Protein–RNA interactions for Protein: Q13371

PDCL, Phosducin-like protein, humanhuman

Predictions only

Length 301 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDCLQ13371 RAB24-201ENST00000303251 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
PDCLQ13371 KCNQ5-205ENST00000370398 6345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
PDCLQ13371 AKT2-210ENST00000424901 5170 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.23
PDCLQ13371 FAM19A4-201ENST00000295569 2292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.23
PDCLQ13371 IL15RA-206ENST00000397248 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
PDCLQ13371 MIR210HG-201ENST00000500447 1965 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
PDCLQ13371 DUSP5-201ENST00000369583 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
PDCLQ13371 ATP8A1-207ENST00000510289 2238 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
PDCLQ13371 NGEF-203ENST00000409079 1022 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
PDCLQ13371 ZNF696-205ENST00000521537 705 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
PDCLQ13371 TRAF4-217ENST00000618771 543 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
PDCLQ13371 AC105233.4-201ENST00000642045 216 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
PDCLQ13371 ARPC5L-201ENST00000259477 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
PDCLQ13371 AVPR2-203ENST00000370049 1307 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
PDCLQ13371 ST3GAL4-215ENST00000532243 1825 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
PDCLQ13371 ZYG11B-202ENST00000545132 2294 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
PDCLQ13371 B4GALNT1-202ENST00000418555 1861 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
PDCLQ13371 AC025164.2-201ENST00000501008 1898 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
PDCLQ13371 C1orf174-201ENST00000361605 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
PDCLQ13371 AC026310.3-201ENST00000625186 2373 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
PDCLQ13371 RPS6KL1-216ENST00000557413 2425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
PDCLQ13371 RHOF-204ENST00000537265 699 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
PDCLQ13371 RNF166-202ENST00000537718 1525 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
PDCLQ13371 MAPK9-206ENST00000425491 2266 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
PDCLQ13371 SOX21-201ENST00000376945 2778 ntAPPRIS P1 BASIC22.75■■□□□ 1.23
PDCLQ13371 JUNB-201ENST00000302754 1820 ntAPPRIS P1 BASIC22.75■■□□□ 1.23
PDCLQ13371 TPM1-204ENST00000334895 1637 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
PDCLQ13371 TMC6-212ENST00000589553 2389 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
PDCLQ13371 DYRK3-202ENST00000367108 2218 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
PDCLQ13371 RARG-201ENST00000338561 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
PDCLQ13371 GLTPD2-201ENST00000331264 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
PDCLQ13371 PRDX4-202ENST00000379341 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
PDCLQ13371 TUSC3-209ENST00000509380 1266 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
PDCLQ13371 AL121603.2-201ENST00000557373 2117 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
PDCLQ13371 CERKL-205ENST00000409440 2425 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
PDCLQ13371 GPR162-201ENST00000311268 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
PDCLQ13371 GSR-204ENST00000537535 1323 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
PDCLQ13371 UQCR11-203ENST00000591899 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
PDCLQ13371 LHPP-202ENST00000368842 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
PDCLQ13371 FOSL1-201ENST00000312562 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
PDCLQ13371 AKR7A2-201ENST00000235835 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
PDCLQ13371 ZNF48-201ENST00000320159 3234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
PDCLQ13371 UBA5-211ENST00000493720 2058 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
PDCLQ13371 CPNE7-202ENST00000319518 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
PDCLQ13371 LHFPL3-202ENST00000424859 1852 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
PDCLQ13371 TRABD2A-203ENST00000409520 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
PDCLQ13371 FAM99A-202ENST00000538190 1989 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
PDCLQ13371 ZFAS1-206ENST00000450535 1075 ntTSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
PDCLQ13371 MED14OS-201ENST00000456333 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
PDCLQ13371 ITGA9-AS1-210ENST00000457661 738 ntTSL 4 BASIC22.73■■□□□ 1.23
PDCLQ13371 FADS6-204ENST00000614223 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
PDCLQ13371 LINC00454-202ENST00000430978 1327 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
PDCLQ13371 MFSD6L-201ENST00000329805 2188 ntAPPRIS P1 BASIC22.73■■□□□ 1.23
PDCLQ13371 BICDL2-201ENST00000389347 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
PDCLQ13371 PALM-208ENST00000592155 2272 ntTSL 4 BASIC22.73■■□□□ 1.23
PDCLQ13371 RAB3A-201ENST00000222256 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
PDCLQ13371 ESR2-204ENST00000353772 2454 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
PDCLQ13371 TMEM44-204ENST00000392432 2490 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
PDCLQ13371 EPDR1-201ENST00000199448 2599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
PDCLQ13371 AP004607.7-201ENST00000527152 1677 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
PDCLQ13371 GMDS-202ENST00000380815 1752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
PDCLQ13371 ZFAND2B-202ENST00000409097 1765 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
PDCLQ13371 PRKCZ-AS1-201ENST00000333854 1253 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
PDCLQ13371 PAXIP1-202ENST00000404141 3827 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
PDCLQ13371 C17orf74-202ENST00000574034 1287 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
PDCLQ13371 SLC1A5-203ENST00000542575 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
PDCLQ13371 COCH-201ENST00000216361 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
PDCLQ13371 ITGBL1-206ENST00000618057 2368 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
PDCLQ13371 SPNS1-203ENST00000334536 2027 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
PDCLQ13371 TANGO2-202ENST00000398042 2011 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
PDCLQ13371 NSUN2-206ENST00000506139 2619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
PDCLQ13371 LOXL1-201ENST00000261921 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
PDCLQ13371 A1BG-201ENST00000263100 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
PDCLQ13371 SSBP3-216ENST00000610401 3168 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
PDCLQ13371 PTP4A3-203ENST00000520105 1866 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
PDCLQ13371 PARD3-209ENST00000374790 5825 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
PDCLQ13371 ARSB-201ENST00000264914 5327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
PDCLQ13371 POLR2H-204ENST00000438240 994 ntTSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
PDCLQ13371 TSPAN3-202ENST00000346495 1647 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
PDCLQ13371 ASL-203ENST00000380839 1765 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
PDCLQ13371 KCTD13-202ENST00000561540 1773 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
PDCLQ13371 MAGIX-207ENST00000615915 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
PDCLQ13371 SHOX2-203ENST00000441443 3038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
PDCLQ13371 C16orf58-209ENST00000567994 1845 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
PDCLQ13371 LINC02175-201ENST00000571219 1875 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
PDCLQ13371 SPN-202ENST00000395389 1935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
PDCLQ13371 PHACTR3-202ENST00000359926 2252 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
PDCLQ13371 DNAJB5-203ENST00000453597 2589 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
PDCLQ13371 PELI3-202ENST00000349459 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
PDCLQ13371 IRS3P-201ENST00000223076 1006 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
PDCLQ13371 C16orf86-201ENST00000403458 1267 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
PDCLQ13371 MFF-208ENST00000409616 1247 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
PDCLQ13371 AL590128.2-201ENST00000442889 415 ntTSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
PDCLQ13371 CDKN2A-210ENST00000530628 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
PDCLQ13371 SLC39A3-203ENST00000545664 1219 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
PDCLQ13371 AL034346.1-201ENST00000568244 1277 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
PDCLQ13371 MTX2-201ENST00000249442 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
PDCLQ13371 NUTF2-201ENST00000219169 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
PDCLQ13371 SYNGR2-201ENST00000225777 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
PDCLQ13371 DTWD2-203ENST00000510708 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38 ms