Protein–RNA interactions for Protein: Q13219

PAPPA, Pappalysin-1, humanhuman

Predictions only

Length 1,627 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PAPPAQ13219 USP21-202ENST00000368001 2095 ntTSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
PAPPAQ13219 QPCT-201ENST00000338415 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
PAPPAQ13219 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
PAPPAQ13219 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
PAPPAQ13219 KRT7-201ENST00000331817 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
PAPPAQ13219 AL512625.2-201ENST00000417533 625 ntBASIC27.69■■■□□ 2.02
PAPPAQ13219 INTS11-205ENST00000429572 1104 ntTSL 2 BASIC27.69■■■□□ 2.02
PAPPAQ13219 AL359182.2-201ENST00000457720 606 ntTSL 3 BASIC27.69■■■□□ 2.02
PAPPAQ13219 AC021660.2-201ENST00000502999 388 ntTSL 3 BASIC27.69■■■□□ 2.02
PAPPAQ13219 TMEM9B-203ENST00000528117 949 ntTSL 2 BASIC27.69■■■□□ 2.02
PAPPAQ13219 PLEKHJ1-205ENST00000587394 937 ntTSL 2 BASIC27.69■■■□□ 2.02
PAPPAQ13219 AC003102.1-201ENST00000588279 569 ntTSL 4 BASIC27.69■■■□□ 2.02
PAPPAQ13219 CIRBP-246ENST00000628979 1043 ntTSL 2 BASIC27.69■■■□□ 2.02
PAPPAQ13219 TRH-201ENST00000302649 1978 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
PAPPAQ13219 SSUH2-217ENST00000544814 1636 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.68■■■□□ 2.02
PAPPAQ13219 DOC2A-218ENST00000616445 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
PAPPAQ13219 BMP1-204ENST00000397814 836 ntTSL 4 BASIC27.68■■■□□ 2.02
PAPPAQ13219 MMAB-206ENST00000540016 945 ntTSL 3 BASIC27.68■■■□□ 2.02
PAPPAQ13219 ZNF263-205ENST00000574253 1139 ntTSL 2 BASIC27.68■■■□□ 2.02
PAPPAQ13219 TIMM50-213ENST00000599794 786 ntTSL 2 BASIC27.68■■■□□ 2.02
PAPPAQ13219 INO80E-214ENST00000620599 515 ntTSL 2 BASIC27.68■■■□□ 2.02
PAPPAQ13219 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.68■■■□□ 2.02
PAPPAQ13219 NAA10-208ENST00000464845 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
PAPPAQ13219 DUSP9-202ENST00000370167 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
PAPPAQ13219 CCDC74A-201ENST00000295171 1543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
PAPPAQ13219 CCDC74B-201ENST00000310463 1549 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.68■■■□□ 2.02
PAPPAQ13219 AL359710.1-201ENST00000427039 1544 ntTSL 2 BASIC27.68■■■□□ 2.02
PAPPAQ13219 PRR16-202ENST00000407149 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
PAPPAQ13219 AC114730.1-201ENST00000400768 472 ntTSL 4 BASIC27.67■■■□□ 2.02
PAPPAQ13219 BET1L-207ENST00000529614 560 ntTSL 5 BASIC27.67■■■□□ 2.02
PAPPAQ13219 LYRM1-205ENST00000562740 931 ntTSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
PAPPAQ13219 DTYMK-201ENST00000305784 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
PAPPAQ13219 FDX2-202ENST00000393708 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
PAPPAQ13219 DNAJA4-210ENST00000489435 947 ntTSL 3 BASIC27.67■■■□□ 2.02
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PAPPAQ13219 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
PAPPAQ13219 HADH-201ENST00000309522 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
PAPPAQ13219 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
PAPPAQ13219 PITX3-201ENST00000370002 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
PAPPAQ13219 ANKRD65-202ENST00000442470 876 ntTSL 2 BASIC27.66■■■□□ 2.02
PAPPAQ13219 UNC93B5-201ENST00000530315 699 ntBASIC27.66■■■□□ 2.02
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PAPPAQ13219 SLC22A31-201ENST00000562855 1909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.66■■■□□ 2.02
PAPPAQ13219 A1BG-201ENST00000263100 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
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PAPPAQ13219 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
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PAPPAQ13219 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.01
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PAPPAQ13219 THAP7-201ENST00000215742 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
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PAPPAQ13219 SCN1B-203ENST00000595652 814 ntTSL 2 BASIC27.63■■■□□ 2.01
PAPPAQ13219 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
PAPPAQ13219 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
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PAPPAQ13219 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.62■■■□□ 2.01
PAPPAQ13219 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.62■■■□□ 2.01
PAPPAQ13219 FAM207A-201ENST00000291634 927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
PAPPAQ13219 CXADR-204ENST00000400166 1080 ntTSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
PAPPAQ13219 AC009086.2-201ENST00000449759 610 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.62■■■□□ 2.01
PAPPAQ13219 AC008667.2-201ENST00000504413 469 ntTSL 3 BASIC27.62■■■□□ 2.01
PAPPAQ13219 AC053503.5-201ENST00000601508 636 ntBASIC27.62■■■□□ 2.01
PAPPAQ13219 AC069236.1-201ENST00000604339 616 ntBASIC27.62■■■□□ 2.01
PAPPAQ13219 AC073648.6-201ENST00000641589 218 ntBASIC27.62■■■□□ 2.01
PAPPAQ13219 HSDL1-202ENST00000434463 1493 ntTSL 2 BASIC27.62■■■□□ 2.01
PAPPAQ13219 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC27.62■■■□□ 2.01
PAPPAQ13219 TOX2-201ENST00000341197 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.62■■■□□ 2.01
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