Protein–RNA interactions for Protein: Q13424

SNTA1, Alpha-1-syntrophin, humanhuman

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Length 505 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNTA1Q13424 MIR222HG-202ENST00000602507 1758 ntTSL 5 BASIC19.66■□□□□ 0.74
SNTA1Q13424 PYY-201ENST00000360085 1053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
SNTA1Q13424 ARHGAP24-206ENST00000503995 1273 ntTSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
SNTA1Q13424 AL137779.2-201ENST00000554859 448 ntTSL 2 BASIC19.66■□□□□ 0.74
SNTA1Q13424 CCDC92B-201ENST00000575506 885 ntBASIC19.66■□□□□ 0.74
SNTA1Q13424 AC145207.2-202ENST00000576554 565 ntTSL 5 BASIC19.66■□□□□ 0.74
SNTA1Q13424 SLC35A3-213ENST00000638988 1286 ntTSL 5 BASIC19.66■□□□□ 0.74
SNTA1Q13424 CD6-203ENST00000352009 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
SNTA1Q13424 HOXC13-201ENST00000243056 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
SNTA1Q13424 SDR39U1-208ENST00000554698 1364 ntTSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
SNTA1Q13424 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
SNTA1Q13424 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
SNTA1Q13424 LSM14B-201ENST00000279068 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.65■□□□□ 0.74
SNTA1Q13424 DUSP26-201ENST00000256261 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
SNTA1Q13424 ALDH6A1-201ENST00000350259 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.65■□□□□ 0.74
SNTA1Q13424 MMEL1-206ENST00000502556 1943 ntTSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
SNTA1Q13424 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC19.65■□□□□ 0.74
SNTA1Q13424 PPCS-202ENST00000372560 793 ntTSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
SNTA1Q13424 FAM219A-205ENST00000379084 893 ntTSL 5 BASIC19.65■□□□□ 0.74
SNTA1Q13424 LRRC4B-201ENST00000389201 2958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.65■□□□□ 0.74
SNTA1Q13424 TMEM70-203ENST00000517439 617 ntTSL 2 BASIC19.65■□□□□ 0.74
SNTA1Q13424 LINC01942-201ENST00000521373 513 ntTSL 4 BASIC19.65■□□□□ 0.74
SNTA1Q13424 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
SNTA1Q13424 CT47B1-201ENST00000371311 1328 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.65■□□□□ 0.74
SNTA1Q13424 ZFYVE9-201ENST00000287727 5194 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.65■□□□□ 0.74
SNTA1Q13424 GALK1-201ENST00000225614 1445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.65■□□□□ 0.74
SNTA1Q13424 RARA-201ENST00000254066 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
SNTA1Q13424 RASL12-202ENST00000421977 1523 ntTSL 2 BASIC19.65■□□□□ 0.74
SNTA1Q13424 ABHD12B-201ENST00000337334 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
SNTA1Q13424 NOX4-209ENST00000527626 1774 ntTSL 2 BASIC19.65■□□□□ 0.74
SNTA1Q13424 VDAC1-203ENST00000395047 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
SNTA1Q13424 TMEM5-201ENST00000261234 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.74
SNTA1Q13424 TRABD2A-203ENST00000409520 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.74
SNTA1Q13424 TMEM9B-205ENST00000534025 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.74
SNTA1Q13424 BIN1-209ENST00000393040 2293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.74
SNTA1Q13424 TRAPPC5-204ENST00000596148 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.74
SNTA1Q13424 TSPAN17-207ENST00000508164 2457 ntTSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.74
SNTA1Q13424 NISCH-201ENST00000345716 5238 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
SNTA1Q13424 NDUFS3-201ENST00000263774 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
SNTA1Q13424 LTC4S-202ENST00000401985 486 ntTSL 3 BASIC19.64■□□□□ 0.73
SNTA1Q13424 LGI4-206ENST00000591633 1113 ntTSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
SNTA1Q13424 TALDO1-201ENST00000319006 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
SNTA1Q13424 RAB24-202ENST00000303270 1385 ntTSL 2 BASIC19.64■□□□□ 0.73
SNTA1Q13424 EIF3J-202ENST00000424492 1550 ntTSL 4 BASIC19.64■□□□□ 0.73
SNTA1Q13424 TPM1-204ENST00000334895 1637 ntTSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
SNTA1Q13424 A1BG-201ENST00000263100 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
SNTA1Q13424 CBWD6-213ENST00000613716 1820 ntTSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
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SNTA1Q13424 CFAP99-206ENST00000616117 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.64■□□□□ 0.73
SNTA1Q13424 DUSP9-202ENST00000370167 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
SNTA1Q13424 SLC35A3-210ENST00000638371 2298 ntTSL 5 BASIC19.64■□□□□ 0.73
SNTA1Q13424 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
SNTA1Q13424 ANKRD13D-202ENST00000447274 2881 ntTSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
SNTA1Q13424 SPRN-201ENST00000414069 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
SNTA1Q13424 HOMEZ-201ENST00000357460 4971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
SNTA1Q13424 RANBP10-202ENST00000448631 2232 ntTSL 2 BASIC19.63■□□□□ 0.73
SNTA1Q13424 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
SNTA1Q13424 CECR2-202ENST00000342247 6178 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.63■□□□□ 0.73
SNTA1Q13424 SLC26A5-209ENST00000393735 1947 ntTSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
SNTA1Q13424 WAS-201ENST00000376701 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
SNTA1Q13424 AC242852.2-201ENST00000615738 1807 ntBASIC19.63■□□□□ 0.73
SNTA1Q13424 NEURL3-201ENST00000310865 1710 ntTSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
SNTA1Q13424 SERBP1-202ENST00000370990 1621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
SNTA1Q13424 FMR1-201ENST00000218200 4333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
SNTA1Q13424 AC138649.1-201ENST00000619611 1449 ntTSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
SNTA1Q13424 GLI4-201ENST00000340042 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
SNTA1Q13424 ILKAP-211ENST00000612675 1335 ntTSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
SNTA1Q13424 EIF6-203ENST00000374450 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
SNTA1Q13424 FDX2-202ENST00000393708 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
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SNTA1Q13424 USP25-202ENST00000285681 5216 ntTSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
SNTA1Q13424 AC080038.3-201ENST00000623346 1952 ntBASIC19.63■□□□□ 0.73
SNTA1Q13424 SOX18-201ENST00000340356 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
SNTA1Q13424 UCHL5-205ENST00000367454 1815 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
SNTA1Q13424 CBWD6-201ENST00000377391 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
SNTA1Q13424 FASTK-212ENST00000482571 1764 ntTSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
SNTA1Q13424 RALGPS1-207ENST00000394022 1672 ntTSL 2 BASIC19.62■□□□□ 0.73
SNTA1Q13424 TLE3-216ENST00000559191 1575 ntTSL 5 BASIC19.62■□□□□ 0.73
SNTA1Q13424 HMCES-203ENST00000417226 1490 ntTSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
SNTA1Q13424 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
SNTA1Q13424 CTGF-201ENST00000367976 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
SNTA1Q13424 GZMM-201ENST00000264553 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
SNTA1Q13424 PRR25-201ENST00000301698 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
SNTA1Q13424 KLRG2-202ENST00000393039 1148 ntTSL 5 BASIC19.62■□□□□ 0.73
SNTA1Q13424 PYCARD-AS1-201ENST00000561916 1095 ntTSL 2 BASIC19.62■□□□□ 0.73
SNTA1Q13424 AP003071.3-201ENST00000562506 366 ntTSL 3 BASIC19.62■□□□□ 0.73
SNTA1Q13424 PRKAA1-202ENST00000354209 1918 ntTSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
SNTA1Q13424 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.62■□□□□ 0.73
SNTA1Q13424 AC007375.3-201ENST00000600936 2314 ntBASIC19.62■□□□□ 0.73
SNTA1Q13424 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
SNTA1Q13424 NOXA1-202ENST00000392815 1464 ntTSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
SNTA1Q13424 TUB-201ENST00000299506 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
SNTA1Q13424 KIAA0895-204ENST00000415803 2865 ntTSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
SNTA1Q13424 AC092053.2-201ENST00000640557 1818 ntBASIC19.61■□□□□ 0.73
SNTA1Q13424 KCNJ12-202ENST00000583088 5425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
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