Protein–RNA interactions for Protein: Q12948

FOXC1, Forkhead box protein C1, humanhuman

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Length 553 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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FOXC1Q12948 RAB29-203ENST00000414729 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
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FOXC1Q12948 TCEAL6-202ENST00000372774 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
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FOXC1Q12948 STAP2-206ENST00000600324 1508 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
FOXC1Q12948 TPM1-204ENST00000334895 1637 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
FOXC1Q12948 HYAL3-203ENST00000415204 959 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
FOXC1Q12948 LINC01881-205ENST00000456398 1235 ntTSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
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FOXC1Q12948 AC020913.2-201ENST00000601929 629 ntTSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
FOXC1Q12948 PTCRA-204ENST00000616441 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
FOXC1Q12948 GLT8D2-205ENST00000548660 1835 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
FOXC1Q12948 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
FOXC1Q12948 ZPBP2-201ENST00000348931 1543 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
FOXC1Q12948 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
FOXC1Q12948 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
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