Protein–RNA interactions for Protein: Q12947

FOXF2, Forkhead box protein F2, humanhuman

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Length 444 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXF2Q12947 AC231657.2-201ENST00000624556 255 ntBASIC18.83■□□□□ 0.6
FOXF2Q12947 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
FOXF2Q12947 PLPP5-209ENST00000529359 2185 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
FOXF2Q12947 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
FOXF2Q12947 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.6
FOXF2Q12947 CREB3L3-202ENST00000595923 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
FOXF2Q12947 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
FOXF2Q12947 HEXB-201ENST00000261416 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
FOXF2Q12947 SMPD5-201ENST00000528912 1390 ntTSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
FOXF2Q12947 ST7L-201ENST00000343210 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
FOXF2Q12947 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
FOXF2Q12947 ARL6IP4-204ENST00000392435 1339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
FOXF2Q12947 AC007322.1-201ENST00000426983 750 ntBASIC18.82■□□□□ 0.6
FOXF2Q12947 KRT18P20-201ENST00000548986 1279 ntBASIC18.82■□□□□ 0.6
FOXF2Q12947 AC005697.1-201ENST00000582441 582 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.82■□□□□ 0.6
FOXF2Q12947 MFSD14C-203ENST00000602917 786 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
FOXF2Q12947 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
FOXF2Q12947 PRKAA1-202ENST00000354209 1918 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
FOXF2Q12947 ASCL2-201ENST00000331289 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
FOXF2Q12947 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
FOXF2Q12947 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
FOXF2Q12947 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC18.81■□□□□ 0.6
FOXF2Q12947 ARHGAP27-201ENST00000290470 1376 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
FOXF2Q12947 MIR222HG-202ENST00000602507 1758 ntTSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
FOXF2Q12947 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
FOXF2Q12947 CEACAM4-201ENST00000221954 1205 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
FOXF2Q12947 NDUFS3-207ENST00000529276 558 ntTSL 2 BASIC18.81■□□□□ 0.6
FOXF2Q12947 HERC2P5-204ENST00000569697 1214 ntTSL 2 BASIC18.81■□□□□ 0.6
FOXF2Q12947 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
FOXF2Q12947 F2RL3-202ENST00000599210 613 ntTSL 2 BASIC18.81■□□□□ 0.6
FOXF2Q12947 CEACAM4-203ENST00000600925 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.81■□□□□ 0.6
FOXF2Q12947 FP565260.3-201ENST00000612610 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
FOXF2Q12947 AL161421.1-201ENST00000619666 1101 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
FOXF2Q12947 B4GALNT1-202ENST00000418555 1861 ntTSL 2 BASIC18.81■□□□□ 0.6
FOXF2Q12947 RARG-201ENST00000338561 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
FOXF2Q12947 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
FOXF2Q12947 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC18.8■□□□□ 0.6
FOXF2Q12947 MFSD3-201ENST00000301327 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
FOXF2Q12947 AVPI1-201ENST00000370626 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
FOXF2Q12947 FAM207A-201ENST00000291634 927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
FOXF2Q12947 CYB5R4-201ENST00000369679 768 ntTSL 3 BASIC18.8■□□□□ 0.6
FOXF2Q12947 GPX1P1-201ENST00000388829 606 ntBASIC18.8■□□□□ 0.6
FOXF2Q12947 YBEY-204ENST00000397692 433 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
FOXF2Q12947 ARL6IP4-205ENST00000412505 818 ntTSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
FOXF2Q12947 CNN2P6-201ENST00000439038 900 ntBASIC18.8■□□□□ 0.6
FOXF2Q12947 COL19A1-203ENST00000478620 589 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
FOXF2Q12947 PARD6A-203ENST00000602551 1171 ntTSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
FOXF2Q12947 AC005181.1-201ENST00000604782 1256 ntBASIC18.8■□□□□ 0.6
FOXF2Q12947 AC010536.3-201ENST00000620306 533 ntBASIC18.8■□□□□ 0.6
FOXF2Q12947 SNX21-212ENST00000491381 1607 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
FOXF2Q12947 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
FOXF2Q12947 NOX4-209ENST00000527626 1774 ntTSL 2 BASIC18.8■□□□□ 0.6
FOXF2Q12947 HLA-DPB1-211ENST00000418931 1560 ntAPPRIS P2 BASIC18.8■□□□□ 0.6
FOXF2Q12947 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.8■□□□□ 0.6
FOXF2Q12947 SPINT2-202ENST00000454580 1367 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
FOXF2Q12947 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
FOXF2Q12947 OSR2-210ENST00000523368 1519 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
FOXF2Q12947 MRAS-202ENST00000423968 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
FOXF2Q12947 STX5-201ENST00000294179 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
FOXF2Q12947 AL355802.2-201ENST00000402069 882 ntBASIC18.79■□□□□ 0.6
FOXF2Q12947 INTS11-205ENST00000429572 1104 ntTSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
FOXF2Q12947 EMC9-206ENST00000560403 872 ntTSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
FOXF2Q12947 AP005205.2-201ENST00000577327 491 ntTSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
FOXF2Q12947 PARP1-210ENST00000629232 477 ntTSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
FOXF2Q12947 AP000547.3-201ENST00000592918 1576 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
FOXF2Q12947 ZNF784-201ENST00000325351 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
FOXF2Q12947 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
FOXF2Q12947 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC18.79■□□□□ 0.6
FOXF2Q12947 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
FOXF2Q12947 TUSC3-203ENST00000503731 1498 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
FOXF2Q12947 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
FOXF2Q12947 RNF146-206ENST00000480444 843 ntTSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
FOXF2Q12947 CD99-212ENST00000624481 1089 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
FOXF2Q12947 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
FOXF2Q12947 RHCE-204ENST00000349320 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
FOXF2Q12947 AC092053.2-201ENST00000640557 1818 ntBASIC18.78■□□□□ 0.6
FOXF2Q12947 RBM38-203ENST00000356208 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
FOXF2Q12947 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
FOXF2Q12947 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
FOXF2Q12947 MEIS3-202ENST00000441740 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
FOXF2Q12947 PLAGL1-207ENST00000417959 1645 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
FOXF2Q12947 GPR137-201ENST00000313074 1485 ntTSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
FOXF2Q12947 GPR137-203ENST00000411458 1495 ntTSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
FOXF2Q12947 VIL1-204ENST00000440053 1454 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
FOXF2Q12947 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
FOXF2Q12947 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
FOXF2Q12947 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
FOXF2Q12947 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
FOXF2Q12947 FAHD1-202ENST00000382668 1845 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
FOXF2Q12947 AKT1S1-206ENST00000391834 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
FOXF2Q12947 EIF5A-205ENST00000419711 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
FOXF2Q12947 UQCRFS1P1-201ENST00000435169 820 ntBASIC18.77■□□□□ 0.6
FOXF2Q12947 LINC01117-201ENST00000443670 699 ntTSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
FOXF2Q12947 ARF3-202ENST00000447318 1089 ntTSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
FOXF2Q12947 HAGH-203ENST00000455446 1276 ntTSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
FOXF2Q12947 HMX1-202ENST00000506970 651 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
FOXF2Q12947 AC083906.2-201ENST00000511578 360 ntBASIC18.77■□□□□ 0.6
FOXF2Q12947 BEX2-204ENST00000536889 1077 ntTSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
FOXF2Q12947 CD24-202ENST00000610952 802 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
FOXF2Q12947 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
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