Protein–RNA interactions for Protein: Q13127

REST, RE1-silencing transcription factor, humanhuman

Predictions only

Length 1,097 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RESTQ13127 LY6K-201ENST00000292430 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
RESTQ13127 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC24.46■■□□□ 1.51
RESTQ13127 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
RESTQ13127 AL161908.1-203ENST00000425370 506 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
RESTQ13127 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
RESTQ13127 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
RESTQ13127 TMEM125-201ENST00000432792 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
RESTQ13127 PRR20B-201ENST00000377930 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
RESTQ13127 PRR20A-201ENST00000377931 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
RESTQ13127 PRR20E-201ENST00000434815 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
RESTQ13127 PRR20D-201ENST00000452123 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
RESTQ13127 PRR20C-201ENST00000544357 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
RESTQ13127 PRR20C-202ENST00000614894 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
RESTQ13127 LINC01123-202ENST00000419296 2436 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
RESTQ13127 FAM3A-202ENST00000359889 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
RESTQ13127 BID-215ENST00000622694 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
RESTQ13127 PDXDC1-205ENST00000535621 2048 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
RESTQ13127 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
RESTQ13127 KRTAP5-7-201ENST00000398536 1408 ntAPPRIS P1 BASIC24.45■■□□□ 1.51
RESTQ13127 CKMT1B-207ENST00000441322 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
RESTQ13127 GADD45G-202ENST00000375769 977 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
RESTQ13127 LINC02136-201ENST00000567469 530 ntTSL 4 BASIC24.45■■□□□ 1.5
RESTQ13127 AC233992.3-201ENST00000607491 485 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
RESTQ13127 HSD11B1L-218ENST00000581773 1687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
RESTQ13127 COMMD5-207ENST00000543949 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.45■■□□□ 1.5
RESTQ13127 SEC22C-207ENST00000423701 1458 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
RESTQ13127 AC079328.2-202ENST00000560903 1410 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
RESTQ13127 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC24.44■■□□□ 1.5
RESTQ13127 MGAT5B-207ENST00000565675 872 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
RESTQ13127 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
RESTQ13127 HLA-DPB1-211ENST00000418931 1560 ntAPPRIS P2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
RESTQ13127 SNAP23-202ENST00000349777 2480 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
RESTQ13127 SLC1A5-203ENST00000542575 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
RESTQ13127 RELL2-205ENST00000518856 1419 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
RESTQ13127 RABL2B-206ENST00000395598 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
RESTQ13127 FIP1L1-201ENST00000306932 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
RESTQ13127 ALG9-215ENST00000616540 2069 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
RESTQ13127 ABLIM2-205ENST00000428004 2573 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
RESTQ13127 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
RESTQ13127 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
RESTQ13127 AL590128.2-201ENST00000442889 415 ntTSL 3 BASIC24.43■■□□□ 1.5
RESTQ13127 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
RESTQ13127 ASL-203ENST00000380839 1765 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
RESTQ13127 PXK-203ENST00000383715 1756 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
RESTQ13127 AL049796.1-201ENST00000565336 1766 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
RESTQ13127 TEAD2-208ENST00000598810 2191 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
RESTQ13127 NAE1-203ENST00000379463 1909 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
RESTQ13127 VDAC1-203ENST00000395047 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
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RESTQ13127 ANKRD11-217ENST00000613312 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
RESTQ13127 TNIP1-205ENST00000518977 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
RESTQ13127 IL20RA-202ENST00000367746 1244 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
RESTQ13127 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
RESTQ13127 CREB3L2-203ENST00000452463 1105 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
RESTQ13127 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
RESTQ13127 MCRIP1-204ENST00000570507 765 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
RESTQ13127 MCRIP1-208ENST00000575061 618 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
RESTQ13127 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
RESTQ13127 UNC93B1-201ENST00000227471 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
RESTQ13127 LYPD1-202ENST00000397463 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
RESTQ13127 CLN8-213ENST00000637156 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
RESTQ13127 EPHA6-202ENST00000470610 2058 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
RESTQ13127 ESR2-204ENST00000353772 2454 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
RESTQ13127 ARFGAP3-201ENST00000263245 2857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
RESTQ13127 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
RESTQ13127 LOXL1-201ENST00000261921 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
RESTQ13127 FAM3A-208ENST00000419205 1763 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
RESTQ13127 PARN-205ENST00000539279 1557 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
RESTQ13127 CDK5R2-201ENST00000302625 2508 ntAPPRIS P1 BASIC24.41■■□□□ 1.5
RESTQ13127 CELF2-213ENST00000633077 1733 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
RESTQ13127 KLHDC1-201ENST00000359332 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
RESTQ13127 SLC30A5-201ENST00000380860 1317 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
RESTQ13127 EXOG-203ENST00000422077 1317 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
RESTQ13127 CLPB-202ENST00000340729 2071 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
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RESTQ13127 DUSP9-201ENST00000342782 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
RESTQ13127 CBWD3-202ENST00000377342 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
RESTQ13127 GNB1L-202ENST00000403325 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
RESTQ13127 CIZ1-204ENST00000372938 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
RESTQ13127 PLD6-201ENST00000321560 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
RESTQ13127 MAPRE3-203ENST00000405074 1801 ntTSL 3 BASIC24.41■■□□□ 1.5
RESTQ13127 SRM-201ENST00000376957 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
RESTQ13127 AC068580.1-201ENST00000446489 252 ntTSL 3 BASIC24.41■■□□□ 1.5
RESTQ13127 IGHV3-19-201ENST00000521488 291 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
RESTQ13127 HRH3-203ENST00000611492 900 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
RESTQ13127 SERBP1-202ENST00000370990 1621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
RESTQ13127 GFI1-203ENST00000427103 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
RESTQ13127 HFE2-202ENST00000357836 2123 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
RESTQ13127 AC110285.2-201ENST00000571724 1565 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
RESTQ13127 DDIT4-201ENST00000307365 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
RESTQ13127 ABHD12B-201ENST00000337334 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
RESTQ13127 FBXL22-201ENST00000360587 1526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
RESTQ13127 MAP7-206ENST00000611373 2317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
RESTQ13127 AC135279.3-201ENST00000610945 1311 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
RESTQ13127 DNAAF4-201ENST00000321149 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
RESTQ13127 CBWD6-201ENST00000377391 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
RESTQ13127 C12orf76-203ENST00000546651 1755 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
RESTQ13127 LKAAEAR1-201ENST00000302096 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
RESTQ13127 LKAAEAR1-202ENST00000308906 868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
RESTQ13127 CDKN2A-206ENST00000494262 989 ntTSL 3 BASIC24.4■■□□□ 1.5
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