUBB3Q13509 TMEM129-206ENST00000536901 2172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
TUBB3Q13509 NOS3-204ENST00000467517 2377 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
TUBB3Q13509 TMEM61-201ENST00000371268 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
TUBB3Q13509 HOMER3-206ENST00000594439 982 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
TUBB3Q13509 AC092666.2-201ENST00000613287 246 ntBASIC21.17■□□□□ 0.98
TUBB3Q13509 SMIM19-203ENST00000417410 1466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
TUBB3Q13509 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
TUBB3Q13509 C2CD4B-201ENST00000380392 1579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
TUBB3Q13509 CNTD2-202ENST00000430325 1817 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
TUBB3Q13509 POTEC-204ENST00000620346 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
TUBB3Q13509 SETD6-202ENST00000310682 2042 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
TUBB3Q13509 SLC13A3-204ENST00000413164 2008 ntTSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
TUBB3Q13509 TCP11-202ENST00000311875 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
TUBB3Q13509 BX005266.2-202ENST00000446626 2245 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
TUBB3Q13509 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
TUBB3Q13509 E4F1-204ENST00000564139 2493 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
TUBB3Q13509 DNAAF4-201ENST00000321149 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
TUBB3Q13509 FEM1AP4-201ENST00000443167 1987 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
TUBB3Q13509 KLHL17-205ENST00000622660 1950 ntTSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
TUBB3Q13509 UCHL5-205ENST00000367454 1815 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
TUBB3Q13509 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
TUBB3Q13509 PDK3-201ENST00000379162 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
TUBB3Q13509 SPAST-204ENST00000621856 1715 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
TUBB3Q13509 ZPBP2-201ENST00000348931 1543 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
TUBB3Q13509 NDUFB2-201ENST00000247866 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
TUBB3Q13509 RTL8C-201ENST00000257013 1181 ntAPPRIS P1 BASIC21.16■□□□□ 0.98
TUBB3Q13509 ATP6V0E2-204ENST00000464662 513 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
TUBB3Q13509 AC104564.3-201ENST00000582367 638 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
TUBB3Q13509 PRMT5-201ENST00000216350 2271 ntTSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
TUBB3Q13509 ALG9-215ENST00000616540 2069 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
TUBB3Q13509 CMTM4-201ENST00000330687 3414 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
TUBB3Q13509 TMEM161A-202ENST00000450333 1930 ntTSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
TUBB3Q13509 GRTP1-202ENST00000375430 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
TUBB3Q13509 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
TUBB3Q13509 TUB-203ENST00000534099 1759 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
TUBB3Q13509 SERTAD3-201ENST00000322354 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
TUBB3Q13509 RGS20-202ENST00000297313 2104 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
TUBB3Q13509 C1QTNF5-203ENST00000530681 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
TUBB3Q13509 RAB6A-204ENST00000536566 1267 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
TUBB3Q13509 MCRIP1-205ENST00000572645 1038 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
TUBB3Q13509 ZNF48-201ENST00000320159 3234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
TUBB3Q13509 ACAA1-202ENST00000333167 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
TUBB3Q13509 IRX4-207ENST00000613726 2403 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
TUBB3Q13509 AP002761.3-201ENST00000546324 1695 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
TUBB3Q13509 ACADVL-202ENST00000350303 2191 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
TUBB3Q13509 DOC2A-218ENST00000616445 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
TUBB3Q13509 HTATIP2-201ENST00000419348 1477 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.98
TUBB3Q13509 PAQR6-213ENST00000612424 2037 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.98
TUBB3Q13509 DLX2-201ENST00000234198 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
TUBB3Q13509 AL157384.1-201ENST00000445995 2473 ntBASIC21.14■□□□□ 0.98
TUBB3Q13509 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
TUBB3Q13509 PRDX4-202ENST00000379341 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
TUBB3Q13509 NDUFAF8-201ENST00000431388 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
TUBB3Q13509 AC008105.3-201ENST00000586376 844 ntTSL 3 BASIC21.14■□□□□ 0.97
TUBB3Q13509 AC005775.1-201ENST00000592413 850 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
TUBB3Q13509 SCAND1-202ENST00000373991 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
TUBB3Q13509 MSANTD1-204ENST00000510580 2039 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
TUBB3Q13509 MAG-201ENST00000361922 2426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
TUBB3Q13509 PMPCA-203ENST00000399219 1987 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
TUBB3Q13509 GPR162-201ENST00000311268 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
TUBB3Q13509 POMZP3-202ENST00000310842 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
TUBB3Q13509 RUNX3-202ENST00000338888 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
TUBB3Q13509 NSUN2-206ENST00000506139 2619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
TUBB3Q13509 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
TUBB3Q13509 PCMT1-201ENST00000367378 1293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
TUBB3Q13509 CCDC28B-201ENST00000373602 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
TUBB3Q13509 MIR572-201ENST00000384983 95 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
TUBB3Q13509 LINC01167-201ENST00000423232 604 ntTSL 3 BASIC21.13■□□□□ 0.97
TUBB3Q13509 PARL-206ENST00000435888 1098 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
TUBB3Q13509 ZFYVE28-207ENST00000509171 1135 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
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TUBB3Q13509 KCTD13-207ENST00000568000 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
TUBB3Q13509 TRAF4-205ENST00000444415 1456 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
TUBB3Q13509 SNX3-201ENST00000230085 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
TUBB3Q13509 OLA1-204ENST00000409546 2071 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
TUBB3Q13509 DOK3-202ENST00000357198 1729 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
TUBB3Q13509 RBBP7-202ENST00000380084 2036 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
TUBB3Q13509 ZNF584-201ENST00000306910 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
TUBB3Q13509 ANKRD53-204ENST00000457410 1671 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
TUBB3Q13509 PSIP1-201ENST00000380715 1966 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
TUBB3Q13509 FAM102B-202ENST00000405454 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
TUBB3Q13509 NMRAL1-202ENST00000404295 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
TUBB3Q13509 GLT1D1-204ENST00000442111 2995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
TUBB3Q13509 AL358852.1-201ENST00000623174 1268 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
TUBB3Q13509 ARID1B-220ENST00000636930 8246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
TUBB3Q13509 C1orf174-201ENST00000361605 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
TUBB3Q13509 ARHGEF4-202ENST00000355771 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
TUBB3Q13509 STK19-202ENST00000375333 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
TUBB3Q13509 RHBDL3-204ENST00000538145 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
TUBB3Q13509 FAM19A4-201ENST00000295569 2292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
TUBB3Q13509 XBP1-207ENST00000611155 1794 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
TUBB3Q13509 H1FX-201ENST00000333762 1507 ntAPPRIS P1 BASIC21.11■□□□□ 0.97
TUBB3Q13509 TMED4-201ENST00000289577 2203 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
TUBB3Q13509 RASGRP2-207ENST00000377497 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
TUBB3Q13509 HES6-202ENST00000409002 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
TUBB3Q13509 BCAP29-209ENST00000465919 942 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
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