Protein–RNA interactions for Protein: Q13319

CDK5R2, Cyclin-dependent kinase 5 activator 2, humanhuman

Predictions only

Length 367 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDK5R2Q13319 ZNF579-201ENST00000325421 2899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
CDK5R2Q13319 FAM46B-201ENST00000289166 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
CDK5R2Q13319 AGAP3-202ENST00000397238 3225 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
CDK5R2Q13319 KCTD1-202ENST00000408011 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
CDK5R2Q13319 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC19.53■□□□□ 0.72
CDK5R2Q13319 AC104564.3-201ENST00000582367 638 ntBASIC19.53■□□□□ 0.72
CDK5R2Q13319 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
CDK5R2Q13319 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
CDK5R2Q13319 AC009041.2-204ENST00000568394 3343 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
CDK5R2Q13319 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC19.53■□□□□ 0.72
CDK5R2Q13319 SLC35A2-210ENST00000616181 1614 ntTSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
CDK5R2Q13319 FAM43B-201ENST00000332947 2572 ntAPPRIS P1 BASIC19.53■□□□□ 0.72
CDK5R2Q13319 RFXAP-201ENST00000255476 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
CDK5R2Q13319 SOX8-201ENST00000293894 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
CDK5R2Q13319 CCDC91-207ENST00000539107 2440 ntTSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
CDK5R2Q13319 CREB3-201ENST00000353704 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
CDK5R2Q13319 METRNL-203ENST00000571814 1900 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
CDK5R2Q13319 LGR4-202ENST00000389858 5163 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
CDK5R2Q13319 ME3-212ENST00000543262 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
CDK5R2Q13319 OXCT2P1-201ENST00000447263 1535 ntBASIC19.52■□□□□ 0.72
CDK5R2Q13319 MRPS2-202ENST00000371785 1640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.52■□□□□ 0.72
CDK5R2Q13319 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
CDK5R2Q13319 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
CDK5R2Q13319 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC19.52■□□□□ 0.72
CDK5R2Q13319 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC19.52■□□□□ 0.72
CDK5R2Q13319 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
CDK5R2Q13319 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC19.52■□□□□ 0.72
CDK5R2Q13319 DMRTB1-201ENST00000371445 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
CDK5R2Q13319 C17orf67-201ENST00000397861 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
CDK5R2Q13319 UBTD2-201ENST00000393792 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
CDK5R2Q13319 DAPK3-201ENST00000301264 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
CDK5R2Q13319 MAF-202ENST00000393350 6384 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
CDK5R2Q13319 ILF3-217ENST00000589998 2622 ntTSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.71
CDK5R2Q13319 PPP3CC-203ENST00000397775 2094 ntTSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.71
CDK5R2Q13319 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
CDK5R2Q13319 CCKBR-206ENST00000532715 1734 ntTSL 3 BASIC19.51■□□□□ 0.71
CDK5R2Q13319 TMEM51-203ENST00000400796 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
CDK5R2Q13319 USP39-203ENST00000409470 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
CDK5R2Q13319 ZNF821-202ENST00000425432 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
CDK5R2Q13319 E4F1-206ENST00000565090 2028 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
CDK5R2Q13319 DYM-203ENST00000442713 2147 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
CDK5R2Q13319 C18orf25-204ENST00000615553 2329 ntTSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
CDK5R2Q13319 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC19.51■□□□□ 0.71
CDK5R2Q13319 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
CDK5R2Q13319 FASTK-212ENST00000482571 1764 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
CDK5R2Q13319 SAMD10-201ENST00000369886 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
CDK5R2Q13319 SIMC1-203ENST00000429602 2694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
CDK5R2Q13319 ESR2-212ENST00000556275 2695 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
CDK5R2Q13319 CDCA4-201ENST00000336219 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
CDK5R2Q13319 AC090360.1-201ENST00000569722 2218 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
CDK5R2Q13319 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
CDK5R2Q13319 E4F1-201ENST00000301727 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
CDK5R2Q13319 NEU4-205ENST00000407683 2273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
CDK5R2Q13319 FAM129C-212ENST00000601861 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
CDK5R2Q13319 VRK2-201ENST00000340157 1888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
CDK5R2Q13319 CITED2-203ENST00000537332 1780 ntTSL 3 BASIC19.5■□□□□ 0.71
CDK5R2Q13319 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
CDK5R2Q13319 NARF-202ENST00000345415 1487 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
CDK5R2Q13319 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
CDK5R2Q13319 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
CDK5R2Q13319 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
CDK5R2Q13319 PCED1A-202ENST00000360652 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
CDK5R2Q13319 IKBKG-212ENST00000617207 1949 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC19.5■□□□□ 0.71
CDK5R2Q13319 DUSP26-201ENST00000256261 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
CDK5R2Q13319 SCRN2-212ENST00000584123 1745 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
CDK5R2Q13319 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
CDK5R2Q13319 STAP2-206ENST00000600324 1508 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
CDK5R2Q13319 FDXR-201ENST00000293195 1875 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
CDK5R2Q13319 NAA35-202ENST00000376040 1797 ntTSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
CDK5R2Q13319 REV1-201ENST00000258428 4751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
CDK5R2Q13319 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
CDK5R2Q13319 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
CDK5R2Q13319 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC19.49■□□□□ 0.71
CDK5R2Q13319 GPRIN2-202ENST00000374317 1966 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.49■□□□□ 0.71
CDK5R2Q13319 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC19.49■□□□□ 0.71
CDK5R2Q13319 SMPDL3A-203ENST00000539041 1755 ntTSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
CDK5R2Q13319 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
CDK5R2Q13319 C10orf91-202ENST00000392630 1846 ntTSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
CDK5R2Q13319 USP21-203ENST00000368002 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
CDK5R2Q13319 FAM3A-202ENST00000359889 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
CDK5R2Q13319 IRF7-205ENST00000397574 1968 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
CDK5R2Q13319 GPSM1-201ENST00000291775 2114 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
CDK5R2Q13319 B4GALNT1-203ENST00000449184 1633 ntTSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
CDK5R2Q13319 RTP5-201ENST00000343216 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
CDK5R2Q13319 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
CDK5R2Q13319 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC19.48■□□□□ 0.71
CDK5R2Q13319 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC19.48■□□□□ 0.71
CDK5R2Q13319 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC19.48■□□□□ 0.71
CDK5R2Q13319 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC19.48■□□□□ 0.71
CDK5R2Q13319 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC19.48■□□□□ 0.71
CDK5R2Q13319 WDSUB1-202ENST00000359774 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
CDK5R2Q13319 APBB3-203ENST00000357560 2218 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
CDK5R2Q13319 IRX3-201ENST00000329734 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
CDK5R2Q13319 FAM66B-202ENST00000606573 2630 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
CDK5R2Q13319 PCMT1-205ENST00000464889 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
CDK5R2Q13319 UAP1-201ENST00000271469 2377 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
CDK5R2Q13319 LAYN-203ENST00000436913 2590 ntTSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
CDK5R2Q13319 NR5A1-202ENST00000373588 3104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
CDK5R2Q13319 ZC3HAV1L-201ENST00000275766 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
CDK5R2Q13319 AL049796.1-201ENST00000565336 1766 ntBASIC19.47■□□□□ 0.71
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.5 ms